中国东南9种伪镖水蚤的形态学与系统发育学研究

中国东南9种伪镖水蚤的形态学与系统发育学研究

论文摘要

本研究对中国东南沿岸水域采集的伪镖水蚤进行了细致的种类鉴定,对其中9种伪镖水蚤的形态学特征进行了拍照、绘图及描述,结合形态学特征和分子生物学证据对近似种进行比较。同时,对伪镖水蚤的mtCOⅠ序列进行了分析,结合GenBank的数据对各种类间的遗传距离和系统发育关系进行了探讨,并与基于形态学特征分群的结果进行比较。主要研究结果如下:1.伪镖水蚤的分布与形态在我国东南的6个采样点中,共鉴定出12种伪镖水蚤。对其中9种伪镖水蚤的形态学特征进行了描述,包括叶状群的沈氏伪镖水蚤(Pseudodiaptomus sheni)、灯泡伪镖水蚤(P.bulbosus)、球状伪镖水蚤(P.forbesi)、指状伪镖水蚤(P.inopinus)、火腿伪镖水蚤(P.poplesia)和杓状伪镖水蚤(P.spatulatus),透明群的双刺伪镖水蚤(P.bispinosus)和三钩伪镖水蚤(P.trihamatue),以及分叉群的郑氏伪镖水蚤(P.zhengi)。其中,沈氏伪镖水蚤和郑氏伪镖水蚤为本研究中发现的新种(已另文发表),灯泡伪镖水蚤的雌性为不同于原始描述的新描述,双刺伪镖水蚤为厦门湾首次记录。论文提供了上述种类整体和部分附肢的光镜照片及绘图,并附上雌性生殖节的扫描电镜照片。结合形态学特征和分子生物学证据对近似种进行比较,结果支持上述9种伪镖水蚤均为独立的物种。此外,对mtCOⅠ序列的分析表明沈氏伪镖水蚤、指状伪镖水蚤和火腿伪镖水蚤的雄性普通型和返祖型均为同一物种的不同表现型。2.伪镖水蚤属的系统发育以海洋伪镖水蚤(P.marinus)为属内参照,对10种伪镖水蚤mtCOⅠ序列片段进行分析并计算遗传距离,结果表明不同个体间种内遗传距离为0.1%-3.4%,而种间距离为21.3%-38.1%,种间距离显著大于种内距离;此外,伪镖水蚤属不同群间的遗传距离为29.0%-38.1%,大于各自群内的种间遗传距离21.3%-32.0%。结合GenBank的数据,以Calanipeda aquaedulcis和短角异剑水蚤(Apocyclops royi)为外源参照,对伪镖水蚤的系统发育关系进行了探讨。结果表明叶状群与透明群的种类亲缘关系较近,而分叉群的种类与它们的亲缘关系更远。通过不同方法构建的系统发育树中,分叉群的种类均聚在树的基部,表明它们与其它种类发生分歧的时间较早;而叶状群的种类在不同方法构建的树中均位于树的端部,表明它们与其它种类发生分歧的时间较晚。此外,分子系统发育构建的结果与形态学分群结果较为一致,而与亚群的划分不一致,这可能是由于系统发育构建时可纳入的种类数较少所致,也表明伪镖水蚤群内形态划分可能需要更多的同源特征。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一章 绪论
  •   1.1 伪镖水蚤属的研究进展
  •     1.1.1 伪镖水蚤简介
  •     1.1.2 伪镖水蚤形态分类研究进展
  •     1.1.3 伪镖水蚤系统发育研究进展
  •       1.1.3.1 桡足类分子系统发育研究
  •       1.1.3.2 伪镖水蚤DNA条形码
  •   1.2 本研究目的意义及主要内容
  •     1.2.1 目的意义
  •     1.2.2 主要内容
  • 第二章 材料与方法
  •   2.1 地名及样品编号缩写
  •   2.2 样品采集与保存
  •   2.3 形态观察
  •     2.3.1 光镜照片的拍摄与绘图
  •     2.3.2 扫描电镜样品制备与拍摄
  •   2.4 mtCOⅠ序列获取
  •     2.4.1 样品预处理
  •     2.4.2 基因组DNA的提取
  •     2.4.3 mtCOⅠ序列的扩增
  •     2.4.4 凝胶电泳检测与测序
  •   2.5 DNA数据分析方法
  • 第三章 伪镖水蚤的分布与形态
  •   3.1 中国东南伪镖水蚤的分布
  •   3.2 9种伪镖水蚤的形态
  •     3.2.1 叶状群
  •       3.2.1.1 沈氏伪镖水蚤
  •       3.2.1.2 灯泡伪镖水蚤
  •       3.2.1.3 球状伪镖水蚤
  •       3.2.1.4 指状伪镖水蚤
  •       3.2.1.5 火腿伪镖水蚤
  •       3.2.1.6 杓状伪镖水蚤
  •     3.2.2 透明群
  •       3.2.2.1 双刺伪镖水蚤
  •       3.2.2.2 三钩伪镖水蚤
  •     3.2.3 分叉群
  •       3.2.3.1 郑氏伪镖水蚤
  • 第四章 伪镖水蚤属的系统发育
  •   4.1 mtCOⅠ序列的碱基组成与变异
  •   4.2 相对遗传距离
  •   4.3 系统发育信号的检验
  •   4.4 系统发育树的构建
  •     4.4.1 叶状群6个种的系统发育树
  •     4.4.2 中国东南伪镖水蚤的系统发育树
  •     4.4.3 结合GenBank数据的伪镖水蚤系统发育树
  •   4.5 系统发育树与形态学分类的比较
  •   4.6 属内进化地位的探讨
  • 第五章 结语
  •   5.1 主要成果
  •   5.2 创新点
  •   5.3 不足与展望
  • 参考文献
  • 在学期间科研情况
  • 致谢
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 王博文

    导师: 郭东晖

    关键词: 中国东南,伪镖水蚤,形态学,系统发育学

    来源: 厦门大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 厦门大学

    分类号: Q964

    总页数: 111

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