胰腺癌患者中miR-34a表达及其靶基因生物信息学分析

论文摘要

目的:应用生物信息学分析方法检测miR-34a及其靶基因在胰腺癌发生发展过程中的作用。方法:运用Oncomine工具检测胰腺癌患者miR-34a靶基因差异表达水平;使用miRecords在线软件进行靶基因预测,并结合Genecards数据库中胰腺癌相关基因,对所得到的靶基因进一步进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果:miR-34a在胰腺癌患者中表达水平明显降低,其核苷酸序列在多物种间呈高度保守性,受miR-34a调控且与胰腺癌相关的潜在靶基因共73个,包括BCL2、MYC、Met、CDK6、SIRT1等。GO分析发现miR-34a的靶基因参与生物过程调节、细胞过程调节、器官发育、多细胞有机体发育、系统开发、胚胎发育等多个生物过程; KEGG分析发现miR-34a显著富集在结肠癌通路、小细胞肺癌通路、膀胱癌通路、Notch、Wnt等信号通路中。结论:miR-34a通过靶向作用及其靶基因调控,影响胰腺癌患者体内多种信号通路的网络调控,从而参与胰腺癌疾病的发生和发展。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王丹,沙岩,葛东伟

关键词: 胰腺癌,靶基因,生物信息学

来源: 中国免疫学杂志 2019年10期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技,基础科学

专业: 生物学,肿瘤学

单位: 徐州医科大学医学信息学院

基金: 江苏省博士后科研资助计划(1601080C),江苏省高校自然科学研究面上项目(17KJB310015),江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目(201810313071H),徐州医科大学优秀人才科研启动基金(D2015001)资助

分类号: R735.9;Q811.4

页码: 1255-1259

总页数: 5

文件大小: 1181K

下载量: 262

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