导读:本文包含了快速拷贝论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:地中海,定量,基因,快速,荧光,右键菜单,目的。
快速拷贝论文文献综述
郑丽君,李新伟,卜旭辉[1](2017)在《基于尺度不变特征变换的快速图像拷贝检测》一文中研究指出针对传统基于尺度不变特征变换(SIFT)特征的图像拷贝检测算法特征提取速度慢、匹配效率不高的问题,提出了一种基于SIFT特征点位置分布与方向分布特征的快速图像拷贝检测算法。首先,提取SIFT特征点二维位置信息,通过计算各个特征点与图像中心点的距离、角度,分块统计各区间的特征点数量,依据数量关系量化生成二值哈希序列,构成一级鲁棒特征;然后,根据特征点一维方向分布特征分块统计各方向子区间特征点数量,依据数量关系构成二级图像特征;最后,拷贝检测时采用级联式过滤框架作出是否为拷贝的判断。仿真实验结果表明,与传统SIFT以128维特征描述子为基础构建哈希序列的图像拷贝检测算法相比,所提算法在保证鲁棒性与独特性不降低的同时,特征提取时间缩短为原来的1/20,匹配时间也缩短了1/2以上,可满足在线拷贝检测的需求。(本文来源于《计算机应用》期刊2017年12期)
树叶[2](2017)在《为快速拷贝文件助力》一文中研究指出在文件大小动辄GB级别的今天,利用Windows系统内置的文件复制功能传输文件时,常常会显得力不从心,操作效率十分低下。特别是在文件拷贝操作突然被中断的情况下,先前已经拷贝传输过的文件内容或许会全部消失,不幸遇到这类问题时,用户只能重复拷贝一次。利用Windows系统内置的文件拷贝功能,传输文件简单得几乎不值一提,只需动动鼠标即可。不过,使用该功能传输尺(本文来源于《个人电脑》期刊2017年11期)
刘翊[3](2017)在《一种快速拷贝数据到FAT分区的方法》一文中研究指出本方案先将拷贝数据制作成最小FAT32分区镜像文件(最小指刚好存放下拷贝数据,没有冗余空间)。接着在写入镜像文件前获取实际分区容量,根据获取到的分区容量调整镜像文件中的FAT32数据,然后按FAT32分区的组织顺序(FAT32分区由保留区、FAT1区、FAT2区和数据区组成)依次将镜像文件中的保留区、FAT1区、FAT2区和数据区内容写入到分区。此方法的写入过程是直接调用磁盘驱动的扇区读写接口,去掉了文件系统层的开销。提前制作好FAT32镜像可以省去拷贝前格式化分区的时间,而分区容量不同带来的修改开销很少。如果写入的设备有自己的驱动程序并提供扇区的读写接口,那么也可以不通过标准磁盘读写接口进行写入,解决一台PC最多同时存在26个盘符的限制。(本文来源于《电子世界》期刊2017年11期)
马晓霞[4](2015)在《原始模板封闭荧光定量PCR快速检测拷贝数变异》一文中研究指出研究背景基因拷贝数变异(copy number variation,CNV)是指人类基因组DNA片段大小范围从kb到Mb的亚微观突变,主要表现为缺失或重复。CNV的形成机制主要包括DNA重组与DNA错误复制两大类。DNA重组主要包括非等位同源重组和非同源末端连接。非等位同源重组是不同基因组位置的同源序列交换导致的,主要发生在减数分裂过程中;与非等位同源重组不同的是,非同源末端连接不需要同源序列作为底物,并且可以在连接部位插入碱基。DNA错误复制发生在DNA复制叉停滞时,滞后链从一个复制叉上脱落,通过同源序列转移到另一个空间位置上接近的复制叉。CNV是基因组结构变异(structura1 variation,SV)的重要组成部分,广泛存在正常人类基因组中,是人类遗传多样性与个体间遗传差异的一个重要原因,除了构成遗传多态性外,它还是人类疾病的重要致病因素之一。研究发现,CNV可以导致孟德尔遗传的单基因疾病、罕见疾病,也与复杂疾病相关,其可能通过影响基因的表达量、改变基因产物的结构和位置效应等机制参与疾病的发生和发展,是一种可能具有致病性、良性或未知临床意义的基因组改变。由CNV所导致的常见疾病有我国南方两广地区高发的α-地中海贫血、唐氏综合症、猫叫综合症、自闭症、脊髓性肌萎缩症等疾病。CNV作为一种参与疾病发生发展的新型基因组结构变异形式,对其进行快速准确的检测在临床上具有非常重要的意义。