自然发酵腐乳中细菌多样性评价

自然发酵腐乳中细菌多样性评价

论文摘要

以腐乳为研究对象,利用变性梯度凝胶电泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技术与Miseq高通量测序技术相结合的手段解析及评价细菌多样性,同时利用传统纯培养的方法对乳酸菌进行分离、纯化与鉴定。结果显示:腐乳中主要微生物为变形菌门(Proteobacteria,80.45%),其中绿脓杆菌属、不动杆菌属、鞘氨醇杆菌属、布丘氏菌属和草螺菌属细菌为优势细菌属。同时通过PCR-DGGE和纯培养发现腐乳中鉴定出7株乳酸菌,其中2株为戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus),1株为乳酸片球菌(Pediococcus acidilactici),4株为屎肠球菌(Enterococcus faecium)。由此可知腐乳中蕴含着丰富的微生物资源,同时屎肠球菌(Enterococcus faecium)为优势乳酸菌。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料与试剂
  •   1.2 仪器与设备
  •   1.3 试验方法
  •     1.3.1 样品宏基因组提取与检测
  •     1.3.2 PCR-DGGE
  •     1.3.4 样品细菌16S rRNA PCR扩增及Miseq高通量测序
  •     1.3.5 序列拼接及质量控制
  •     1.3.6 腐乳中乳酸菌的分离与鉴定
  •   1.4 数据处理
  • 2 结果与分析
  •   2.1 腐乳中细菌DGGE图谱及分析
  •   2.2 序列丰富度及多样性分析
  •   2.3 基于不同分类地位腐乳样品核心细菌菌群相对含量分析
  •   2.4 腐乳中乳酸菌分离鉴定结果及系统发育分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李娜,崔梦君,马佳佳,余海忠,张振东,郭壮,赵慧君

    关键词: 腐乳,变性梯度凝胶电泳,高通量测序,细菌多样性,乳酸菌

    来源: 食品研究与开发 2019年16期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

    专业: 生物学,轻工业手工业

    单位: 湖北文理学院食品科学技术学院鄂西北传统发酵食品研究所,恩施市公共检验检测中心

    基金: 湖北省荆楚卓越工程师协同育人计划(201657),湖北文理学院2018年度学科开放基金项目(931102)

    分类号: TS214.2;TS201.3

    页码: 165-171

    总页数: 7

    文件大小: 568K

    下载量: 279

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