导读:本文包含了基因识别论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,景观,村落,传统,可控性,聚落,海防。
基因识别论文文献综述
肖宝芳,黄美云,叶菁,尹久娜,陈凌艳[1]（2019）在《平潭濒海传统村落景观基因识别与特征研究》一文中研究指出平潭濒海传统村落整体风貌古朴沧桑,遍布花岗岩石头厝,极具地域特色。本文从自然因素和人文因素两方面探讨平潭濒海传统村落的形成原因,并基于景观基因识别理论和方法,从整体布局形态、民居特征、主体性公共建筑、环境因子等方面,利用元素、图案、结构和含义四个提取方法,对平潭濒海传统村落的景观基因进行分析归纳,以期为平潭濒海传统村落景观在当前城市化建设浪潮下得以较好传承提供依据。(本文来源于《南方园艺》期刊2019年06期）
王银霞,吴林汉昕,叶凌颖,魏昱君,陈祖建[2]（2019）在《闽南传统村落的景观基因识别与构建——以福建省泉州市土坑村为例》一文中研究指出福建闽南地区拥有久远的历史与优越的自然地理环境,造就了它独特的传统聚落文化。本文以福建省泉州市土坑村为例,从景观基因视角出发,分析土坑村的物质景观元素及非物质景观元素,识别并梳理土坑村的景观基因脉络,构建其景观基因图谱,为今后传统村落保护与更新研究提供参考与借鉴。(本文来源于《福建建设科技》期刊2019年05期）
刘毅[3]（2019）在《泉州沿海传统村落景观基因识别与特征研究》一文中研究指出传统村落作为中华文化的重要载体,具有丰富的历史文化价值。面对地域景观均质化问题,本文以景观基因的研究视角切入,选取泉州沿海地区4个代表性沿海村落景观进行了调查和研究,研究建立景观基因识别体系,识别了沿海传统村落的自然环境、布局、建筑和历史文化景观基因;分析泉州沿海传统村落的景观基因构成及特点,为传统村落后续的旅游发展、保护规划提供研究基础。(本文来源于《中外建筑》期刊2019年07期）
王婉宁[4]（2019）在《基于复杂网络结构可控性的致病基因识别方法研究》一文中研究指出复杂网络指从真实复杂系统中抽象出的具有拓扑结构的一类网络,如社交网络、交通网络、生物网络等。近年来,随着控制理论的发展和成熟,复杂网络的结构可控性研究逐渐成为一个热点。已有研究表明,复杂网络的结构可控性分析在识别潜在致病基因和药物靶标方面具有实际应用价值。本文基于复杂网络结构可控性模型,提出了一种新的可控性节点分类框架,并将该框架应用于人体组织特异的调控网络中,系统性地检测具有显着生物意义的致病基因,为进一步的疾病诊疗提供工具平台。论文的主要内容如下:首先,基于结构可控性模型提出新的可控性节点分类框架。针对复杂网络,从控制的不同角度可以对网络节点有不同的分类方法:(1)基于可控性的节点分类方法;(2)基于控制能力的节点分类方法;(3)基于控制功能来源的节点分类方法;(4)基于控制边鲁棒性的节点分类方法。据此,构建一个四维向量,其中每个分量表示一种节点分类方法。其次,发现了候选疾病基因。针对32个人体组织特异的调控网络,应用可控性节点分类框架将基因分为控制角色差异的不同类型;接着对每种类型的基因在已知功能的金标准数据集上进行统计显着性分析、验证,发现了一类新的具有显着生物意义的基因类型,并将其定义为候选疾病基因。更进一步,根据组织和疾病的对应关系,从候选疾病基因中筛选出组织相关疾病特异基因,通过分析组织上的疾病特异基因的组织差异性以及文献挖掘和GO条目验证,说明了筛选出的疾病特异基因确实与组织疾病关系密切。本文基于复杂网络结构可控性模型,提出了一种新的可控性节点分类框架。并将该框架应用于人体组织特异的调控网络中,找出了具有生物意义的基因类型即候选疾病基因,同时进一步分析了候选疾病基因与疾病的相关性,实验结果表明本文提出的可控性节点分类框架有助于识别疾病相关基因。(本文来源于《西安理工大学》期刊2019-06-30）