目前,用来检测CNV的方法有比较基因组杂交技术(array comparative genomic hybridization,aCGH)、荧光原位杂交(customized fluorescence in situ hybridization,FISH)、多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)、新一代测序技术(next-generation sequencing,NGS)和数字化 PCR 分析(digital PCR analysis)等。然而,就目前的研究进展,不管使用哪一种检测方法,都存在优势和局限性,其中费用高和操作繁琐是最大的限制。CNV的检测是疾病相关基因的拷贝数检测,任何一种分子诊断方法的最终目的都是为了确定目的基因的缺失或重复情况。本研究的目的是建立一种快速准确简单高通量低成本检测CNV的新途径新方法,有效解决目前检测方法存在的局限性。研究方法根据CNV致病的分子基础,只要能准确分析疾病相关基因的缺失或重复情况,就能准确诊断疾病。近些年来,实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)因其快速高通量、无后续处理不存在污染等优点被广泛应用于临床检测,该方法也用于CNV检测。根据PCR扩增公式:Xn=X0*(1+Ex)”,当扩增效率(Ex)为100%,初始模板拷贝数(X0)为1时,达到目的拷贝数(Xn)8,所需要的循环数(8=1*2n)为3;当初始模板拷贝数(X0)为2时,达到目的拷贝数(Xn)8,所需要的循环数(8=2*2n)为2;当初始模板拷贝数(X0)为3时,达到目的拷贝数(Xn)8,所需要的循环数(8=3*2n)为1.42。这样,理论上来说,3拷贝与1拷贝(拷贝数差异为3倍)的定量检测Ct值差异有1.58;2拷贝与1拷贝(拷贝数差异为2倍)的定量检测Ct值差异有1;而3拷贝与2拷贝(拷贝数差异为1.5倍)的定量检测Ct值差异只有0.58。由此可见,这种传统的荧光定量PCR方法对于拷贝数差异倍数较小,如1.5倍差异的CNV并不能得到清晰准确的检测结果,容易导致假阴性。为解决这样的技术瓶颈,我们首次提出建立“原始模板封闭荧光定量PCR快速定量拷贝数”的检测方法。根据此方法学研究策略,具体实施了以下研究方案与方法。1.进行原始模板封闭处理。假设某一特定目的片段于正常样本中存在4个拷贝,而于待检样本中存在6个拷贝,那么待检样本与正常样本(对照样本)的原始拷贝数比值为1.5倍,通过传统实时荧光定量PCR检测,只获得0.58个Ct值的差异,该微小差异并不能清晰反应样本间存在的差异。如果待检样本和对照样本中各有2个拷贝被封闭住不做为模板进行后续的PCR扩增,那么这两个样本中的拷贝数将分别为4(6-2)和2(4-2),即原始拷贝数比值转化为2.0倍,通过实时荧光定量PCR检测,可获得1个Ct值的差异,该差异可以清晰反应样本间存在的差异。基于这样的实验设想,我们首次提出“封闭原始模板”的处理,该处理的原理是:在代表性DNA片段内,分别设计覆盖上下游引物结合区域的寡核苷酸序列,并于寡核苷酸序列的3'端加入1-3个与模板非互补的碱基,并且在寡核苷酸序列的3'端进行spacer C3修饰。这种经过人工修饰的寡核苷酸序列,我们将其定义为“封闭探针”,在PCR扩增反应过程中,封闭探针通过互补序列与检测模板结合,但因为3'端碱基与模板序列不匹配,以及spacerC3的修饰作用阻止Taq酶5'-3'DNA聚合酶活性,使其不能够进行延伸。2.建立叁重荧光定量PCR体系。本研究以21号染色体叁体综合症,即唐氏综合症为疾病模型,该病患者的基因型与正常基因型相比,拷贝数变异为1.5倍。选择唐氏综合症关键区域相关基因DSCR3、DSCR4为目的基因,管家基因GAPDH为内参基因,采用ACt值相对定量方式,同时分析目的基因DSCRJ、DSCR4的相对拷贝数。实时荧光定量PCR技术利用指数增长期的Ct值计算模板的相对原始拷贝数,原始拷贝数越多,Ct值越低。对于一正常样本,DSCR3、DSCR4与GAPDH的拷贝数相等,Ct值的差异(△Ct)恒定;如果待检样本为唐氏综合症患者,其唐氏综合症关键区域相关基因,如DSCR3、DSCR4拷贝数增加而Ct值减低,则与GAPDH的△Ct值也将增大。从理论及数据分析原理上,可根据相对定量方式准确分析目的基因的重复情况以达到疾病的诊断目的。