导读:本文包含了调控序列论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:序列,基因,转录,因子,顺式,绝缘子,皮质。
调控序列论文文献综述
施宏辉,蒲金定,何建行[1]（2019）在《非小细胞肺癌A549中lncRNA-CCAT1上游调控序列的Myc结合模式预测》一文中研究指出目的探讨非小细胞肺癌中,原癌基因Myc调控lncRNA-CCAT1(结肠癌相关转录因子)上游序列的潜在位点。方法通过GRh37 hg19人类基因组数据库确定调控区域,以及ENCODE数据库A549的各类Ch IP-Seq数据可视化的Wig文件,通过UCSC基因组浏览器,分析Myc的调控普遍结合模式;组蛋白H3K27Ac活化位点和DNase敏感位点,发掘潜在的Myc结合区域,并使用序列匹配的方法,发现与Myc结合的E-box的特征性。结果基因组分析表明lncRNA-CCAT1与Myc在染色体同一区域,且有证据表明Myc可以调控lncRNA-CCAT1。本研究通过ENCODE项目的Ch IP Seq数据集联合序列匹配的方法查找预测了至少4个潜在的lncRNA-CCAT1上游转录因子结合区域,20多个可能的Myc结合位点。结论经过对lncRNA-CCAT上游序列的查询,预测出Myc可能的调控序列,为Ch IP-qPCR后续验证Myc调控lncRNA的模式提供理论支持。(本文来源于《实用癌症杂志》期刊2019年06期）
徐思凡[2]（2019）在《不同品系鸡akirin2基因调控序列及相关miR-142的克隆与表达分析》一文中研究指出AKIRIN2作为一个高度保守的核内因子,通过与其它蛋白形成复合物来调控靶基因进而发挥生物学功能。目前,有关AKIRIN2蛋白研究主要是集中于肌肉发育和免疫调控领域,而对于akirin2基因自身转录调控机制研究未见报道。启动子和miRNA在目的基因的转录前和转录后调控过程中发挥关键作用,本研究以鸡为模式动物,克隆不同品系鸡akirin2基因5'-端上游2832 bp序列和3'-端下游417 nt序列,通过生物信息学分析预测获得miR-142-3p可能靶向akirin2基因3'非翻译区(3'UTR),综合分析miR-142-3p和miR-142-5p的表达与功能特性,主要研究结果如下:首先,本研究克隆了海蓝褐鸡、AA~+鸡和叁黄鸡的akirin2基因启动子区2832bp序列,并进行序列比对和生物信息学分析。结果表明:蛋鸡(海蓝褐鸡)和肉鸡(AA~+鸡和叁黄鸡)之间一共有38个SNP位点,而AA~+鸡和叁黄鸡之间只有4个SNP位点;通过转录因子预测发现,蛋鸡与肉鸡间的19个SNP位点导致了转录因子结合位点改变,进而导致蛋鸡和肉鸡在转录因子的种类和数量上存在差异;通过CpG岛预测发现,蛋鸡和肉鸡间CpG岛序列差异不大,但有较多的SNP位点分布在CpG岛内。推测不同品系鸡间的akirin2基因启动子调控机制存在差异。其次,本研究克隆了海蓝褐鸡、AA~+鸡和叁黄鸡的akirin2基因终止密码子下游3'UTR部分417nt序列,并进行序列比对和生物信息学分析。结果表明:叁个品系鸡中3'UTR部分序列完全一致,推测不同品系鸡akirin2基因的转录后调控机制相似,生物信息学预测发现miR-142-3p可能靶向3'UTR序列。最后,pri-miR-142部分序列分析表明:叁个品系鸡pri-miR-142序列完全一致。miR-142-3p/5p组织表达谱表明:叁个品系鸡中miR-142-3p/5p在各组织中广泛表达,miR-142-3p/5p的表达活性与组织发育和免疫功能相关,并且miR-142-3p相比miR-142-5p可能更具有功能多样性。