基于高通量测序技术分析凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)冷藏过程菌群结构变化

基于高通量测序技术分析凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)冷藏过程菌群结构变化

论文摘要

目的揭示凡纳滨对虾(4±1)℃条件下贮藏过程中菌群结构的变化规律,为其贮运保鲜提供参考。方法采用高通量测序技术对不同冷藏期凡纳滨对虾中的细菌种类及其丰度迚行分析。结果凡纳滨对虾初始菌群以鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)、金黄杆菌属(Chryseobacterium)和寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)为主;冷藏过程中,Sphingobacterium、Chryseobacterium、Stenotrophomonas比例迅速减少,系统迚化关系上比较接近的交替假单胞菌属(Pseudoalteromonas)、希瓦氏菌属(Shewanella)和别弧菌属(Aliivibrio)成为优势菌,其中Aliivibrio的比例相对稳定,Shewanella比例呈先增加后减少的趋势,Pseudoalteromonas比例不断增加,可能在凡纳滨对虾腐败过程中起重要作用。结论高通量测序可以更加全面反映凡纳滨对虾中菌群的组成及其丰度信息,Pseudoalteromonas是凡纳滨对虾冷藏过程的优势腐败菌。

论文目录

  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  •   2.1 试验材料仪器及试剂
  •   2.2 试验方法
  •     2.2.1 细菌DNA提取与PCR扩增
  •     2.2.2 测序与数据处理
  •     2.2.3 物种注释与数据分析
  • 3 结果与分析
  •   3.1 细菌DNA提取与PCR扩增结果
  •   3.2 物种注释
  •   3.3 OTUs聚类分析
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 曹荣,林瑞环,赵玲,孙慧慧,刘淇

    关键词: 凡纳滨对虾,菌群结构,高通量测序

    来源: 食品安全质量检测学报 2019年08期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑

    专业: 轻工业手工业

    单位: 中国水产科学研究院黄海水产研究所,海洋国家实验室海洋药物与生物制品功能实验室

    基金: 国家重点研収计划项目(2018YFD0901004),中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费项目(20603022018028)~~

    分类号: TS254.4

    页码: 2127-2131

    总页数: 5

    文件大小: 532K

    下载量: 214

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