赵梦颖[5]（2019）在《基于隐马尔科夫随机场模型的油菜胁迫响应关键基因识别》一文中研究指出油菜的含油量高达百分之五十,是一种重要的油料经济作物,广泛的种植于世界各地.但恶劣的环境会严重的影响油菜的生长发育和产量.在各种非生物胁迫条件(如低温,高温,干旱,盐碱性,脱落酸)中,干旱胁迫是油菜生长发育过程中一个非常常见的不利因素.因此:研究油菜在干旱条件下的生理响应机制具有重要意义.而利用油菜转录组数据构建基因共表达网络研究油菜响应胁迫关键基因的方法则是一个很好的工具.本文利用油菜在干旱处理条件下的转录组数据,依据重连惩罚原则,即:响应胁迫的基因之间在共表达关系上会发生重连.之后基于共表达网络,利用隐马尔科夫随机场模型对油菜干旱响应基因进行了分析研究.首先,本文的数据是我们课题组和生科院合作的,利用Illumina Hiseq 4000平台对油菜的18个样本进行转录组测序得到的,其中包括15个处理组和3个未处理组(空白组),15个处理组样品包括5种处理条件(低温,高温,干旱,盐碱性,脱落酸),每组条件下3次生物学重复.本文主要利用的是油菜在干旱胁迫条件和未处理(空白组)条件下的6个油菜样本的转录组数据.将转录组测序数据中未表达基因以及表达差异不显着的基因删除,最终筛选出了 2590个在干旱胁迫条件下有响应的基因.其次,基于上述筛选得到的油菜干旱响应基因,利用t检验得到基因之间的相似度矩阵,构建基因的共表达网络,并利用Fisher变换建立重连网络.进一步的利用隐马尔科夫随机场模型将基因的共表达网络和根据油菜样本进行t检验得到的p值数据进行整合,最终识别出在干旱胁迫条件下472个油菜胁迫响应关键基因.最后,将PageRank,介中心性,隐马尔科夫随机场模型等7种方法计算得到油菜响应的关键基因,利用ROC曲线进行比较研究,结果表明,隐马尔科夫随机场模型相比于其它几种方法能更好的识别油菜在干旱胁迫条件下转录组数据中的响应关键基因.进一步通过对油菜响应基因的GO富集分析,发现利用隐马尔科夫随机场模型识别的响应基因富集于和植物干旱胁迫响应相关的生物过程中.将重连网络和共表达网络进行比较分析,发现在重连网络中响应基因更有可能发生重连;重连网络中包含的基因的信息量更大,隐马尔科夫随机场模型充分的利用了各种生物信息,将网络中各种信息进行整合.通过这一系列的研究分析,识别出油菜在干旱条件下的响应关键基因,不仅有利于人们对油菜在干旱环境下生理过程的了解,更有助于人们对油菜品种的改良.(本文来源于《河南大学》期刊2019-06-01）
后雪峰,屈清,李德宜[6]（2019）在《潮汕传统村落景观基因识别及特征分析》一文中研究指出中国传统村落蕴藏着丰富的历史文化信息与自然生态景观资源,进行传统村落景观基因识别可揭示传统村落景观的外在表达和内在特质,对中国传统文化的保护与传承具有重要意义。以潮汕传统村落为研究对象,构建村落景观基因识别指标体系,从建筑、形态布局、文化信仰方面分析潮汕传统村落景观基因特征。结果表明:潮汕传统村落主要是以单姓图腾形成宗族血缘关系为纽带的聚居村落,以祠堂为中心,中轴对称,聚集性、向心性突出;在形态基因上形成列式、组团式、集中式、厝包式、围合式5种空间形态布局类型;重宗法制度、信朴素自然观、多元信仰崇拜是潮汕传统村落文化景观基因的基本特征。研究以期为区域传统村落规划、人居环境建设,村落遗产保护与可持续开发利用提供参考。(本文来源于《贵州师范大学学报(自然科学版)》期刊2019年03期）