miR-142-3p/5p在炎症模型和疫苗免疫模型的组织表达谱分析表明,miR-142-3p/5p均参与炎症反应和免疫应答,并且在不同免疫组织中发挥着不同的调控作用;miR-142-3p和miR-142-5p间表达活性差异可能与二者的功能特性、不同品系鸡性状以及不同病理过程等相关。本研究表明akirin2启动子序列SNP位点可能是影响不同品系鸡akirin2基因表达活性差异的关键因素之一。研究akirin2基因启动子及其相关miR-142表达与特性,对于深入理解akirin2基因表达调控机制和miR-142在炎症与免疫中的功能与应用,具有重要的理论和实践意义。(本文来源于《哈尔滨师范大学》期刊2019-06-01）
何佳静[3]（2019）在《冠心病相关SLC22A3基因中新发现负性调控序列的性质与功能鉴定》一文中研究指出目的:拟对课题组前期发现的冠心病相关SLC22A3基因intron7区域中的2段DNA负性调控序列的性质及功能进行研究,以明确其为沉默子还是绝缘子。方法:利用生物信息学分析两段负性调控序列在所培养细胞系中的脱氧核糖核酸酶I(DNaseI)敏感性,并以包含人SLC22A3基因全长序列的细菌人工染色体(bacterial artificial chromosome,BAC)为模板,PCR扩增两负性调控序列,以pGL3-Control质粒作为工具载体,将两段序列克隆入报告基因Luciferase(LUC)的启动子与增强子之间以及增强子的下游,构建4组重组质粒,并以pGL3-Control质粒作为空白对照,与内参质粒pRL-SV40共转染人胚肾细胞HEK293T,24h后检测荧光素酶活性。结果:两段负性调控序列均位于DNaseⅠ超敏位点,明确了其为顺式调控元件的性质。4组重组质粒pGL3-con-SLCi7-447X、pGL3-con-SLCi7-447S、pGL3-con-SLCi7-460X以及pG L3-conSLCi7-460S荧光素酶活性分别为(2.353±0.323)、(3.046±0.415)、(3.016±0.119)、(3.833±0.282),相较于空白对照pGL3-Control(7.423±0.230),荧光素酶活性均明显降低(P<0.05)。结论:SLC22A3基因的intron7区域中存在2个负性调控元件,其负性调控作用不受位置的影响,发挥沉默子调控功能,为进一步对冠心病相关SLC22A3基因的表达调控的研究提供了理论依据。(本文来源于《重庆医科大学》期刊2019-05-01）
石晴,朱德锐[4]（2019）在《Halomonas sp.QHL1四氢嘧啶合成基因簇ectABC与上游调控序列的克隆及其功能分析》一文中研究指出目的克隆中度嗜盐菌Halomonas sp.QHL1中的四氢嘧啶合成基因簇及上游调控序列并进行功能分析。方法通过PCR技术从Halomonas sp.QHL1中克隆获得ectABC基因簇及上游启动子序列(promoter+ectABC),将其与表达载体pColdⅠDNA连接,转化至E.coil BL21(DE3),用SDS-PAGE分析目的基因的异源表达、盐耐受实验检测重组菌株的耐盐能力。结果克隆得到大小为3335 bp的promoter+ectABC基因序列,并在E.coil BL21(DE3)中成功异源表达,重组菌株盐耐受能力明显提高。结论四氢嘧啶生物合成基因操纵子序列能够在E.coil BL21(DE3)中异源表达,且含有该序列的工程菌株耐盐能力显着提高。(本文来源于《中国高原医学与生物学杂志》期刊2019年01期）
