论文摘要
长链非编码RNA （long non-coding RNA, lncRNA）是指长度大于200 nt且不具有编码蛋白质功能的一类RNA分子。当生物体暴露于环境污染物时,其lncRNA通常会异常表达,并与癌症等疾病的发生相关。采用亚致死浓度的三唑磷处理斑马鱼后,利用人源基因芯片初步筛选出了异常表达的斑马鱼lncRNA,并通过生物信息学软件预测了与lncRNA相互作用的微RNA（micro RNA, miRNA）及其靶基因,最后通过实时荧光定量PCR验证了该miRNA及其靶基因在斑马鱼中的表达,从而构建起了长链非编码RNA-微RNA-信使RNA （lncRNA-miRNA-mRNA）的调控网络。荧光定量PCR检测结果表明:与空白对照组相比,经三唑磷处理后,斑马鱼lncRNA Sox2OT基因的表达下调了35%;lncRNA H19基因的表达上调了1.41倍,而与其可能存在相互作用的dre-let-7c基因的表达则下调了78%,同时dre-let-7c的靶基因ddx18的表达上调了2.11倍;差异均达显著水平（P <0.05）。据此推测,在三唑磷的作用下,lncRNA H19可能作为靶基因ddx18的竞争性内源RNA而与dre-let-7c发生相互作用,从而调控靶基因ddx18的表达。因此,lncRNA H19、dre-let-7c及ddx18都有可能作为生物标志物用于监测三唑磷对环境和生物体的影响。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 乔嘉凯,杜羽亭,贾龙略,张丹燕,黄涵年,郭江峰
关键词: 三唑磷,斑马鱼,长链非编码微信使,生物信息学,基因表达,污染监测
来源: 农药学学报 2019年03期
年度: 2019
分类: 农业科技,工程科技Ⅰ辑
专业: 环境科学与资源利用
单位: 浙江理工大学生命科学与医药学院生物工程研究所,浙江经贸职业技术学院应用工程系
基金: 浙江省自然科学基金(LY15B070012)
分类号: X503.225
DOI: 10.16801/j.issn.1008-7303.2019.0047
页码: 291-299
总页数: 9
文件大小: 1351K
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