猪链球菌微滴数字PCR定量检测方法的建立

猪链球菌微滴数字PCR定量检测方法的建立

论文摘要

根据猪链球菌(Streptococcus suis,SS)gdh基因的保守序列设计特异性引物和Taq Man探针,通过反应条件优化和特异性、敏感性、重复性试验以及临床样品的检测,建立可对其准确定量的微滴数字PCR(droplet digital PCR,dd PCR)检测方法,并与实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法进行比较分析。结果表明,该方法特异性良好,与猪传染性胸膜肺炎放线杆菌、副猪嗜血杆菌、大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、猪圆环病毒2型和伪狂犬病毒无交叉反应;灵敏度优于qPCR,线性相关系数(R2)为0.991,呈良好线性关系,最低可检测到2.692 copies/μL的阳性质粒;稳定性好,变异系数为1.66%。临床样品定量检测结果表明,dd PCR具有敏感性高、特异性好等优点,能对qPCR检测的可疑样品进行精确定量。本研究建立的dd PCR能够准确定量检测SS,将为SS相关研究提供有益参考。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 实验菌株
  •     1.1.2 主要试剂
  •     1.1.3 主要设备
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 探针和引物设计
  •     1.2.2 SS标准品制备
  •     1.2.3核酸的提取
  •     1.2.4 q PCR反应体系和条件
  •     1.2.5 dd PCR反应体系和条件优化
  •     1.2.6 特异性试验
  •     1.2.7 重复性试验
  •     1.2.8 数据统计
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 q PCR方法建立
  •   2.2 dd PCR反应条件的确定
  •   2.3 dd PCR扩增
  •   2.4 标准曲线和最低检测限
  •   2.5 特异性分析
  •   2.6 重复性分析
  •   2.7 临床样品的检测
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 石磊,温雯,陈洵,叶蕾,常彦磊,李丽丽

    关键词: 猪链球菌,微滴数字,检测方法

    来源: 现代食品科技 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学,农业科技

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 暨南大学食品安全与营养研究院

    基金: 国家重点研发计划项目(2016YFD0500600),广东省科技计划项目(2017B020207004),中央高校基本科研业务费项目(2017MS104,21618309)

    分类号: S852.611

    DOI: 10.13982/j.mfst.1673-9078.2019.1.033

    页码: 233-238

    总页数: 6

    文件大小: 1589K

    下载量: 220

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