邳晓盟,刘庆珍,吴尽,肖慧,郑冬[5]（2017）在《鼠源miR-148a基因上游调控序列预测及克隆》一文中研究指出为了确定miR-148a基因的上游调控序列,试验采用软件加以预测分析,并分析其生物学信息。结果表明:如果以miR-148a前体(pre-miR-148a)的第1个碱基为零点,启动子核心序列位于-1 412~-612 bp之间,其调控序列位于-2 412~-112 bp之间。此DNA片段中共存在45个转录因子的结合位点,存在25个调控miR-148a基因的转录因子结合位点。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2017年17期）
苏波[6]（2017）在《绵羊毛囊皮质层特异表达基因KAP11.1上游调控序列研究》一文中研究指出在毛囊的形成过程中,毛母质细胞向上分化成内根鞘及毛干,毛干最后长出体表形成毛发。毛干由髓质层、皮质层、角质层叁部分组成,皮质层是毛干的重要组成部分。绝大部分角蛋白关联蛋白(Keratin associated protein,KAP)基因在皮质层特异表达,KAPs含量及与角蛋白互作形成的交联结构影响毛发的理化性质,进而决定毛发的品质。本课题组前期研究发现绵羊角蛋白关联蛋白11.1(Keratin associated protein 11.1,KAP11.1)基因在毛囊皮质层特异表达,随后利用转基因小鼠模型证实绵羊KAP11.1基因5’端上游5952bp序列能够驱动外源基因在小鼠毛囊皮质层特异性表达。但KAP11.1基因在毛囊皮质层特异表达的调控机制尚不清楚。本研究通过生物信息学预测、双荧光素酶报告基因检测、点突变、RNA干扰、EMSA、免疫荧光组化等技术对绵羊KAP11.1基因上游调控序列进行了鉴定,并构建了表达Cre重组酶的KAP11.1-Cre转基因载体,主要研究结果如下:(一)绵羊KAP11.1基因5’端上游调控序列研究1.绵羊KAP11.1基因5’端上游序列中存在重要调控区域首先,对KAP11.1基因5’端2576bp上游序列(ATG的A为+1)进行截短,共得到7个截短体,分别命名为F5(-2576~+1)、F6(-2099~+1)、F7(-1594~+1)、F8(-1026~+1)、F9(-569~+1)、F10(-251~+1)、F11(-148~+1)截短体。将各截短体克隆到双荧光素酶报告载体并转染HEK293T细胞,检测结果显示F10截短体中可能存在影响绵羊KAP11.1基因表达的调控序列。通过生物信息学预测发现F10截短体中的-251~-148bp区域存在叁个与毛囊发育相关的转录因子(Hoxc13、Tst-1/Oct6和Ets1)结合位点。其次,通过对预测的转录因子结合位点进行点突变、利用RNA干扰技术在体外细胞中抑制Hoxc13、Tst-1/Oct6、Ets1表达的策略证实这些结合位点对KAP11.1基因的表达具有调控作用。2.绵羊KAP11.1基因上游-251~-148bp区域与候选转录因子存在互作依据-251~-148bp区域中Hoxc13、Tst-1/Oct6和Ets1结合位点设计探针,利用凝胶电泳迁移实验(EMSA)验证叁个转录因子与结合位点的互作,结果发现包含Hoxc13、Tst-1/Oct6和Ets1叁个转录因子结合位点的序列与核蛋白形成了DNA-蛋白复合物,表明存在相互作用。3.绵羊KAP11.1基因上游-251~-148bp区域可能是一个重要的转录调控区域首先,采集毛囊处于生长期的绵羊及昆明小鼠皮肤制作切片,用免疫荧光组化技术检测显示Hoxc13、Tst-1/Oct6和Ets1在绵羊及小鼠毛囊皮质层有表达。其次,本课题组前期研究中制备了用绵羊KAP11.1基因5’端上游5952bp序列驱动KAP13.1和ZSG表达的pKAP11.1-sKAP13.1-2A-ZSG小鼠(简称Plus小鼠)。本研究采集了出生后9(毛囊生长期)、15(毛囊生长末期)、18(毛囊衰退期)、21(毛囊退行期)天的Plus小鼠皮肤制作切片,免疫荧光组化结果表明Hoxc13、Tst-1/Oct6和Ets1在毛囊生长期的Plus小鼠毛囊皮质层中高表达,在衰退期及休止期不表达或低表达,其时空表达模式与课题组前期研究中检测的由绵羊KAP11.1基因5’端上游5952bp序列调控的KAP13.1表达模式一致。