曾娟[7]（2019）在《明清海防聚落景观文化遗产基因识别及意义》一文中研究指出海防聚落景观文化遗产是我国明清时期遗留下来的独特的军事文化遗产,需要从更宏观、更系统的角度去认识。海防聚落景观文化遗产目前存留情况比较复杂.各地差异性较大;景观现状存在着孤岛化、破碎化和边缘化的特征,各界对此类文化遗产认识也有一定差异。结合生物学基因的识别方法,尝试用主体显性基因、主体隐性基因、附着显性基因.附着隐性基因、混合基因、变异基因的方法来辨析海防聚落景观遗产。对于海防景观文化遗产价值评定而言,其最核心的"DNA"是围绕海防而展开的军事文化,也就是说可以依据与军事文化的相关紧密程度来作为判断其价值核心与否的重要因素。把生物基因研究相关方法结合到海防聚落景观文化的基因识别中来,对判定遗产保护工作中的轻重缓急有一定的助益。(本文来源于《中国文化遗产》期刊2019年02期）
陈秋渝,杨俊熙,罗施贤,孙大江[8]（2019）在《川西林盘文化景观基因识别与提取》一文中研究指出文化景观是文化地理特征的集中体现,川西林盘文化景观基因识别与提取的研究是对林盘本质的认知和解读。根据文化景观的关键特征,基于文献与实地考察,综合运用问卷与半结构式访谈等方式进行调查,借助SPSS软件进行数据统计和处理,客观地明晰了林盘文化景观的结构组成;并在此基础上引入"景观基因"理论,以川西林盘的文化景观为研究对象,从遗传信息的表达,以及基因所属位列、功能性和重要度2个层面进行了相应的分类,进一步阐释了识别与提取的方法与流程。同时,在土地利用数据、卫星影像及地理信息数据电子地图等资料的辅助下,以新津、温江、崇州林盘群系与鱼子孔、龚林盘和胥家院子聚落单元为例,进行了文化景观基因的识别,归纳梳理出其共性基因、个性基因,并提取出民居、渠系、林地等主体基因,菜地、井等胞质基因、石笼、平桥等附着基因和治水工程、移民文化等调节基因。(本文来源于《热带地理》期刊2019年02期）
惠影[9]（2019）在《基于转录网络关系和结构的癌症驱动基因识别》一文中研究指出新一代测序技术的突破性进展导致海量癌症基因组数据的产生。因此目前癌症基因组学面临的关键挑战之一是以最有效和有意义的方式分析和整合这些信息,以促进癌症生物学的发展,然后将这些知识应用到临床上。之前的癌症基因组测序实验旨在列举癌症中的所有体细胞突变,将其中一些突变作为可操作的基因组异常,据此开发和应用靶向治疗。而现在癌症基因组学中的一个重要任务是如何区分导致肿瘤发生的“驱动”突变和功能中性的“乘客”突变。为了解决这一重要任务,在过去的几年中开发了许多方法和计算工具,目前基于网络识别癌症驱动突变的方法占据主流位置。虽然研究者们提出了众多有效区分驱动突变和乘客突变的策略,但是算法精确度依然有待提高。本文主要研究设计高效的癌症驱动突变识别算法,主要工作总结如下:第一,提出了一种基于二部图传播模型的癌症驱动基因识别算法,衡量突变和差异表达对转录网络的影响,从而识别出潜在的癌症候选驱动基因。首先,我们采用表达数据、单核苷酸突变数据和蛋白质-蛋白质相互作用网络为每个病人构建二部图模型;然后,基因得分通过迭代过程在二部图上传播,我们得到了每个病人基因的得分;最后,采用孔德赛排序的方法得到整个病人集中最具有影响力的潜在驱动基因。