Aerolysin纳米孔核酸检测灵敏区域的协同相互作用探索研究

论文摘要

纳米孔单分子检测技术以其简便、快速、高通量及无需标记等特点,应用于DNA及蛋白质测序,更有望实现单分子动态构象变化的研究. Aerolysin（气单胞菌溶素）纳米孔道由于其特有的较长的β-桶限域区（β-barrel）及孔内壁丰富的带电荷氨基酸残基,在单个寡聚核苷酸分子分析中展现出极高的灵敏性.本设计利用dA14-4-X,dA14-11-X,dA14-4-X-11-X （X=C, T, G）等单个寡聚核苷酸探针分子,研究了Aerolysin的两个灵敏区域R1和R2,探索了R1灵敏区域对单个碱基弱相互作用的差异,实现区分单个碱基差异.进一步实验证明,R1灵敏区域对单个碱基类型差异的灵敏区分不受R2灵敏区域被碱基A、C、T占位所影响.然而,当R2区域被碱基G占位时,会使R1区域丧失对整个孔道电流的主导性.本研究有助于理解Aerolysin对单个寡聚核苷酸分子的超灵敏测量机制.

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类型: 期刊论文

作者: 李孟寅,应佚伦,龙亿涛

关键词: 纳米孔,单分子界面,电化学限域,气单胞菌溶素,寡聚核苷酸

来源: 化学学报 2019年10期

年度: 2019

分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学

专业: 生物学,化学,材料科学

单位: 华东理工大学化学与分子工程学院,南京大学化学化工学院生命分析国家重点实验室

基金: 国家自然科学基金(Nos.21834001,61871183)资助~~

分类号: Q503;O652;TB383.1

页码: 984-988

总页数: 5

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标签：纳米孔论文;  单分子界面论文;  电化学限域论文;  气单胞菌溶素论文;  寡聚核苷酸论文;