导读:本文包含了结构过渡态论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:结构,构型,动力学,胃蛋白酶,胰蛋白酶,原理,稳态。
结构过渡态论文文献综述
冯丽霞,王越奎[1]（2017）在《光致手性构型反转中特有的主过渡态结构》一文中研究指出研究金属中心手性构型Δ/Λ反转机理对于实现单一手性配合物的合成具有重要意义。目前已知基态的构型反转主要有菱形扭曲(Fig.1a)、叁棱柱扭曲(Fig.1c)和断键模式[1]叁种,其中后者常具有较高能垒而很少见。而光照下激发态的反转机理则比较复杂,尚未见报道。为此本文用密度泛函理论方法,对一系列钌-二亚胺类配合物[2]的光致手性反转机理进行了研究。结果表明,与基态时高能垒的单步反转不同,第一叁重激发态(T1)势能面上的光致反转为多步反应:除速控步骤Δ-~3MC→Λ-~3MC外,还包括Δ-~3MLCT→Δ-~3MC与Λ-~3MC→Λ-~3MLCT两个辅助过程。其中,因T1态电子排布的影响,所有体系的主过渡态均发生了自旋收缩现象,导致两个配位键(Fig. 1b中Ru.O1、Ru.N4键;1d中Ru.O1、Ru.N1键)几近断裂,呈现出扁平的四方金字塔构型(Fig.1b、1d中四方锥RuN2N3N5N1与RuN2N3N5N4)。这一几何是构型扭曲与断键机制的复合:其中T1势能面上配位键的断裂并未导致过渡态能量升高,是其区别于基态翻转机制的本质所在。且其断键模式使Ru原子裸露在外,也有助于理解很多光化学反应,特别是光催化机理。(本文来源于《第十叁届全国量子化学会议论文集——第一分会：电子结构理论与计算方法》期刊2017-06-08）
黄姗芬[2]（2017）在《基于过渡态理论的超声诱导蛋白酶特性及结构变化研究》一文中研究指出酶受外界刺激会出现一种过渡态,中间体是过渡态中相对稳定的一种结构。这种结构相对于天然态的结构更为松散,而相对于完全变性的结构更为有序,是一种较为稳定的高活性状态。酶解是在食品工业中一个重要的生物化学反应,超声处理是提高酶活的重要措施之一。本文以胰蛋白酶和胃蛋白酶为研究对象,以尿素诱导变性为对照,利用过渡态理论,研究了聚能式、狭缝发散式、平板发散式等不同工作模式超声对蛋白酶诱导激活和中间体形成的影响,研究了酶活变化与折迭中间体的相关关系,分析了蛋白酶中间体的热稳定性、二级结构及热力学参数,以期深入揭示蛋白酶活性变化的机理。主要研究工作及结果如下:(1)研究了不同工作模式超声对胰蛋白酶结构及其活性的影响。胰蛋白酶经过0-8 M的尿素诱导24 h、0-7×103 W/L的聚能式超声诱导5 min、20-180 W/L的狭缝发散式超声诱导20和30 min的过程中,各出现1个折迭的中间体,为1T、2T、5T和6T,其酶活比对照分别提高30.3%、21.6%、31.8%和31.2%。胰蛋白酶经过聚能式超声诱导7.5 min的过程中出现2个中间体,为3T和4T,其酶活前者低于对照14.1%、后者提升21.6%。胰蛋白酶经过狭缝发散式和聚能式超声各10 min以及平板发散式超声10、20和30 min,均不能诱导出中间体。因此,狭缝式超声诱导20 min,胰蛋白酶中间体5T酶活性最高。(2)研究了狭缝发散式超声频率及其组合对胰蛋白酶结构及其活性的影响。胰蛋白酶在28、33和40 kHz下经过20-180 W/L的狭缝发散式单频超声诱导20 min的过程中,各出现1个折迭的中间体,为5T、7T和8T,其酶活分别提高了31.8%、42.4%和32.0%,筛选出最佳单频频率为33 kHz。以33kHz为基础,在频率组合33/28和33/40 kHz下经过20-180 W/L的狭缝发散式双频超声诱导20 min的过程中,各出现1个高酶活折迭的中间体,为9T和10T,酶活分别提高44.5%和28.1%;在20、23、25 kHz单频以及在33/20和33/25 kHz双频超声均不能诱导出中间体。所以,在33/28 kHz下诱导的胰蛋白酶中间体9T酶活性最高。(3)对上述诱导的5个胰蛋白酶中间体进行了热稳定性、二级结构及热力学参数分析。