导读:本文包含了细胞表位论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:细胞,病毒,蛋白,生物,免疫,检查点,信息论。
细胞表位论文文献综述
张民秀,谢芝勋,罗思思,谢丽基,谢志勤[1]（2019）在《H9亚型禽流感病毒HA蛋白B细胞抗原表位的预测》一文中研究指出试验运用Clustalx 1.8进行多序列比对,运用Kolaskar&Tongaonkar antigenicity和Bepipred linear Epitope Prediction算法对模板毒株HA蛋白的线性抗原表位进行预测。综合参数预测结果得到4个抗原表位,分别是位于HA蛋白的第26-39aa、166-179aa、225-238aa和490-499aa,为H9-AIV表位疫苗的研制提供参考。(本文来源于《养殖与饲料》期刊2019年12期）
成伟伟,陈伯祥,杨明,赵子惠,常攀峰[2]（2019）在《羊传染性脓疱病毒OVIFNR蛋白结构分析与B细胞表位预测》一文中研究指出本研究应用生物信息学方法,预测分析羊传染性脓疱病毒(ORFV)的OVIFNR蛋白结构与B细胞抗原表位。从羊传染性脓疱病羊嘴唇结痂中扩增出ORFV的OVIFNR基因序列并进行测序鉴定,上传至NCBI;应用生物信息学软件,将扩增所得的OVIFNR基因序列和GenBank公布的参考序列,在核苷酸和氨基酸水平上进行同源性分析和遗传进化树构建,并对OVIFNR蛋白分子的理化特性、跨膜区、信号肽、亲疏水性、二级结构、叁级结构和B细胞抗原表位进行预测分析。结果显示:所扩增序列与Hoping和Nantou毒株的OVIFNR基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为99.6%和100%;通过遗传进化树发现,所扩增序列的毒株与Hoping、ShanX、Nantou毒株处于同一分支;OVIFNR蛋白的理论等电点为4.83,半衰期为30 h,脂肪族指数77.92,总平均疏水性为–0.181,无跨膜区和信号肽,不属于跨膜蛋白;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占68.64%、7.56%、15.13%、9.18%,筛选出了8个优势B细胞表位;OVIFNR蛋白为亲水性蛋白,含有较多B细胞表位,具有抗原性,可以作为ORFV检测的新靶点。本研究为OVIFNR蛋白的功能研究和ORFV检测方法的建立提供了理论依据。(本文来源于《中国动物检疫》期刊2019年11期）
罗建华,夏雪霏,姚文兵,田浤[3]（2019）在《硝基化通用T细胞表位疫苗CD47-NitraTh的设计与抑瘤活性》一文中研究指出利用遗传密码扩充技术,将免疫原性氨基酸对硝基苯丙氨酸定点引入到通用T细胞表位,并将其与免疫检查点分子CD47分子胞外区19-140片段融合表达,构建了靶向免疫检查点CD47的疫苗CD47-NitraTh。CD47-NitraTh能够在BALB/c小鼠体内诱导产生高滴度抗体,并可显着抑制CT26结肠癌肿瘤生长,提高脾脏CD4~+T细胞和CD8~+T细胞的比例,同时可促进na?ve T细胞向Th1细胞极化。值得关注的是,CD47-NitraTh不仅提高了肿瘤浸润淋巴细胞的比例,同时还降低了肿瘤组织中Treg细胞比例,意味着CD47-NitraTh疫苗能够重塑肿瘤免疫抑制性微环境。本研究结果提示,CD47-NitraTh可以作为有效的肿瘤疫苗候选分子。(本文来源于《中国药科大学学报》期刊2019年05期）
王爱萍,陈冰,刘红亮,周景明,陈玉梅[4]（2019）在《猪繁殖与呼吸综合征病毒GP4蛋白B细胞表位的初步筛选》一文中研究指出GP4蛋白是猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的次要结构蛋白,在病毒的复制与侵染中起重要作用。通过合成GP4蛋白的重迭多肽,采用间接ELISA、dot-ELISA的方法对GP4蛋白的B细胞表位进行初步筛选,得到1个免疫显性肽段Ⅰ(50) SCLRHGDSSSPTIRKSS (67),并对其抗体水平进行测定,为PRRSV的抗体检测及其新型表位疫苗的研究奠定基础。(本文来源于《西北农业学报》期刊2019年10期）