第叁,对绵羊KAP11.1基因5’端上游5952bp序列中-251~-148bp区域的Ets1转录因子结合位点进行点突变,插入双荧光素酶报告载体,检测结果发现KAP11.1基因5952bp上游序列的荧光素酶活性显着降低,说明-251~-148bp区域可能是KAP11.1基因上游序列中的一个转录调控区域。(二)表达Cre重组酶的KAP11.1-Cre转基因载体的构建利用本课题组前期研究中鉴定的可驱动外源基因在毛囊皮质层特异表达的绵羊KAP11.1基因5952bp上游序列,构建了表达Cre重组酶的KAP11.1-Cre载体并在叁种细胞(HEK293T、BHK21和PK15)中超表达,在细胞水平进行了表达检测,已经用于KAP11.1-Cre转基因小鼠的制备。(本文来源于《华中农业大学》期刊2017-06-01）
杨比特[7]（2017）在《基于深度学习的增强子调控序列识别研究》一文中研究指出随着新一代测序技术(Next-Generation Sequencing,NGS)对整个测序领域带来重大革新,生物学各个领域的研究得益于NGS技术,能够快速、廉价地获得高通量层序数据。这一进步彻底改变了以往研究人员针对基础研究、临床研究的方法。同时,海量的数据使得新的存储方式和计算方法不断提出。从前以注重生化实验的研究方法已经慢慢转向注重后期数据分析。从前需要大量数据才能建立的组学分析以及多组学间的分析如今已成为可能,加快了人们对复杂生命现象机制的理解。数据的爆炸式增长,使得研究人员意识到,需要有新的知识组织形式帮助后人更好地理解当前的研究进展。同时,数据深层次的意义需要人们反复地对所积累的数据进行挖掘。因此,人类基因组计划(Human Genome Project,HGP)是生物学领域中一个重要的里程碑,该计划致力于读取人类基因组全部的碱基序列。然而,我们的目的不仅仅于此,更重要的是理解DNA序列中隐含的各种功能。随后,表观路线图计划(Roadmap Epigenomics Project)和DNA元件百科全书计划(Encyclopedia of DNA Elements Project,ENCODE)是人类进一步探索遗传奥秘的两大重要项目。这两个项目收集了大量来自于多组学的DNase-Seq、RNASeq、Ch IP-Seq等实验数据。生物学领域中某个组学的研究往往不是独立的,它仅仅反映了基因组单个方面的性质,然而多组学之间其实存在着非常紧密的联系。如何从一个系统的、整体的角度将不同组学的数据结合起来研究已成为当前生物信息学领域最重要的研究方法之一。通过过去40多年来的研究证明,在DNA序列上存在一系列的顺式调控序列(cis-regulatory sequences),如果某些基因突变发生在这些调控元件的区域,将导致最终表型的差异。其中,顺式调控元件(cis-regulatory elements)就是激活和维持转录发生的关键。深入理解顺式调控元件对于理解生命活动的机理、人类疾病发生的原因以及物种之间的保守性规律等非常重要。增强子(Enhancer)是一类远端顺式作用的DNA调控元件,它们在不同时间、不同细胞系的基因表达中起到了关键的调控作用。当前,理解增强子的特性、作用目标和调控活动是一个非常重要的研究领域,因为它间接地对发育、细胞鉴定、表达多样性、进化以及人类疾病起到关键作用。由于增强子元件没有共同的序列特征,而每个增强子的作用目标也无法精确定位,此外,增强子的调控作用具有很强的细胞/组织特异性。所以在哺乳类基因组中,如何准确识别增强子依然存在很大的挑战。近年来,得益于深度测序技术的发展,使得大量增强子预测的计算方法得以实现。