5个中间体酶活性、残余酶活以及酶活残留率与对照相比显着提高,其中中间体9T酶活最高,但热稳定性最低,中间体8T的热稳定性最好;除中间体7T外,其余胰蛋白酶中间体的二级结构与对照相比有显着差异;热力学参数研究表明,上述所有中间体的反应速率显着增加,反应吸收的热量显着减少,结构的混乱程度显着减小,反应难易程度与对照相比无显着差异,其中中间体9T的热力学参数变化最显着。(4)研究了不同工作模式超声对胃蛋白酶结构及其活性的影响。胃蛋白酶经过0-8 M尿素诱导24h、20-180 W/L的狭缝发散式超声诱导20和30 min的过程中,各出现2个折迭的中间体,分别为1p、2p、5p、6p、7p和8p。尿素诱导的2个中间体活性前者提高21.0%、后者降低15.3%,狭缝发散式超声诱导的4个中间体酶活分别提高了41.7%、27.1%、22.3%和17.2%。经过0-7×103 W/L的聚能式超声诱导5和7.5 min的过程中,各出现1个折迭中间体,分别为3p和4p,其酶活分别提高27.8%和20.9%。狭缝发散式和聚能式超声各10 min以及平板发散式超声10、20、30 min均不能诱导出胃蛋白酶形成中间体。狭缝式超声诱导20 min的胃蛋白酶中间体5p酶活性最高。(5)研究了狭缝发散式超声频率及其组合对胃蛋白酶结构及其活性的影响。胃蛋白酶在单频25和33 kHz下经过20-180 W/L的狭缝发散式单频超声处理20min的过程中,各出现1个折迭的中间体,为9p和10p,酶活前者提高27.6%、后者降低12.7%;胃蛋白酶在单频28 kHz下诱导过程中出现了2个折迭中间体,为5p和6p,酶活分别提高41.3%和27.1%,因此28 kHz为最佳单频诱导频率。以28kHz为基础,频率组合28/25kHz、28/33 kHz分别出现2个折迭中间体11p、12p、13p和14p,其酶活分别43.1%、33.8%、62.7%和32.3%。20、23、40 kHz单频以及28/20、28/23和28/40 kHz双频超声均不能诱导出中间体。28/33 kHz双频狭缝发散式超声诱导的胃蛋白酶中间体13p酶活性最高。(6)对上述诱导的8个胃蛋白酶中间体进行了热稳定性、二级结构及热力学参数分析。胃蛋白酶除中间体10p外的其余中间体的酶活性、残余酶活与对照相比显着提高,其中中间体13p酶活最高,热稳定性第叁高,中间体11p的热稳定性最好。除中间体10p、12p和14p的二级结构有显着差异,其余胃蛋白酶中间体与对照相比无显着差异。热力学参数表明上述所有中间体的反应速率显着增加,反应吸收的热量显着减少,结构的混乱程度显着减小,反应难易程度与对照相比无显着差异,其中中间体13p的热力学参数变化最显着。(本文来源于《江苏大学》期刊2017-06-01）
殷克涛[3]（2016）在《变组分和过渡态结构预测方法及其应用》一文中研究指出物质的化学组分作为影响其物性的一个重要变量,为寻找新型功能材料提供了一个崭新的维度,而确定不同组分物质的微观结构是开展新型材料设计要解决的一个关键问题。另外,目前的结构预测方法往往只能给出热力学上稳定的静态结构(基态和亚稳结构),无法为实验提供合成路径信息,因此发展可全面反映相变过程的反应路径全局搜索方法,是实现新型功能材料设计要解决的另一个关键问题。针对以上两个关键的科学问题,我们进行了系统的研究获得了如下创新性的研究成果：1.基于课题组前期发展的卡利普索(CALYPSO)结构预测方法,发展了CALYPSO变化学组分结构预测新方法。我们的方法通过自动构建能量和组分凸形图,并利用粒子群优化算法结合不同组分结构形成焓(能)的计算,实现对能量和组分凸形图进行全局优化,从而确定材料稳定的化学配比和相应的结构。后续利用二元Lennard-Jones经验势模型和LiH等合金体系对该方法的效率进行了测试,测试结果证明该方法具有较高的效率和可靠性。2.我们利用所发展的CALYPSO变化学组分结构预测方法开展了N-H体系的结构搜索,提出两种新型的功能材料一高能量密度材料N2H和高效储氢材料NH7。在富氮条件下,首次预言了由准一维无限长扶手椅型氮链和镶嵌在氮链上的氢原子组成N2H的高压聚合相。理论计算表明其合成压力仅为33 GPa,并且其能量密度和高能炸药材料TNT相当,约为-4.40 KJ/g。