RCCS模拟微重力对人角化细胞代谢组学的影响

RCCS模拟微重力对人角化细胞代谢组学的影响

论文摘要

目的探讨旋转式细胞培养系统(RCCS)模拟微重力对人永生化角质形成细胞系(HaCaT)细胞代谢组学的影响。方法应用RCCS建立模拟微重力细胞培养系统,体外培养HaCaT细胞,随机分为模拟微重力组(SMG组)和正常重力组(NG组),细胞培养1、2、3 d后收集样本,进行LC/MS代谢组学分析。结合正交偏最小二乘法(O-PLS-DA)和两样本独立t检验寻找两组细胞的差异代谢物,将差异代谢物输入KEGG数据库,进行代谢通路的构建与功能分析。结果 LC/MS代谢组学分析结果显示,与NG组比较,SMG组HaCaT细胞在RCCS模拟微重力环境中培养1 d后共有74种差异代谢物,其中16种表达上调,58种表达下调;2 d后共有89种差异代谢物,其中15种表达上调,74种表达下调;3 d后共有100种差异代谢物,其中23种表达上调,77种表达下调;以表达有统计学差异(VIP>1且P<0.05)的49种代谢物作为目标代谢标记物,其中鞘氨醇、谷氨酸、二十二碳五烯酸下调,脱水山梨糖醇等物质表达上调。KEGG分析显示,其涉及的代谢通路有氨基酸代谢、脂质代谢、细胞增殖和凋亡、物质转运、分解代谢、信号转导等。结论 RCCS模拟微重力环境可对角化细胞代谢产生明显影响,主要涉及鞘脂类、谷氨酸等代谢产物及相关信号通路。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 主要材料及仪器
  •   1.2 细胞培养及分组
  •   1.3 RCCS微载体培养
  •   1.4 样本采集
  •   1.5 样品处理
  •   1.6 U H P LC-LTQ-M S分析条件
  •   1.7 数据分析
  •   1.8 统计学处理
  • 2 结果
  •   2.1 主成分分析
  •   2.2 偏最小二乘法判别分析
  •   2.3 差异代谢物的筛选与鉴定
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李鳌,姜楠,吴莹莹,闫洪锋,孙培鸣,孙宏伟,徐冰心,周金莲,崔彦

    关键词: 模拟失重,旋转式细胞培养系统,细胞,代谢组学,创伤与修复

    来源: 解放军医学杂志 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,工程科技Ⅱ辑

    专业: 航空航天科学与工程,特种医学,军事医学与卫生

    单位: 安徽医科大学战略支援部队特色医疗中心(原解放军第306医院临床学院普通外科),战略支援部队特色医疗中心普通外科

    基金: 全军试验技术研究计划重点项目(SYFD1500128)~~

    分类号: R852.22

    页码: 735-740

    总页数: 6

    文件大小: 1280K

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