论文摘要
本研究首先利用HMMER软件对从植物基因组网站phytozome上下载的16种植物的基因组进行检索,再利用Pfam和SMART数据库进一步验证,最终获得91个Bowman-Birk基因。随后进行理化性质分析、系统发育分析、染色体定位及表达分析等。多序列比对结果表明CCD在Bowman-Birk抑制剂中保守性最高,此外多个位点的Cys也具有一定程度的高保守性,表明二硫键在维持Bowman-Birk抑制剂的结构稳定性和抑制活性发挥了至关重要的作用。系统发育分析的结果显示Bowman-Birk基因分为单子叶植物和双子叶植物2个簇,表明Bowman-Birk基因家族的基本特征在单双子叶植物分离之前就已经形成。EST表达分析结果表明Bowman-Birk在不同植物组织中的表达具有差异性,例如大豆的Bowman-Birk基因主要在豆荚中表达,其次是种子,而水稻主要在叶和根中表达。由于豆荚和叶等组织易受到昆虫侵食,因此在这些部位表达Bowman-Birk蛋白酶抑制剂基因有助于增强植物对昆虫的抗性。而种子和根等器官与植物生长发育密切相关,因此Bowman-Birk抑制剂在种子和根中的高表达可能与植物逆境胁迫响应相关。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 廖东颖,古袁扬,李超林,邓银,周嘉裕,廖海
关键词: 植物,生物信息学分析
来源: 分子植物育种 2019年11期
年度: 2019
分类: 农业科技,基础科学
专业: 生物学
单位: 西南交通大学生命科学与工程学院
基金: 国家自然科学基金(31500276),四川省重点研发项目(2018SZ0061),四川省应用基础研究项目(2017JY0222),成都市科技技术研发项目(2015-HM01-00051-SF,2016-HM01-00260-SF)共同资助
分类号: Q943
DOI: 10.13271/j.mpb.017.003524
页码: 3524-3532
总页数: 9
文件大小: 2846K
下载量: 110
相关论文文献
- [1].Bowman's Judgment and Discovery[J]. 校园英语 2016(02)
- [2].单纯性肾小球Bowman囊弥漫性增厚病理特点[J]. 华中科技大学学报(医学版) 2010(06)
- [3].从Bowman案看美国专利权用尽原则的历史演变[J]. 知识产权 2014(08)
- [4].Bowman-Brik胰蛋白酶抑制剂在水稻叶片生长和种子萌发过程中的表达[J]. 农业生物技术学报 2012(03)
- [5].基于插件的Bowman & CANEs服务合成[J]. 微型机与应用 2010(20)
- [6].Bowman v.Monsanto Co.[J]. 知识产权法研究 2014(01)
- [7].Bowman-Birk蛋白酶抑制剂的固相合成及酶抑制动力学评价[J]. 海峡药学 2013(01)
- [8].美国著名游泳教练员Bob Bowman的执教特征分析[J]. 成都体育学院学报 2017(02)
- [9].Bowman-Birk inhibitors from legumes as colorectal chemopreventive agents[J]. World Journal of Gastroenterology 2014(30)
- [10].“Alone” VS. “Lonely”:Eudora Welty's Idyllic View on Life inDeath of a Traveling Salesman[J]. 海外英语 2013(18)
- [11].漫游反应:第三种路径[J]. 物理 2011(11)
- [12].豆浆成分对Bowman-Birk胰蛋白酶抑制剂热失活程度的影响[J]. 食品科学 2020(16)
- [13].Author index WJEM 2015[J]. World Journal of Emergency Medicine 2015(04)
- [14].书架[J]. 收藏 2014(16)
- [15].大豆胰蛋白酶抑制剂Bowman-Birk基因家族新等位变异分析[J]. 中国科学(C辑:生命科学) 2008(06)
- [16].全球腐蚀成本调研项目中美合作协议签约仪式在北京举行[J]. 表面工程资讯 2014(04)
- [17].黑豆种子中一种耐热型胰蛋白酶抑制剂的分离及性质表征[J]. 中国生物化学与分子生物学报 2011(01)