高能量密度和低合成压力表明N2H是一种潜在的高能量密度材料。在富氢区域,我们预言一种新型氮氢化合物NH7。其氢的含量高达19wt.%,是目前已知的氢含量最高的氮氢化合物。理论计算的合成压力仅为31GPa。高储氢效率和低合成压力使NH7成为一种潜在的储氢材料。3.固固相变路径的确定一直是物理、化学和材料研究领域的重要课题。本文首次提出通过原子对应矩阵来表征反应路径,并利用矩阵粒子群优化算法对不同原子对应方式进行演化,结合新提出的过渡态优化算法,发展了全新的相变路径全局搜索方法。我们利用该方法对硅的不同相变路径进行探索,从理论上揭示了硅在不同温度下相变序列变化的物理根源：(本文来源于《吉林大学》期刊2016-06-01）
彭平,李贵发[4]（2009）在《一种过渡态搜索方法及其在Al_(12)C团簇结构形态预测中的应用》一文中研究指出通过对生成物的结构微调来设定反应物、基于CI-NEB方法确定的最低能量路径MEP、在Dmol3软件中应用同步转变与二次同步转变LST/QST程序进行过渡态TS搜索,一种新的高稳定性的Al_(12)C团簇的结构形态Cs-Al_(12)C被发现。通过与Al_(12)C团簇基态二十面体Ih-Al_(12)C构型的能态与电子结构的比较,以及这两种形态结构被合成难易程度的分析,预测Cs-Al_(12)C更容易通过Al晶体在甲烷气氛下被气化合成。相对于Ih-Al_(12)C构型,Cs-Al_(12)C结构形态的计算结果与Al_(12)C光电子吸收谱等实验分析数据的符合程度更好。(本文来源于《第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集》期刊2009-10-23）
戴东旭,杨学明[5]（2009）在《化学反应过渡态的结构和动力学》一文中研究指出化学反应过渡态决定了包括反应速率和微观反应动力学在内的化学反应的基本特性,而无论是从理论还是实验上研究和观测化学反应过渡态都是极具挑战性的课题.近年来,我国科学家们利用交叉分子束-里德堡氢原子飞行时间谱仪,结合高精度的量子动力学计算,对H+H2和F+H2这两个教科书式的典型反应体系进行了全量子态分辨的反应动力学研究,从中得出了关于这两个反应体系的过渡态的结构和动力学性质的结论性的研究成果.(本文来源于《中国科学(B辑:化学)》期刊2009年10期）
王成云[6]（2005）在《配合物氧化还原反应的过渡态结构》一文中研究指出20世纪80年代开始,人们对过渡态研究产生极大兴趣,并确定过渡态研究将是分子反应动力学的最后一个前沿课题．作者对配合物氧气还原反应的过渡态结构、过渡态轨道及与反应速率的关系进行了研究。在溶液中当氧化剂和还原剂两种配合物靠近到一定程度,能否发生氧化还原反(本文来源于《第九届全国化学动力学会议论文摘要集》期刊2005-09-01）
刘跃,王骐,刘颖[7]（2003）在《几种过渡态结构的有效优化方法》一文中研究指出通过双桥反应机理、电环合反应和催化反应叁个不同类型的过渡态优化,说明当标准方法难以给出结果时,对物理问题本身的分析有助于给出过渡态优化的线索.第一个例子根据化学问题给出限制条件,通过平衡几何构型优化方法优化得到过渡态;第二个例子是在使用标准过渡态优化方法失败后,根据物理问题从反应途径上用平衡几何构型优化方法选择过渡态优化的初始结构;第叁个例子通过Gaussian98程序中的标准方法QST2直接得到过渡态.(本文来源于《分子科学学报》期刊2003年03期）
刘盛权,张俊英,刘明毅,JeanLeGall,张文章[8]（2002）在《亚硝酸还原酶的突变体1257E:酶促反应过渡态之一的类似物的晶体结构》一文中研究指出亚硝酸还原酶(nitrite reductase,简称NIR)是陆地上氮元素循环过程中的一种酶,能将NO_2~-还原成NO。有两类NIR,分别含有血红素cd_1和Cu作为辅基(相应简称为cd_1NIR及CuNIR)。结构研究表明:来源于Achromobacter cycloclastes的CuNIR(简称为AcNIR)的功能单位是叁聚体,共含有六个铜原子。铜原子又分为两类:类型Ⅰ的铜(本文来源于《第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集》期刊2002-05-01）
