一种用于蛋白质检索的运用混合谱特征的形状描述符

一种用于蛋白质检索的运用混合谱特征的形状描述符

论文摘要

蛋白质的不同构像及结构变化使得传统的形状描述算法在蛋白质数据集上的检索效果并不理想。为了提高检索性能,提出了一种新的基于混合谱特征的蛋白质形状描述符及蛋白质检索框架,该方法结合了Wave Kernel Signature和Heat Kernel Signature产生新的Bag of Feature,即WKS_HKS算法。对WKS_HKS算法和现有的几种形状描述算法在三个不同类型的分子数据集上进行了综合比较。实验结果表明,该算法比单一的算法的检索效果更好,并优于几种对比的形状描述算法。

论文目录

  • 1 方法
  •   1.1 Wave Kernel Signature
  •   1.2 Heat Kernel Signature
  • 2 混合谱特征提取及形状描述
  • 3 实验分析
  •   3.1 评价指标介绍
  •   3.2 SHREC2018数据集实验结果对比
  •   3.3 MolMovDB和FSSP数据集的试验结果
  • 4 结束语
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 彭玉旭,张广平,夏卓群

    关键词: 形状描述,波核签名,热核签名,混合谱签名,蛋白质检索

    来源: 长沙理工大学学报(自然科学版) 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学,信息科技

    专业: 生物学,计算机软件及计算机应用

    单位: 长沙理工大学综合交通运输大数据智能处理省重点实验室,长沙理工大学计算机与通信工程学院

    基金: 湖南省自然科学基金资助项目(2019JJ40314),长沙理工大学青年教师成长计划项目(2019QJCZ014)

    分类号: Q51;TP301.6

    页码: 84-89

    总页数: 6

    文件大小: 689K

    下载量: 21

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