所采用的ACt值相对定量方式,是基于固定体积和固定浓度gDNA标本中,目的基因和内参基因拷贝数的比例。为消除单独分管检测时,由于各管加入模板量的差异而导致的Ct值误差,本研究建立叁重实时荧光定量PCR体系,在相同模板量、相同扩增条件下同时检测目的基因和内参基因。为保证叁重荧光定量PCR体系的高特异性及高扩增效率,采用“模板预扩增”处理,即先以低退火温度合成检测模板,再以高退火温度进行检测的处理。3.原始模板封闭荧光定量PCR体系全面优化。参照相关文献,必须保证目的基因和内参基因的扩增效率高且基本一致,才能应用2-△△Ct值数据分析方法。在验证了 DSCR3、DSCR4和GAPDH引物及TaqMan探针的特异性后,对该体系的引物浓度、TaqMan探针浓度、PCRBuffer浓度、Mg2+浓度、检测模板量、封闭探针浓度等体系组分及循环数、退火温度、延伸时间等反应条件,进行一系列的优化与调整。通过体系的综合扩增效率分析和各PCR反应的扩增效率一致性评价,确定原始模板封闭荧光定量PCR优化体系。4.原始模板封闭荧光定量PCR体系分析。遗传病的实验室诊断方法,是建立一定的检测体系达到检测的目的,故诊断方法的建立,检测体系的优化是前提,准确性是关键,敏感性和重复性是应用的保证。我们所建立的原始模板封闭荧光定量PCR检测体系,能否达到大规模人群筛查及常规分子诊断的预期目标,需进一步分析,包括准确性、敏感性和重复性分析。5.原始模板封闭荧光定量PCR体系样本盲法分析。准备了 139例浓度大于100ng/ul、OD260/280于1.7-1.9、经过核型分析确定基因型,包括正常基因型和21叁体综合症叁体型的临床gDNA样本,对其盲法编号后,应用原始模板封闭荧光定量PCR优化体系进行检测分析,将检测结果汇总,与核型分析判断的结果进行对比。6.原始模板封闭荧光定量PCR体系分辨能力探讨。为探讨原始模板封闭荧光定量PCR体系的分辨能力,我们将该优化体系应用于21叁体综合症嵌合型临床样本的检测。检测嵌合比例分别为0%,10%,20%,30%,40%,50%,60%的样品。另外,准备了 18例浓度大于100ng/ul、OD260/280于1.7-1.9、经过核型分析确定基因型,包括正常基因型和21叁体综合症嵌合型的gDNA样本,对其盲法编号后,应用原始模板封闭荧光定量PCR优化体系进行检测分析,将检测结果汇总,与核型分析判断的结果进行对比。研究结果根据实验目标及实验策略,通过实施具体实验方案与方法,所获得的实验结果如下:1.建立了原始模板封闭荧光定量PCR体系。该体系中,所选取的目的基因代表性DNA序列及所设计的引物、TaqMan探针,经验证,其特异性可靠;所建立的叁重荧光定量PCR反应有效扩增,互不干扰;所采用的先以低退火温度合成检测模板,再以高退火温度进行检测的模板预扩增处理措施切实可行;对原始模板进行封闭处理以改变样本间的原始拷贝数差异切实可行。2.确定了原始模板封闭荧光定量PCR体系。经一系列PCR反应组分及反应条件优化与调整,以及综合扩增效率和各PCR反应扩增效率一致性评价,所确定的优化体系为总反应体积20ul,含1.5x PCR Buffer、5.0mmol/L Mg2+、0.2mmol/LdNTPs、125nmol/L 引物、125nmol/L TaqMan 探针、10nmol/L 封闭探针、lUExTaq酶、±200nggDNA。PCR反应扩增条件为:95℃预变性5min→2cycles(95°C30sec+65℃lmin+52℃30sec)→35cycles(94℃30sec+62℃lmin)。经过优化与调整,建立的原始模板封闭荧光定量PCR体系的扩增效率高且基本一致,基因DSCR3、DSCR4、GAPDH的扩增效率分别为106.0%、107.5%、100.9%,均接近100%;目的基因DSCR3、DSCR4的扩增效率一致性分析曲线的斜率均为0.0002,接近于0。3.原始模板封闭荧光定量PCR体系用于CNV诊断的准确性强、灵敏度高、重复性好。建立的原始模板封闭荧光定量PCR检测方法诊断唐氏综合症样本的准确性达到100%;应用该检测体系,低至7.25ng的gDNA检测量,也能得到理想的检测结果;另外,无论是批内精密度分析还是批间精密度分析,均能得到较均一的检测结果。4.原始模板封闭荧光定量PCR体系实现对CNV的快速分子诊断。