李杨,王钧,王玉荣,顾明初,杨锦宗[9]（2000）在《对称型双端过渡态丁二烯/苯乙烯嵌段共聚物的研制——Ⅱ.结构研究》一文中研究指出以双锂为引发剂、环己烷为溶剂,合成了对称型双端过渡态丁二烯/苯乙烯(B/S)嵌段共聚物S-(S/B)-B-(B/S)-S,并对其结构进行了研究。结果表明:随着S/B的增大、极性添加剂(2G)/Li的增加,嵌段共聚物中苯乙烯含量增加;嵌段共聚物具有微观相分离结构,分子量分布约为1.2。(本文来源于《合成树脂及塑料》期刊2000年04期）
齐茂展,王立,倪学梓[10]（1997）在《基于耗散结构理论的鼓泡流化床过渡态分析》一文中研究指出把鼓泡流化床看成是一个与环境有能质交换和能量耗散的热力学系统，用非平衡态热力学和耗散结构理论研究了流化床由均匀到不均匀流化状态的过渡。根据流化床的质量、动量、能量方程和Ｇｉｂｂｓ公式得出了系统的熵平衡方程和熵产生方程，基于Ｐｒｉｇｏｇｉｎｅ的耗散结构理论建立了鼓泡流化床的过渡态判据，提出了临界鼓泡速度计算方法。应用该判据对流化床中产生气泡的几个主要影响因素进行了分析，临界鼓泡速度与临界流化速度之比与颗粒直径的立方和气－固密度差成反比，与流体粘度的平方成正比，计算表明理论结果与有关文献的实验值吻合较好(本文来源于《清华大学学报(自然科学版)》期刊1997年02期）
结构过渡态论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
酶受外界刺激会出现一种过渡态,中间体是过渡态中相对稳定的一种结构。这种结构相对于天然态的结构更为松散,而相对于完全变性的结构更为有序,是一种较为稳定的高活性状态。酶解是在食品工业中一个重要的生物化学反应,超声处理是提高酶活的重要措施之一。本文以胰蛋白酶和胃蛋白酶为研究对象,以尿素诱导变性为对照,利用过渡态理论,研究了聚能式、狭缝发散式、平板发散式等不同工作模式超声对蛋白酶诱导激活和中间体形成的影响,研究了酶活变化与折迭中间体的相关关系,分析了蛋白酶中间体的热稳定性、二级结构及热力学参数,以期深入揭示蛋白酶活性变化的机理。主要研究工作及结果如下:(1)研究了不同工作模式超声对胰蛋白酶结构及其活性的影响。胰蛋白酶经过0-8 M的尿素诱导24 h、0-7×103 W/L的聚能式超声诱导5 min、20-180 W/L的狭缝发散式超声诱导20和30 min的过程中,各出现1个折迭的中间体,为1T、2T、5T和6T,其酶活比对照分别提高30.3%、21.6%、31.8%和31.2%。胰蛋白酶经过聚能式超声诱导7.5 min的过程中出现2个中间体,为3T和4T,其酶活前者低于对照14.1%、后者提升21.6%。胰蛋白酶经过狭缝发散式和聚能式超声各10 min以及平板发散式超声10、20和30 min,均不能诱导出中间体。因此,狭缝式超声诱导20 min,胰蛋白酶中间体5T酶活性最高。(2)研究了狭缝发散式超声频率及其组合对胰蛋白酶结构及其活性的影响。胰蛋白酶在28、33和40 kHz下经过20-180 W/L的狭缝发散式单频超声诱导20 min的过程中,各出现1个折迭的中间体,为5T、7T和8T,其酶活分别提高了31.8%、42.4%和32.0%,筛选出最佳单频频率为33 kHz。以33kHz为基础,在频率组合33/28和33/40 kHz下经过20-180 W/L的狭缝发散式双频超声诱导20 min的过程中,各出现1个高酶活折迭的中间体,为9T和10T,酶活分别提高44.5%和28.1%;在20、23、25 kHz单频以及在33/20和33/25 kHz双频超声均不能诱导出中间体。所以,在33/28 kHz下诱导的胰蛋白酶中间体9T酶活性最高。(3)对上述诱导的5个胰蛋白酶中间体进行了热稳定性、二级结构及热力学参数分析。5个中间体酶活性、残余酶活以及酶活残留率与对照相比显着提高,其中中间体9T酶活最高,但热稳定性最低,中间体8T的热稳定性最好;除中间体7T外,其余胰蛋白酶中间体的二级结构与对照相比有显着差异;热力学参数研究表明,上述所有中间体的反应速率显着增加,反应吸收的热量显着减少,结构的混乱程度显着减小,反应难易程度与对照相比无显着差异,其中中间体9T的热力学参数变化最显着。