邓西子,聂源,兰芸,李锋,高鸣[5]（2019）在《HIV/HBV合并感染者HBV核心区与多聚合酶区特异性细胞毒性T细胞表位变异分析》一文中研究指出目的比较人免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)/乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)合并感染者与HBV单一感染者外周血HBV核心(core,C)蛋白和多聚合酶(polymerase,P)蛋白的特异性细胞毒性T细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位变异的差异,探讨HIV/HBV合并感染者肝病进程加快的可能致病机制。方法收集慢性HBV感染者的基本检查结果和血标本,并依据抗病毒前HIV抗体检测结果,分为HIV/HBV合并感染组和HBV单一感染组。提取HBV DNA,巢式PCR法扩增HBV C基因与P基因并送PCR产物测序,Contig Express软件进行序列拼接,Vector NTI软件进行序列比对,参照相应基因型标准序列,分析2组患者的HBV CTL表位变异差异。结果成功扩增的HBV C基因与P基因的患者共151例,其中HIV/HBV合并感染者83例,HBV单一感染者68例。HIV/HBV合并感染组较HBV单一感染组CTL表位变异发生率均偏高,其中C18-27、C88-96、C139-148表位变异发生率差异比较有统计学意义(χ~2=7. 509,P=0. 006;χ~2=3. 902,P=0. 048;χ~2=4. 238,P=0. 040)。HIV/HBV合并感染组的C18-27表位主要变异氨基酸的类型增多,出现新的S26N(4. 8%)、S26T(4. 8%)变异类型,而C88-96、C139-148表位主要变异氨基酸相同(L95I、T147A)。结论 HIV/HBV合并感染可增加HBV C蛋白和P蛋白的CTL表位变异,尤其是C18-27、C88-96、C139-148表位变异。C蛋白CTL表位变异增多可能与HIV/HBV合并感染肝病进程加快的致病机制相关。(本文来源于《转化医学杂志》期刊2019年05期）
吴阳开,范文胜,张雪莲,李智丽,郭锦玥[6]（2019）在《新型鸭呼肠孤病毒QY株σB蛋白基因特征、二级结构预测及其细胞抗原表位分析》一文中研究指出本研究旨在对新型鸭呼肠孤病毒(NDRV) QY株σB蛋白的遗传变异规律和结构及功能进行分析。从GenBank数据库中获取QY株和25株参考株的σB蛋白编码序列,通过Mega 6.0软件进行序列比对分析和系统进化树构建;使用Datamonkey软件进行选择压力分析;运用生物信息学软件预测QY株σB蛋白二级结构功能及B细胞和T细胞抗原表位。相似性分析结果显示,NDRV QY株与国内其他地区分离的鸭呼肠孤病毒(DRV)氨基酸相似性达到94.9%～98.9%,与禽呼肠孤病毒(ARV)及番鸭呼肠孤病毒(MDRV)的相似性仅为66.5%～68.4%和67.6%～68.4%;选择压力分析显示,σB蛋白承受净化选择压力,但存在一个正向选择位点;σB蛋白属于亲水蛋白,不具有信号肽和跨膜区,含有潜在的O-糖基化位点;结构预测分析显示,σB蛋白具有α-螺旋、β-折迭、β-转角及无规则卷曲等丰富的二级结构;表位分析显示,σB蛋白含有潜在的B细胞和T细胞抗原表位。本研究成功进行了QY株σB蛋白的基因特征和结构功能预测及其细胞表位分析,为深入了解该蛋白的免疫学特性及研发NDRV新型疫苗奠定了基础。(本文来源于《中国畜牧兽医》期刊2019年10期）
羊红光,成彬[7]（2019）在《MLEP:一种B细胞线性表位预测方法》一文中研究指出为了更快更准地确定B细胞线性表位,提出了一种新的预测方法——MLEP(Prediction of epitope based on MCFS and LSTM,MLEP)算法。采用5种性质氨基酸理化性质作为学习特征,利用多聚类特征选择算法进行特征选择,用降维后的数据作为输入,用长短期记忆网络进行训练,获得预测性能好的模型,对多聚类特征选择算法及MLEP算法的性能进行评价。对非冗余LBtope数据集进行多组实验,结果表明,使用多聚类特征选择算法降维到25时获取性能最优模型,多聚类特征选择算法比主成分分析法获得的模型准确率更高,基于MLEP算法获得的模型准确率达到94.81%。因此,MLEP算法能更好地预测B细胞线性表位,对于表位预测研究具有一定的参考价值。(本文来源于《河北工业科技》期刊2019年05期）
