玉米大斑病菌StH-PDE和StL-PDE启动子预测及表达模式分析

论文摘要

本研究利用生物信息学手段分析了玉米大斑病菌高亲和力cAMP磷酸二酯酶（High-affinity cAMP phosphodiesterase,H-PDE）和低亲和力cAMP磷酸二酯酶（Low-affinity cAMP phosphodiesterase,L-PDE）氨基酸序列同源性,发现StH-PDE与狂犬壳二胞菌（Ascochyta rabiei）、小麦黄斑叶枯病菌（Pyrenophora triticirepentis）、链格孢（Alternariaalternata）中同源蛋白的氨基酸序列相似性分别为69.21%、84.21%、85.94%,StL-PDE与狂犬壳二胞菌、壳球孢菌（Macrophominaphaseolina）、小麦黄斑叶枯病菌中同源蛋白的氨基酸序列相似性分别为57.90%,60.14%,71.38%;启动子预测发现,StH-PDE和StL-PDE启动子区存在SP1、AP1、p53、STAT5、AP-2、ATF/CREB以及GATA等转录因子结合位点。进一步利用实时荧光定量PCR技术检测其在不同碳源、氮源环境中的表达情况,结果表明,以果糖、乳糖、山梨醇和淀粉作为碳源对StH-PDE和StL-PDE的表达具有诱导作用,其中以山梨醇对StH-PDE表达影响最强,铵态氮和尿素作为氮源对StH-PDE和StL-PDE的表达有明显的诱导作用,而硝态氮诱导作用不明显。所以,明确PDE对碳氮源的响应为深入研究其基因功能奠定理论基础。

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类型: 期刊论文

作者: 李天聪,王擎,王建霞,张燕,申珅

关键词: 玉米大斑病菌,启动子,表达模式

来源: 河北农业大学学报 2019年05期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 河北农业大学生命科学学院/河北省植物生理与分子病理学重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31601598),河北省自然科学基金项目(C2018204120),河北省高等学校青年拔尖人才科学技术研究项目(BJ2014349Y)

分类号: Q943.2

DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2019.0094

页码: 15-20

总页数: 6

文件大小: 1348K

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标签：玉米大斑病菌论文;  启动子论文;  表达模式论文;