本研究以21叁体综合症为疾病模型,应用原始模板封闭荧光定量PCR体系对139例临床样本进行盲法分析,检测出39例21叁体型样本,与核型分析结果对比,两方法的检测结果完全相符;另外,新诊断方法不仅实现对21叁体型的检测,并且能够对嵌合比例达40%的21嵌合型样本进行检测;对于21嵌合型的诊断评价,诊断出8例嵌合体,与核型分析的检测结果相符。研究结论通过本研究,从理论上建立了一种“封闭原始模板”快速改变拷贝数差异倍数的新途径;从方法学研究上,建立了一种原始模板封闭荧光定量PCR诊断CNV的分子诊断新方法。建立的新诊断方法,有效解决了传统荧光定量PCR检测CNV,尤其是拷贝数变异倍数小于2倍的CNV,存在假阴性的技术瓶颈;另外,可通过一次反应,同时完成多个样本的检测,大大减少了工作量、检测成本及检测时间,提高了检测通量和检测效率。通过本研究建立的“原始模板封闭荧光定量PCR”诊断方法,可为其它拷贝数变异遗传病的分子诊断方法学研究提供借鉴与参考。(本文来源于《南方医科大学》期刊2015-04-15)
马晓霞,王格,周万军[5](2014)在《珠蛋白基因拷贝数相对定量快速检测α-地贫-SEA、-α3.7和-α4.2缺失方法的建立与应用》一文中研究指出背景:α-地中海贫血是全球最常见、对人类健康影响最大的单基因遗传病之一,其中我国南方广西和广东地区的人群携带率分别高达17.55%和8.53%。此病目前缺乏有效治疗手段,应用相应分析技术通过人群分子筛查及产前基因诊断阻止重症患儿出生是国内外公认的首选措施。本研究旨在建立并初步评价一种基于珠蛋白基因拷贝数相对定量技术的α-地贫-~(SEA)、-α~(3.7)和-α~(4.2)缺失基因型快速检测方法。方法:采用四重TaqMan实时荧光PCR技术及2~(-△△Ct)数据分析模式,建立一种检测方法,优化体系及反应条件,于同一检测体系同时检测ψα、α2和α1基因的相对拷贝数,快速诊断受检个体的缺失型α-地贫基因型;以此方法检测28例已知α-地贫缺失基因型标本及309例临床标本,并用缺失型α-地贫基因诊断试剂盒(gap-PCR法)平行对比检测,验证该方法的准确性与实用性。结果:建立的四重TaqMan荧光PCR.体系的扩增效率均接近100%;此方法对28例已知基因型样本的检测,设定相对拷贝数为2的2~(-△△Ct)切割值为0.80-1.2,相对拷贝数为1的2~(-△△Ct)切割值为0.30-0.70,相对拷贝数为0的2~(-△△Ct)切割值为<O.10;对309例临床标本的检测,以及与gap-PCR法的平行对比,结果显示该方法灵敏度和准确性均达到100%,且能有效消除微量或少量外源污染导致的假阴性和假阳性。结论:本研究建立的基于珠蛋白基因拷贝数相对定量技术的α-地贫-~(SEA)、-α~(3.7)和-α~(4.2)缺失基因型检测方法,操作简单快速,结果准确可靠,适合大规模人群筛查和常规分子诊断。(本文来源于《广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会论文及摘要汇编》期刊2014-12-19)
张崇林,唐娟[6](2014)在《用目的基因拷贝数定量快速诊断染色体21叁体综合征的研究》一文中研究指出染色体核型分析是21叁体综合征的经典检测方法,需细胞培养等操作,耗时耗力且人员技术要求高而限制了产前诊断的发展。本研究拟选取21号染色体上非同源特异性基因序列3-6个,以及无拷贝数变异的看家基因序列1-3个,建立基于多重Taq Man荧光定量PCR技术的拷贝数相对定量检测体系,通过对21号染色体上目的基因的定量分析,实现21叁体综合征的快速、高通量、标准化实验室检测,缩短诊断时间、提高诊断效率,为优生优育提供技术支撑。(本文来源于《中国优生与遗传杂志》期刊2014年11期)
