恩施地区酸萝卜中细菌多样性研究

恩施地区酸萝卜中细菌多样性研究

论文摘要

采用Miseq高通量测序技术、变性梯度凝胶电泳技术以及传统微生物学手段对恩施地区酸萝卜中细菌和乳酸菌多样性进行了解析。结果发现酸萝卜中的优势菌主要为隶属于Firmicutes的Lactobacillus和Pediococcus构成,其平均相对含量分别为55.76%和34.50%。经DGGE分析发现,酸萝卜中乳酸菌主要包括L. kefiri、P. tuberculata、L. senmaizukei、L. acetotolerans、L. acetotolerans和L. kefiri。从3个样品中共分离出14株乳酸菌,其中L.plantarum subsp. plantarum 5株,E.faecium、L.paracasei subsp. paracasei、L.fermentum和L.alimentarius各2株以及L.brevis 1株。由此可见,Lactobacillus是恩施酸萝卜中的优势细菌且多样性较高。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 检测与分析方法
  •     1.3.1 宏基因组DNA提取及检测
  •     1.3.2 细菌Miseq高通量测序分析
  •     1.3.3 乳酸菌DGGE指纹图谱分析
  •     1.3.4 乳酸菌菌株的分离鉴定
  •   1.4 数据处理
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 细菌Miseq高通量测序分析
  •   2.2 细菌及乳酸菌DGGE指纹图谱分析
  •   2.3 乳酸菌分离纯化及鉴定
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 颜娜,王玉荣,廖华,赵慧君,张振东,郭壮

    关键词: 酸萝卜,细菌,乳酸菌,高通量测序,变性梯度凝胶电泳

    来源: 中国食品添加剂 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 湖北文理学院食品科学技术学院鄂西北传统发酵食品研究所,恩施市农业局

    基金: 湖北省自然科学基金计划项目(2016CFB527),湖北文理学院食品新型工业化学科群建设项目(2018)

    分类号: TS255.54;TS201.3

    页码: 69-76

    总页数: 8

    文件大小: 2098K

    下载量: 122

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