这些预测方法可以利用该测序技术获得来自不同数据源的充足数据。依据数据的不同来源,可以大致将增强子识别算法从概念上分为3类。不同的计算方法依赖不同的数据集、输入特征或监督学习与非监督学习的组合。第一类使用生物信息学计算方法识别增强子利用的是表观遗传学数据,比如说从ChIP-seq数据中获取的组蛋白信息、DNase高敏位点(DHSs)或转录因子结合位点(TFBSs),这一类方法主要利用聚类或非监督学习的方式完成。第二类方法是将增强子识别问题抽象成一个利用有监督的机器学习方法来区分增强子区域和非增强子区域的二分类问题,比如说利用支持向量机(SVMs)、人工神经网络(ANNs)、决策树(DTs)、随机森林(RFs)、图论模型(PGMs)或是近年来最火的深度学习(DLs)。第叁类利用的生物信息学方法是通过对增强子的高精度扫描,从而获得高质量的数据,以此来测试人类、小鼠、果蝇和酵母中的增强子。尽管这些增强子识别方法都起到了一定的效果,但是在生物信息学层面上依然存在很多技术问题,比如说类别不平衡、过拟合问题、参数难确定以及泛化能力差的问题。一个主要的困难是缺乏大量实验验证的人类或其他物种的增强子区域。因此,我们迫切需要基于有限的实验验证数据的计算方法来挖掘增强子序列中关于转录调控编码功能的规律。从2006年由Genoffery Hinton首次提出深度学习(Deep Learning)的概念,到2012年Hinton团队的卷积神经网络(Convolutional Neural Network)模型在ImageNet图像识别比赛上大杀四方,再到2016年Alpha Go程序完胜人类围棋高手,这叁个事件彻底掀起了全球对人工智能技术的研究热潮。得益于近年来高性能CPU、GPU、FPGA等计算硬件的发展,深度学习高复杂度复杂的计算问题得以解决。同时,凭借着深度学习算法在提取不同层次的抽象特征、学习特征上的强大能力,配合当前海量的研究数据,它的性能已经远远超越传统的机器学习算法。深度学习已经在图像识别、自然语言处理、语音识别、量化交易等众多领域有着广泛应用。当然,深度学习算法也拓宽了生物医学领域的研究方法,近年来有不少如医学影像处理、药物靶标筛选、基因突变位点评估等问题通过深度学习方法获得不错的效果,并且相继发表了研究成果。在本文中,我们详细分析了顺式调控元件的研究现状,重点关注了增强子调控元件的相关的各种研究方法。随后,我们描述了使用机器学习、深度学习解决相关问题的一般方法以及它们之间的区别和优劣。通过分析利用机器学习、深度学习识别增强子调控元件的各类方法,我们发现其中存在着准确率低、泛化能力差、受限于数据来源等问题。因此,我们构建了一个基于深度学习的混合模型,起名为BiRen,它结合了卷积神经网络(CNN)对于序列数据的表示能力以及能够较好处理DNA序列长距离依赖问题的GRU单元双向循环神经网络(BRNN),通过这个模型,我们可以只依赖DNA序列本身就能准确识别增强子。BiRen的训练数据来自VISTA增强子数据库的有限的实验验证数据,数据库中增强子的增强效应在转基因小鼠上完成了验证。我们直接使用原始DNA序列来训练BiRen,与另外两个基于motifs或k-mers的最新的基于序列特征的模型比较,BiRen具有更高的准确率,并且能够有效避免噪声数据的干扰,同时在不同细胞系中也具有更好的泛化能力。我们的BiRen模型能够帮助研究人员对增强子序列带来更深层次的理解。(本文来源于《中国人民解放军军事医学科学院》期刊2017-05-27）
