基于网络药理学研究红根草化学成分的分子机制

基于网络药理学研究红根草化学成分的分子机制

论文摘要

目的:基于网络药理学研究红根草化学成分的分子机制,为其药用植物资源的开发利用提供依据。方法:以中药综合数据库为平台,挖掘红根草化学成分、潜在作用靶点和疾病,通过UniProtKB(UniProt数据库)对潜在作用靶点基因名提取后,再用STRING、KOBAS、Cytoscape软件进行蛋白质-蛋白质相互作用,用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析和功能富集分析。结果:红根草4种化学成分包括原儿茶酸、4-羟基红根草邻醌、二氢丹参酮I和丹参酮I,201个潜在作用靶点,204种疾病,构建红根草-化学成分-潜在作用蛋白-疾病的网路关系图;在红根草-化学成分-潜在作用蛋白-KEGG通路网络关系图中有111种信号通路、109个潜在作用蛋白;而关键作用蛋白基因-KEGG通路网络关系图中有87种信号通路、12个关键作用蛋白基因,其包括CASP3、CCND1、BCL2、CDKN1A和TP53等关键基因,其中涉及的主要信号通路和疾病与肿瘤、金黄色葡萄球菌感染、乙型肝炎等有关。结论:红根草作为中药具有多成分、多靶点、协同作用的特点,但对其化学成分的药理机制研究认识缺乏深入研究。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 数据挖掘
  •   1.2 功能富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建
  •   1.3 通路富集分析
  • 2 结果
  •   2.1 红根草化学成分
  •   2.2 红根草化学成分潜在作用靶点的PPI网络构建
  •   2.3 红根草化学成分潜在作用靶点的功能富集分析
  •   2.4 KEGG通路富集分析
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 胡俊辉,姚银辉,王莹,赵静怡,姜艳平

    关键词: 网络药理学,红根草,靶点,分子机制

    来源: 中国现代中药 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技

    专业: 中药学

    单位: 承德医学院附属医院,承德医学院

    基金: 承德市科学技术研究与发展计划项目(201701A087)

    分类号: R285

    DOI: 10.13313/j.issn.1673-4890.20181231002

    页码: 1505-1511

    总页数: 7

    文件大小: 3172K

    下载量: 419

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