(4)研究了不同工作模式超声对胃蛋白酶结构及其活性的影响。胃蛋白酶经过0-8 M尿素诱导24h、20-180 W/L的狭缝发散式超声诱导20和30 min的过程中,各出现2个折迭的中间体,分别为1p、2p、5p、6p、7p和8p。尿素诱导的2个中间体活性前者提高21.0%、后者降低15.3%,狭缝发散式超声诱导的4个中间体酶活分别提高了41.7%、27.1%、22.3%和17.2%。经过0-7×103 W/L的聚能式超声诱导5和7.5 min的过程中,各出现1个折迭中间体,分别为3p和4p,其酶活分别提高27.8%和20.9%。狭缝发散式和聚能式超声各10 min以及平板发散式超声10、20、30 min均不能诱导出胃蛋白酶形成中间体。狭缝式超声诱导20 min的胃蛋白酶中间体5p酶活性最高。(5)研究了狭缝发散式超声频率及其组合对胃蛋白酶结构及其活性的影响。胃蛋白酶在单频25和33 kHz下经过20-180 W/L的狭缝发散式单频超声处理20min的过程中,各出现1个折迭的中间体,为9p和10p,酶活前者提高27.6%、后者降低12.7%;胃蛋白酶在单频28 kHz下诱导过程中出现了2个折迭中间体,为5p和6p,酶活分别提高41.3%和27.1%,因此28 kHz为最佳单频诱导频率。以28kHz为基础,频率组合28/25kHz、28/33 kHz分别出现2个折迭中间体11p、12p、13p和14p,其酶活分别43.1%、33.8%、62.7%和32.3%。20、23、40 kHz单频以及28/20、28/23和28/40 kHz双频超声均不能诱导出中间体。28/33 kHz双频狭缝发散式超声诱导的胃蛋白酶中间体13p酶活性最高。(6)对上述诱导的8个胃蛋白酶中间体进行了热稳定性、二级结构及热力学参数分析。胃蛋白酶除中间体10p外的其余中间体的酶活性、残余酶活与对照相比显着提高,其中中间体13p酶活最高,热稳定性第叁高,中间体11p的热稳定性最好。除中间体10p、12p和14p的二级结构有显着差异,其余胃蛋白酶中间体与对照相比无显着差异。热力学参数表明上述所有中间体的反应速率显着增加,反应吸收的热量显着减少,结构的混乱程度显着减小,反应难易程度与对照相比无显着差异,其中中间体13p的热力学参数变化最显着。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
结构过渡态论文参考文献
[1].冯丽霞,王越奎.光致手性构型反转中特有的主过渡态结构[C].第十叁届全国量子化学会议论文集——第一分会：电子结构理论与计算方法.2017
[2].黄姗芬.基于过渡态理论的超声诱导蛋白酶特性及结构变化研究[D].江苏大学.2017
[3].殷克涛.变组分和过渡态结构预测方法及其应用[D].吉林大学.2016
[4].彭平,李贵发.一种过渡态搜索方法及其在Al_(12)C团簇结构形态预测中的应用[C].第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集.2009
[5].戴东旭,杨学明.化学反应过渡态的结构和动力学[J].中国科学(B辑:化学).2009
[6].王成云.配合物氧化还原反应的过渡态结构[C].第九届全国化学动力学会议论文摘要集.2005
[7].刘跃,王骐,刘颖.几种过渡态结构的有效优化方法[J].分子科学学报.2003
[8].刘盛权,张俊英,刘明毅,JeanLeGall,张文章.亚硝酸还原酶的突变体1257E:酶促反应过渡态之一的类似物的晶体结构[C].第九次全国生物物理大会学术会议论文摘要集.2002
[9].李杨,王钧,王玉荣,顾明初,杨锦宗.对称型双端过渡态丁二烯/苯乙烯嵌段共聚物的研制——Ⅱ.结构研究[J].合成树脂及塑料.2000
[10].齐茂展,王立,倪学梓.基于耗散结构理论的鼓泡流化床过渡态分析[J].清华大学学报(自然科学版).1997
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