张莘,郭晓敏,常国斌,朱鹏飞,徐璐[8]（2017）在《鸡NLRC5启动子区转录调控序列的初步研究》一文中研究指出为了探讨NLRC5启动子的潜在调控机制,将NLRC5基因启动子系列缺失片段插入到pGL3-basic载体,构建重组质粒,并转染DF1细胞系。通过双荧光素酶实验寻找核心调控区,然后用目标捕获测序检测27个鸡品种的NLRC5核心启动子区的SNPs,并利用TRANSFAC,JASPAR和Meth Primer预测该区域的转录因子结合位点和CpG岛。结果显示,NLRC5启动子有2个核心区域,分别是1—617和1448—2108。第一个核心区域内存在3个SNPs,其中SNP1影响转录因子Hic1的结合序列,但SNPs对CpG岛不产生影响,表明NLRC5基因的启动子区的调控可能受不同因素的影响,但SNPs并不在甲基化的水平上影响启动子的活性。(本文来源于《浙江农业学报》期刊2017年03期）
李红星,景原雪,孙亮,王乃辉,宋德潇[9]（2016）在《唯支持细胞综合征患者睾丸组织Boule基因5'调控序列甲基化分析》一文中研究指出目的:探讨唯支持细胞综合征(SCOS)患者睾丸组织中Boule基因5'调控序列甲基化状态。方法:收集梗阻性无精子症患者(12例)和SCOS无精子患者(15例)睾丸组织穿刺标本,门诊检查排除精索静脉曲张、隐睾、感染等疾病。试剂盒法提取患者睾丸组织基因组DNA,利用生物信息学方法分析Boule基因5'调控序列的序列特征,采用亚硫酸氢钠测序法检测睾丸组织中Boule基因甲基化状态。结果:Boule基因5'调控区存在一个Cp G岛,SCOS患者Boule基因的甲基化水平(61.4%)显着高于梗阻性无精子症患者(21.7%)(P<0.01),共14个Cp G位点甲基化有显着性差异,分别为-58 bp、-50 bp、-48 bp、-38 bp、-28 bp、-24 bp、-20 bp、-15 bp、-1 bp、+5 bp、+8 bp、+15 bp、+29 bp和+58 bp。结论:SCOS患者Boule基因的甲基化水平显着高于梗阻性无精子症患者,推测这种甲基化变化可能与精子发生障碍有关。(本文来源于《中华男科学杂志》期刊2016年06期）
黄菁,朱志伟,陈晓宇,于福先,潘建治[10]（2016）在《鸡卵清蛋白基因调控序列的克隆与载体构建》一文中研究指出卵清蛋白(ovalbumin)基因在鸡基因组中只有一对等位基因,却能每天合成分泌多达2 g的蛋白,占据卵白蛋白质的50%以上,是外源基因载体表达调控构件的首选。该研究从输卵管特异性启动子方面着手,通过对卵清蛋白基因启动子的筛选优化,找出启动子增强因子的位置以及组织特异性区域。将卵清蛋白基因上游-922~-2 073和-2 801~-3 100区域平均分成12个长度约为150 bp的序列,分别插入到-921~+38序列的上游,成功构建12个系列表达载体,为进一步筛选短缩版优化启动子提供材料;卵清蛋白基因第一内含子区域截断成300 bp左右的迷你内含子序列,成功构建8个迷你内含子系列载体,为筛选优化的迷你内含子提供必要的材料;成功分离鸡输卵管上皮细胞并优化电转染条件,通过荧光素酶活性检测初步筛选出具有最强活性重组质粒pGL4-UP-1412和内含子重组质粒pGL4-mini-intron-3,同时推断出若干包含增强子序列区域。(本文来源于《浙江农业学报》期刊2016年03期）
调控序列论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