第二,提出一种基于网络局部中心性的算法来评估突变基因对基因表达模式变化的影响。通过影响性高低来对突变基因进行排序并最终选出候选驱动基因。首先,通过比较肿瘤样本和正常样本的表达谱得到群体中差异表达的基因;然后,参考分子相互作用网络使用差异表达基因和突变基因为每个突变基因构建局部网络;再次,在构建的网络中计算突变基因的局部中心性得分;最后,根据这个得分对突变基因进行排序并且选出驱动基因。与现有的方法相比较,本论文提出的方法能识别更多的驱动基因,具有更高的识别精度,且识别的候选驱动基因要么与癌症存在直接的联系,要么在特定的生物学功能或通路上协同工作,这就说明本论文识别到的候选驱动基因具有特定的有生物学意义。(本文来源于《安徽大学》期刊2019-03-01）
祁剑青,邓运员,贺建丹[10]（2018）在《苗族传统聚落的景观基因识别及其地学视角的解析》一文中研究指出基于聚落景观基因理论与方法,提炼出苗族传统聚落景观基因:传统民居以吊脚楼最具代表性,细部装饰集中在入口、退堂、门窗、栏板、吊柱、檐口及屋脊等处;聚落的布局形态有山顶型、山腰型和河岸型等叁种类型;主体性公共建筑有寨门、岩菩萨、保寨树、保爷桥、芦笙场、铜鼓坪、鼓房、船廊等;苗族巫教文化特色显着。苗族传统聚落景观与区域自然地理环境与社会文化环境密切相关:传统民居适应了中亚热带季风湿润气候,有极强的适应山地地形的能力;苗族聚族而居,聚落具有向心性;苗族传统聚落的装饰与中国传统文化的道德观、吉祥观都紧密相连;苗族在迁徙过程中融合了其他民族的建筑风格,体现了多元建筑文化景观的特点。(本文来源于《衡阳师范学院学报》期刊2018年06期）
基因识别论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
福建闽南地区拥有久远的历史与优越的自然地理环境,造就了它独特的传统聚落文化。本文以福建省泉州市土坑村为例,从景观基因视角出发,分析土坑村的物质景观元素及非物质景观元素,识别并梳理土坑村的景观基因脉络,构建其景观基因图谱,为今后传统村落保护与更新研究提供参考与借鉴。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因识别论文参考文献
[1].肖宝芳,黄美云,叶菁,尹久娜,陈凌艳.平潭濒海传统村落景观基因识别与特征研究[J].南方园艺.2019
[2].王银霞,吴林汉昕,叶凌颖,魏昱君,陈祖建.闽南传统村落的景观基因识别与构建——以福建省泉州市土坑村为例[J].福建建设科技.2019
[3].刘毅.泉州沿海传统村落景观基因识别与特征研究[J].中外建筑.2019
[4].王婉宁.基于复杂网络结构可控性的致病基因识别方法研究[D].西安理工大学.2019
[5].赵梦颖.基于隐马尔科夫随机场模型的油菜胁迫响应关键基因识别[D].河南大学.2019
[6].后雪峰,屈清,李德宜.潮汕传统村落景观基因识别及特征分析[J].贵州师范大学学报(自然科学版).2019
[7].曾娟.明清海防聚落景观文化遗产基因识别及意义[J].中国文化遗产.2019
[8].陈秋渝,杨俊熙,罗施贤,孙大江.川西林盘文化景观基因识别与提取[J].热带地理.2019
[9].惠影.基于转录网络关系和结构的癌症驱动基因识别[D].安徽大学.2019
[10].祁剑青,邓运员,贺建丹.苗族传统聚落的景观基因识别及其地学视角的解析[J].衡阳师范学院学报.2018
论文知识图
