论文摘要
本文通过运用Yau 2011提出的自然向量法,对艾滋病病毒HIV-1, HIV-2, PLV三类病毒进行进化分析。采用Python计算序列的自然向量以及序列间两两的距离,之后利用Mega对计算好的距离矩阵画进化树。为了测试本文方法的可行性,本文选取了HIV Sequence Database的20条全基因数据进行研究,分别用我们的方法和传统的MSA（多序列比对）画进化树。得到的结果显示我们的方法明显优于MSA,而且在耗时上我们也优于MSA。因此,我们的方法能为艾滋病病毒在进化方面的研究提供有利的工具。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 陈泽凯
关键词: 艾滋病病毒,自然向量,进化树
来源: 中国新通信 2019年08期
年度: 2019
分类: 信息科技,基础科学,医药卫生科技
专业: 数学,感染性疾病及传染病,内分泌腺及全身性疾病
单位: 陕西师范大学附属中学
分类号: R512.91;O183.1
页码: 213-215
总页数: 3
文件大小: 1258K
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