AKIRIN2作为一个高度保守的核内因子,通过与其它蛋白形成复合物来调控靶基因进而发挥生物学功能。目前,有关AKIRIN2蛋白研究主要是集中于肌肉发育和免疫调控领域,而对于akirin2基因自身转录调控机制研究未见报道。启动子和miRNA在目的基因的转录前和转录后调控过程中发挥关键作用,本研究以鸡为模式动物,克隆不同品系鸡akirin2基因5'-端上游2832 bp序列和3'-端下游417 nt序列,通过生物信息学分析预测获得miR-142-3p可能靶向akirin2基因3'非翻译区(3'UTR),综合分析miR-142-3p和miR-142-5p的表达与功能特性,主要研究结果如下:首先,本研究克隆了海蓝褐鸡、AA~+鸡和叁黄鸡的akirin2基因启动子区2832bp序列,并进行序列比对和生物信息学分析。结果表明:蛋鸡(海蓝褐鸡)和肉鸡(AA~+鸡和叁黄鸡)之间一共有38个SNP位点,而AA~+鸡和叁黄鸡之间只有4个SNP位点;通过转录因子预测发现,蛋鸡与肉鸡间的19个SNP位点导致了转录因子结合位点改变,进而导致蛋鸡和肉鸡在转录因子的种类和数量上存在差异;通过CpG岛预测发现,蛋鸡和肉鸡间CpG岛序列差异不大,但有较多的SNP位点分布在CpG岛内。推测不同品系鸡间的akirin2基因启动子调控机制存在差异。其次,本研究克隆了海蓝褐鸡、AA~+鸡和叁黄鸡的akirin2基因终止密码子下游3'UTR部分417nt序列,并进行序列比对和生物信息学分析。结果表明:叁个品系鸡中3'UTR部分序列完全一致,推测不同品系鸡akirin2基因的转录后调控机制相似,生物信息学预测发现miR-142-3p可能靶向3'UTR序列。最后,pri-miR-142部分序列分析表明:叁个品系鸡pri-miR-142序列完全一致。miR-142-3p/5p组织表达谱表明:叁个品系鸡中miR-142-3p/5p在各组织中广泛表达,miR-142-3p/5p的表达活性与组织发育和免疫功能相关,并且miR-142-3p相比miR-142-5p可能更具有功能多样性。miR-142-3p/5p在炎症模型和疫苗免疫模型的组织表达谱分析表明,miR-142-3p/5p均参与炎症反应和免疫应答,并且在不同免疫组织中发挥着不同的调控作用;miR-142-3p和miR-142-5p间表达活性差异可能与二者的功能特性、不同品系鸡性状以及不同病理过程等相关。本研究表明akirin2启动子序列SNP位点可能是影响不同品系鸡akirin2基因表达活性差异的关键因素之一。研究akirin2基因启动子及其相关miR-142表达与特性,对于深入理解akirin2基因表达调控机制和miR-142在炎症与免疫中的功能与应用,具有重要的理论和实践意义。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
调控序列论文参考文献
[1].施宏辉,蒲金定,何建行.非小细胞肺癌A549中lncRNA-CCAT1上游调控序列的Myc结合模式预测[J].实用癌症杂志.2019
[2].徐思凡.不同品系鸡akirin2基因调控序列及相关miR-142的克隆与表达分析[D].哈尔滨师范大学.2019
[3].何佳静.冠心病相关SLC22A3基因中新发现负性调控序列的性质与功能鉴定[D].重庆医科大学.2019
[4].石晴,朱德锐.Halomonassp.QHL1四氢嘧啶合成基因簇ectABC与上游调控序列的克隆及其功能分析[J].中国高原医学与生物学杂志.2019
[5].邳晓盟,刘庆珍,吴尽,肖慧,郑冬.鼠源miR-148a基因上游调控序列预测及克隆[J].黑龙江畜牧兽医.2017
[6].苏波.绵羊毛囊皮质层特异表达基因KAP11.1上游调控序列研究[D].华中农业大学.2017
[7].杨比特.基于深度学习的增强子调控序列识别研究[D].中国人民解放军军事医学科学院.2017
[8].张莘,郭晓敏,常国斌,朱鹏飞,徐璐.鸡NLRC5启动子区转录调控序列的初步研究[J].浙江农业学报.2017
[9].李红星,景原雪,孙亮,王乃辉,宋德潇.唯支持细胞综合征患者睾丸组织Boule基因5'调控序列甲基化分析[J].中华男科学杂志.2016
[10].黄菁,朱志伟,陈晓宇,于福先,潘建治.鸡卵清蛋白基因调控序列的克隆与载体构建[J].浙江农业学报.2016
论文知识图