聂恺阳,吴云燕,易琳,吴祖雄,陈金顶[8]（2019）在《重组优势T、B细胞表位的猪圆环病毒2型Cap蛋白的原核表达及免疫原性研究》一文中研究指出为探究猪圆环病毒2型(PCV2)优势T、B细胞表位对Cap蛋白免疫原性的影响,本研究将前期研究筛选到的PCV2 Rep和Cap蛋白中的T、B细胞表位,分别构建pET-rB-Cap、pET-rT-Cap和pET-rT-B-Cap重组质粒,并转化到大肠杆菌BL21中,经IPTG诱导表达后,采用SDS-PAGE和western blot检测3种重组蛋白:rB-Cap、rT-Cap和rT-B-Cap。结果显示,上述3种重组蛋白均高效表达且具有良好的反应原性。将70只4周龄～6周龄的BALB/c雌鼠随机分为7组,分别免疫不同的重组蛋白或者全病毒灭活疫苗,并对其产生的免疫原性进行检测。结果显示,各实验组小鼠的血清抗体水平均显着高于PBS组(p<0.01),其中rT-B-Cap组小鼠抗体水平显着高于PCV2全病毒灭活疫苗组和rCap组(p<0.01)。综上所述,PCV2 Cap蛋白同时串联T、B优势抗原表位时的免疫原性显着提高。本研究为PCV2多表位疫苗及基于Cap蛋白的亚单位疫苗的研究提供了新的途径。(本文来源于《中国预防兽医学报》期刊2019年09期）
羊红光,张立佳,成彬[9]（2019）在《B细胞表位预测研究进展》一文中研究指出B细胞表位的鉴定是研制疫苗、疾病诊断的关键步骤,表位预测是研究蛋白质表位一种筛选技术,能降低传统方法的大量投入,大幅降低研制时间、研发经费投入、研究人员精力花费等。表位预测的计算工具和方法不断推出,但预测性能却难言理想。回顾B细胞表位预测的最新进展,梳理B细胞的研究趋势及有希望的方向。(本文来源于《河北省科学院学报》期刊2019年03期）
杭柏林,宁春妹,张炜,张慧辉,徐彦召[10]（2019）在《鸡抗菌肽NK-lysin的B细胞表位、剪切位点、疏水性及进化分析》一文中研究指出为了解鸡抗菌肽NK-lysin的B细胞表位、剪切位点、疏水性、同源性及进化等内容,试验选择鸡抗菌肽NK-lysin的氨基酸序列通过网络在线软件IEDB Analysis Resource、PeptideCutter、ProtScale、BLAST、DNAStar进行分析。结果表明:鸡抗菌肽NK-lysin存在5个B细胞表位,可被20种酶和化学物质剪切,亲水性大于疏水性,与鸡颗粒溶素的同源性为100%,在进化上与珍珠鸡类皂化蛋白C最为接近。说明鸡抗菌肽NK-lysin为亲水性蛋白,具有抗原性,有很多剪切位点,与珍珠鸡类皂化蛋白C有较高的亲缘关系。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年15期）
细胞表位论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本研究应用生物信息学方法,预测分析羊传染性脓疱病毒(ORFV)的OVIFNR蛋白结构与B细胞抗原表位。从羊传染性脓疱病羊嘴唇结痂中扩增出ORFV的OVIFNR基因序列并进行测序鉴定,上传至NCBI;应用生物信息学软件,将扩增所得的OVIFNR基因序列和GenBank公布的参考序列,在核苷酸和氨基酸水平上进行同源性分析和遗传进化树构建,并对OVIFNR蛋白分子的理化特性、跨膜区、信号肽、亲疏水性、二级结构、叁级结构和B细胞抗原表位进行预测分析。结果显示:所扩增序列与Hoping和Nantou毒株的OVIFNR基因核苷酸序列和氨基酸序列同源性分别为99.6%和100%;通过遗传进化树发现,所扩增序列的毒株与Hoping、ShanX、Nantou毒株处于同一分支;OVIFNR蛋白的理论等电点为4.83,半衰期为30 h,脂肪族指数77.92,总平均疏水性为–0.181,无跨膜区和信号肽,不属于跨膜蛋白;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占68.64%、7.56%、15.13%、9.18%,筛选出了8个优势B细胞表位;OVIFNR蛋白为亲水性蛋白,含有较多B细胞表位,具有抗原性,可以作为ORFV检测的新靶点。本研究为OVIFNR蛋白的功能研究和ORFV检测方法的建立提供了理论依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
细胞表位论文参考文献
[1].张民秀,谢芝勋,罗思思,谢丽基,谢志勤.H9亚型禽流感病毒HA蛋白B细胞抗原表位的预测[J].养殖与饲料.2019
[2].成伟伟,陈伯祥,杨明,赵子惠,常攀峰.羊传染性脓疱病毒OVIFNR蛋白结构分析与B细胞表位预测[J].中国动物检疫.2019
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[10].杭柏林,宁春妹,张炜,张慧辉,徐彦召.鸡抗菌肽NK-lysin的B细胞表位、剪切位点、疏水性及进化分析[J].黑龙江畜牧兽医.2019
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