通过优化gRNA设计提高CRISPR/Cas9系统中基因编辑效率的方法

通过优化gRNA设计提高CRISPR/Cas9系统中基因编辑效率的方法

论文摘要

CRISPR/Cas9系统是一种广泛应用于动物、植物、真菌、细菌的新一代基因定点编辑技术,如何提高g RNA的编辑效率是该技术的关键点也是许多研究者关注的焦点。本研究利用CRISPR/Cas9技术对番茄miR167a前体序列进行基因编辑,根据番茄miR167a前体序列在线设计候选g RNA,同时结合体外编辑检测的方法筛选出能够在体外成功编辑的g RNA-G1,把其连接到含有荧光标记的pP1C.1C表达载体,转化番茄子叶,产生愈伤组织数116个,得到5个含有表达载体的材料,经测序发现,其中3个材料发生了编辑。结果表明,通过体外检测和在线软件设计相结合的方法来快速检测g RNA的编辑效率,能筛选出最优的g RNA用于载体的构建,与未采用体外编辑检测来设计g RNA的方法相比,显著提高了CRISPR/Cas9的编辑效率。本研究通过优化g RNA,创新了一种高效利用CRISPR/Cas9进行基因编辑的方法。

论文目录

  • 1 结果与分析
  •   1.1 利用在线软件设计gRNA并构建载体
  •     1.1.1 pP1C.1C和pKSE401重组载体 (含sly-gRNA) 的构建
  •     1.1.2 转基因番茄的获得及鉴定
  •     1.1.3 转基因番茄未发生基因编辑的原因
  •   1.2 利用在线软件和体外酶切筛选高效gRNA并构建载体
  •     1.2.1 pP1C.1C重组载体 (含G1) 的构建
  •     1.2.2 转基因番茄的获得及鉴定
  • 2 讨论
  • 3 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •   3.2 靶位点设计
  •   3.3 CRISPR/Cas9载体构建
  •   3.4 番茄遗传转化
  •   3.5 转化植株的PCR检测以及测序
  • 作者贡献
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李秋月,王小柯,张亚飞,孙珍珠,王旭,江东

    关键词: 设计,体外检测,基因编辑

    来源: 分子植物育种 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 西南大学柑桔研究所

    基金: 重庆市科技创新专项(cstc2016shmsztzx0010),江西地方特色果树种质资源创新与利用专项(S2016NYZPF-0208)共同资助

    分类号: Q78

    DOI: 10.13271/j.mpb.017.003274

    页码: 3274-3282

    总页数: 9

    文件大小: 2654K

    下载量: 691

    相关论文文献

    • [1].Engineering guide RNA to reduce the off-target effects of CRISPR[J]. Journal of Genetics and Genomics 2019(11)
    • [2].一种简单的gRNA体外筛选方法[J]. 实验动物与比较医学 2018(02)
    • [3].一种gRNA快速合成及检测方法的建立[J]. 中国实验动物学报 2015(03)
    • [4].可诱导型CRISPRi系统的构建及其初步应用[J]. 生物技术 2015(02)
    • [5].Self-processing of ribozyme-flanked RNAs into guide RNAs in vitro and in vivo for CRISPR-mediated genome editing[J]. Journal of Integrative Plant Biology 2014(04)
    • [6].小麦淀粉分支酶CRISPR/Cas9基因敲除系统gRNA表达载体构建[J]. 分子植物育种 2019(20)
    • [7].利用epiCRISPR载体表达双sgRNA实现高效的HDAC基因编辑[J]. 复旦学报(自然科学版) 2018(04)
    • [8].Efficient Gene Targeting in Zebrafish Mediated by a Zebrafish-Codon-Optimized Cas9 and Evaluation of Off-Targeting Effect[J]. Journal of Genetics and Genomics 2014(01)
    • [9].CRISPR/Cas基因编辑系统中gRNA表达策略[J]. 生物技术通报 2020(02)
    • [10].CRISPR/Cas9基因编辑系统中两种gRNA活性检测方法比较[J]. 心肺血管病杂志 2016(07)
    • [11].多重靶向纳米递送系统为CRISPR/Cas9体内编辑提供输运工具[J]. 科学通报 2019(25)
    • [12].CRISPR/Cas系统干扰HPV16 E6基因对SiHa细胞增殖和凋亡影响[J]. 中华肿瘤防治杂志 2015(18)
    • [13].Optimized Target-AID system efficiently induces single base changes in zebrafish[J]. Journal of Genetics and Genomics 2018(04)
    • [14].dCas9-gRNA在卡介苗侵染小鼠巨噬细胞过程中对rab7的调控作用[J]. 生物技术 2020(01)
    • [15].利用CRISPR/Cas9技术敲除RNA甲基化酶TRDMT1基因及其功能初探[J]. 扬州大学学报(农业与生命科学版) 2018(02)
    • [16].CRISPR/Cas9系统在基因表达调控中的应用[J]. 畜牧兽医学报 2014(09)
    • [17].靶向食蟹猴NTCP基因的CRISPR/Cas9系统gRNA筛选[J]. 中国畜牧兽医 2016(10)
    • [18].胰腺癌细胞ezrin基因转录调控区及其gRNA靶位点鉴定[J]. 医学研究生学报 2020(02)
    • [19].CRISPR/Cas技术可有效介导家鸡基因敲除[J]. 畜牧兽医学报 2016(06)
    • [20].中国鹅掌楸纤维素合酶的CRISPR/Cas9基因敲除系统的gRNA表达载体构建[J]. 分子植物育种 2017(06)
    • [21].Cpf1和Cas9核酸酶靶向EGFR-L858R突变的研究[J]. 四川大学学报(自然科学版) 2018(02)
    • [22].基于CRISPR-Cas9定向编辑TRAC基因的研究[J]. 广东药科大学学报 2017(02)
    • [23].一个CRISPR/Cas9-VQR基因编辑系统的构建[J]. 作物学报 2019(06)
    • [24].浅谈CRISPR/Cas9技术在基因工程中的应用[J]. 理科考试研究 2016(11)
    • [25].CRISPR-Cas介导的基因编辑工具[J]. 生物技术通报 2014(07)
    • [26].利用CRISPR-Cas9基因编辑技术制备牛MSTN基因编辑胚胎[J]. 河南农业科学 2019(02)
    • [27].应用CRISPR/Cas9基因编辑技术建立miRNA-301a敲除小鼠[J]. 第二军医大学学报 2015(03)
    • [28].双酶切法构建CRISPR-Cas9载体系统的研究[J]. 中国病原生物学杂志 2018(09)
    • [29].人类白细胞抗原-GRNA干扰载体的构建及效应检测[J]. 中国普外基础与临床杂志 2012(06)
    • [30].HBV感染者外周血TLR4mRNA表达与疾病进展关系研究[J]. 微生物学杂志 2008(01)

    标签:;  ;  ;  

    通过优化gRNA设计提高CRISPR/Cas9系统中基因编辑效率的方法
    下载Doc文档

    猜你喜欢