基于培养基法和高通量测序法分析冷藏小龙虾优势腐败菌

论文摘要

为揭示4℃冷藏小龙虾贮藏期间微生物菌群多样性及优势腐败菌种类,以传统培养基法作为对照,采用高通量测序技术分别鉴定小龙虾样品在鲜样期、腐败中期、腐败末期的腐败菌属,探究贮藏期间微生物菌群变化趋势。2种测序方法对比发现,高通量法检测到的菌属更具多样性,培养基法提取的腐败菌均包含在高通量测序菌属内。结果表明,培养基法提取优势腐败菌共11株,其中气单胞菌(Aeromonas jandaei)致腐能力最强,弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)致腐能力最弱;此外,高通量测序法显示希瓦氏菌(Shewanella sp.)、肉杆菌属(Carnobacterium sp.)、环丝菌属(Brochothrix sp.)、嗜冷菌属(Psychrobacter sp.)、漫游球菌属(Vagococcus sp.)、不动杆菌属(Acinetobacter sp.)等在腐败末期时的物种丰度为90.57%。2种方法比对可以确定,小龙虾的优势腐败菌有希瓦氏菌、肉食杆菌、环丝菌属、嗜冷菌属、漫游球菌属、不动杆菌属、气单胞菌、束毛球菌属(Trichococcus sp.)等。

论文目录

1 材料与方法

1.1 材料、试剂与培养基

1.2 仪器与设备

1.3 方法

1.3.1 挥发性盐基氮（total volatile basic nitrogen, TVB-N）值测定

1.3.2 菌落总数测定

1.3.3 单菌落的分离和纯化

1.3.4 无菌虾肉的制备

1.3.5 单菌落优势腐败菌的筛选

1.3.6 单菌落优势腐败菌的分子生物学鉴定

1.3.7 高通量测序法鉴定优势腐败菌

1.4 数据及图像处理

2 结果与分析

2.1 冷藏期间小龙虾TVB-N值及TVC值变化

2.2 培养基鉴定法

2.2.1 优势腐败菌的分离

2.2.2 优势腐败菌的腐败特性

2.2.3 优势腐败菌的分子鉴定

2.3 高通量测序法鉴定优势腐败菌

2.3.1 PCR扩增结果及微生物数量分析

2.3.2 物种多样性分析

2.3.3 菌相组成分析

3 结论与讨论

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 江杨阳,杨水兵,余海霞,姚洁玉,胡亚芹

关键词: 小龙虾,优势腐败菌,培养基法,高通量测序

来源: 食品科学 2019年16期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑

专业: 轻工业手工业

单位: 浙江大学生物系统工程与食品科学学院馥莉食品研究院智能食品加工技术与装备国家(地方)联合实验室农业部农产品产后处理重点实验室农业部农产品营养功能评价实验室浙江省农产品加工技术研究重点实验室,浙江大学舟山海洋研究中心

基金: “十三五”国家重点研发计划重点专项（2017YFD0400404）

分类号: TS254.1

页码: 130-136

总页数: 7

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标签：小龙虾论文; 优势腐败菌论文; 培养基法论文; 高通量测序论文;

基于培养基法和高通量测序法分析冷藏小龙虾优势腐败菌

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