NDRVσC蛋白互作的宿主因子筛选及生物信息学分析

NDRVσC蛋白互作的宿主因子筛选及生物信息学分析

论文摘要

研究鸭呼肠孤病毒(Duck reovirus,DRV)σC蛋白与宿主因子之间的相互作用,对揭示σC蛋白在病毒复制过程中的功能及该病毒的致病机理具有重要作用。本研究采用免疫共沉淀法及质谱分析技术,筛选出与σC蛋白可能发生互作的宿主相关蛋白,并对所筛选出的宿主细胞蛋白进行了GO注释和KEGG代谢通路注释。结果表明,与空白对照组比较,获得与σC蛋白相互作用的宿主细胞蛋白有100个;筛选出的这些宿主细胞蛋白中,在病毒感染后不同时间点差异表达量均上升3倍以上的蛋白有6个,分别与病原致病性、蛋白质代谢途径、细胞信号通路转导有关。该研究结果为进一步探讨σC蛋白的生物学功能奠定了基础,也为揭示σC蛋白与宿主因子相互作用进而调控DRV复制等机制研究提供线索。

论文目录

  • 1材料与方法
  •   1.1材料
  •     1.1.1细胞、病毒和载体
  •     1.1.2主要试剂
  •   1.2方法
  •     1.2.1质粒的构建
  •     1.2.2间接免疫荧光实验
  •     1.2.3免疫共沉淀
  •     1.2.4银染
  •     1.2.5质谱分析
  •     1.2.6生物信息学分析
  • 2结果
  •   2.1重组真核表达质粒构建
  •   2.2间接免疫荧光实验结果
  •   2.3免疫共沉淀及银染结果
  •   2.4质谱分析
  •   2.5宿主细胞蛋白的生物信息学分析
  •     2.5.1 GO (gene ontology)注释
  •     2.5.2 KEGG (kyoto encyclopedia of genes andgenomes)代谢通路注释
  • 3讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 肖容,杜夏夏,李传峰,马文戈,米晓云,刘光清,周海龙,陈宗艳

    关键词: 鸭呼肠孤病毒,蛋白,宿主细胞蛋白,质谱分析,生物信息学分析

    来源: 中国动物传染病学报 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 海南大学农林学院,中国农业科学院上海兽医研究所,新疆畜牧科学院

    基金: “十三五”国家重点研发计划项目(2016YFD0500802),“十三五”国家重点研发计划项目(2017YFD0500802),国家自然科学基金(31502068),国家自然科学基金-新疆联合基金(U1703117)

    分类号: S852.65

    页码: 1-9

    总页数: 9

    文件大小: 3179K

    下载量: 233

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