胥顺,周万军,牟毅,程钢[7](2014)在《基因拷贝数定量检测在缺失型α-地贫快速诊断中的应用》一文中研究指出目的探讨目的基因拷贝数定量检测方法在缺失型α-地中海贫血快速诊断中的应用。方法采用四重荧光定量PCR方法检测1 385例α-地中海贫血样本的α珠蛋白基因拷贝数,同时用gap-PCR法进行平行对照检测,对结果不符样本采用MLPA法进行确认。结果 1 385例临床样本中,本方法检出αα/αα型531例、α-/αα型168例、-α/αα型93例、α-/α-型7例、-α/-α型2例、--/αα型558例、--/α-型13例、--/-α型11例、--/--型2例;其中与gap-PCR法结果不符的样本9例,MLPA复核结果显示5例检测结果一致、4例与多重荧光定量PCR结果不一致;拷贝数定量PCR法检测准确度达到99.71%,与gap-PCR检测符合率达到99.35%。结论α珠蛋白基因拷贝数定量PCR法能快速准确检测缺失型α-地中海贫血,适合大规模人群的缺失型α-地贫基因携带筛查。(本文来源于《分子诊断与治疗杂志》期刊2014年04期)
[8](2014)在《拷贝管理之道:川北区域快速走向良性发展》一文中研究指出西南水泥有限公司川北区域运营中心是(下称“川北区域运营中心”)西南水泥有限公司(下称“西南水泥”)的重要管理平台之一,成立于2012年10月。其实此时距西南水泥成立已不足一年,整个西南水泥正处于快速发展期。随着产能规模的迅速扩张,麾下重组企业的管理难题也(本文来源于《中国建材报》期刊2014-07-14)
曹海傧,朱明,冯伟国[9](2014)在《一种快速有效的海量视频拷贝检测方法》一文中研究指出随着网络上视频拷贝的不断增多,快速有效的视频拷贝检测方法变得越来越重要.针对大规模的视频数据库,提出一种快速有效的视频拷贝检测方法.该方法首先利用视频帧内的频域空间信息与帧间的序列时间信息,将每个视频表示为基于离散余弦变换的时空特征并建立鲁棒的压缩二值SimHash签名;然后对视频数据库中的每个视频的SimHash签名进行置换并排序得到多张签名表;最后通过在多张签名表中高效地查找与查询视频的SimHash签名的汉明距离小于给定阈值的签名,并将其对应的视频作为拷贝视频从而完成视频拷贝检测.针对包含10335个视频,大小为272.48GB的实际数据集的实验表明该方法十分有效.(本文来源于《小型微型计算机系统》期刊2014年05期)
树叶[10](2013)在《为快速拷贝文件助力》一文中研究指出在文件大小动辄GB级别的今天,利用Windows系统内置的文件复制功能传输文件时,常常会显得力不从心,操作效率十分低下。特别是在文件拷贝操作突然被中断的情况下,先前已经拷贝传输过的文件内容或许会全部消失,不幸遇到这类问题时,用户只能重复拷贝一次。(本文来源于《个人电脑》期刊2013年07期)
快速拷贝论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
在文件大小动辄GB级别的今天,利用Windows系统内置的文件复制功能传输文件时,常常会显得力不从心,操作效率十分低下。特别是在文件拷贝操作突然被中断的情况下,先前已经拷贝传输过的文件内容或许会全部消失,不幸遇到这类问题时,用户只能重复拷贝一次。利用Windows系统内置的文件拷贝功能,传输文件简单得几乎不值一提,只需动动鼠标即可。不过,使用该功能传输尺
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
快速拷贝论文参考文献
[1].郑丽君,李新伟,卜旭辉.基于尺度不变特征变换的快速图像拷贝检测[J].计算机应用.2017
[2].树叶.为快速拷贝文件助力[J].个人电脑.2017
[3].刘翊.一种快速拷贝数据到FAT分区的方法[J].电子世界.2017
[4].马晓霞.原始模板封闭荧光定量PCR快速检测拷贝数变异[D].南方医科大学.2015
[5].马晓霞,王格,周万军.珠蛋白基因拷贝数相对定量快速检测α-地贫-SEA、-α3.7和-α4.2缺失方法的建立与应用[C].广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会论文及摘要汇编.2014
[6].张崇林,唐娟.用目的基因拷贝数定量快速诊断染色体21叁体综合征的研究[J].中国优生与遗传杂志.2014
[7].胥顺,周万军,牟毅,程钢.基因拷贝数定量检测在缺失型α-地贫快速诊断中的应用[J].分子诊断与治疗杂志.2014
[8]..拷贝管理之道:川北区域快速走向良性发展[N].中国建材报.2014
[9].曹海傧,朱明,冯伟国.一种快速有效的海量视频拷贝检测方法[J].小型微型计算机系统.2014
[10].树叶.为快速拷贝文件助力[J].个人电脑.2013