导读:本文包含了亲合性论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:函数,离子,远缘,结合能,靶标,蚜虫,麦草。
亲合性论文文献综述
喻阳华,杨丹丽,钟欣平[1](2019)在《黔中喀斯特区典型土地利用类型的土壤亲合性元素特征》一文中研究指出为阐明黔中喀斯特区不同土地利用类型的土壤亲合性元素特征,揭示土地利用对矿质元素的影响效应,促进农业可持续发展,本研究以玉米(Zea mays)、柚木(Tectona)、火龙果(Hylocereus undulatus)、花椒(Zanthoxylum bugeanum)、金银花(Lonicera japonica)、核桃(Juglans regia) 6种典型土地利用类型土壤为对象,测定土壤Fe、Ca、Cu等23种矿质元素含量,探讨不同亲合性元素的变化特征,分析元素间的互作效应。结果表明:(1)黔中喀斯特区各亲合性元素在不同土地利用类型之间的变化规律存在差异,玉米地土壤亲铁、亲铜元素含量较丰富,金银花群落土壤亲铜、亲气元素含量较高,核桃林土壤利于亲气、亲石元素积累,花椒林土壤亲石元素含量较高;(2)不同元素间的关联程度不同,Mn、Ca、Al与其他元素的关系较密切。黔中石漠化区可通过补充土壤铁、硫元素,改善通气性等措施调控矿质元素含量。(本文来源于《地球与环境》期刊2019年04期)
刘志海,李嫣,韩莉,刘杰,赵志雄[2](2016)在《系统收集PDB数据库中的亲合性数据:PDBbind数据库的最新进展》一文中研究指出生物大分子与有机小分子配体之间的相互识别在各种生命活动过程中扮演很重要的角色。生物大分子复合物的叁维结构和亲合性信息是描述这些生命过程的底层机理所不可或缺的信息。PDBbind数据库的创建目的是完整收录Protein Data Bank(PDB)数据库中通过实验测定的亲合性数据。由此为生物大分子复合物的结构信息和能量信息提供相互联系,而这些信息在计算模拟研究中非常重要。自2004年首次公开发布以来,PDBbind数据库保持每年更新一次。即将发布的最新2016版中将大约包含16000个复合物的亲合性和叁维结构信息。我们的研究表明,PDBbind中的数据信息与其他的同类大型数据库,比如ChEMBL具有很大的互补性,具有独特的研究价值。PDBbind中所有的数据都可以通过如下网站免费获取和使用:http://www.pdbbind-cn.org http://www.pdbbind.org.cn(本文来源于《中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会:化学信息学与化学计量学》期刊2016-07-01)
王任小[3](2016)在《一种基于知识的提高蛋白-配体亲合性预测精度的计算方法》一文中研究指出为了提高打分函数用于预测蛋白-配体亲合性的精度,我们在前期工作中发展了"基于知识的打分策略"(Knowledge-Guided Scoring,KGS)~([1])。该策略的关键思想是:对于一个给定蛋白-配体复合物,首先寻找一个结构类似的参考复合物,根据参考复合物的已知亲合性实验数据来修正计算结果。我们进一步发展了改进的KGS2方法,其主要改进在于引入叁维蛋白-配体相互作用指纹来匹配参考复合物~([2])。我们选择了5种不同类型的打分函数与KGS2联合使用,在5种靶标蛋白上进行了测试。在已知复合物晶体结构来计算亲合性的原位打分测试中,应用KGS2在大部分情况下获得了精度提升的计算结果。在分子对接测试中,应用KGS2在某些情况下也获得了精度提升的计算结果。我们发展的KGS2方法,可以方便地提升现有打分函数的性能,并不需要对这些打分函数本身做任何修改,而且其应用范围在理论上不受靶标蛋白类型的限制。KGS2方法为在分子靶向药物分子设计中提高预测蛋白-配体亲合性的精度提供了一种实用的方法。(本文来源于《中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会:化学信息学与化学计量学》期刊2016-07-01)
于歌[4](2016)在《取代基对碳酸酐酶及其抑制剂间亲合性的影响》一文中研究指出研究取代基对碳酸酐酶及其抑制剂间亲合性的影响能够为设计新型治疗青光眼、抗癫痫等疾病的药物提供理论指导与帮助。本文使用密度泛函理论(DFT)优化得到了 58个芳香硫胺类碳酸酐酶抑制剂与碳酸酐酶模型分子形成的复合物的结构,并计算了这些复合物的结合能,从理论上探讨了不同取代基对复合物亲合性的影响。研究结果表明,取代基为供电子基团时,碳酸酐酶-抑制剂复合物表现出更强的亲合性,其中取代基为氨基时亲合能力最强,取代基为吸电子基团时,亲合性减弱。将上述研究结果应用到经FDA批准上市的双氯非那胺和乙氧苯噻唑磺胺两个药物分子上,对它们的结构进行优化。研究发现,供电子取代基能够增强碳酸酐酶与这两种药物的亲合性,而吸电子取代基会减弱亲合性。本文结论为设计碳酸酐酶抑制剂提供了理论指导与帮助。(本文来源于《辽宁师范大学》期刊2016-05-01)
刘志海,李婕,韩莉,李嫣,王任小[5](2015)在《构建药物-靶标亲合性打分函数的评价方法体系》一文中研究指出定量计算药物-靶标亲合性一直是分子靶向药物设计中的核心问题之一.亲合性打分函数适用范围宽、计算速度快且精度良好,特别适合与分子对接等方法联用,在药物研发中得到了广泛的应用.经过20多年的发展,目前存在数量繁多的打分函数,这些方法难免良莠不齐.建立客观公正的针对打分函数性能的评价体系,不仅可以帮助用户做出合理的选择,也为发展打分函数的理论研究人员提供依据,因此是打分函数研究领域中的一个基础问题.近年来,我们逐步发展了评价药物-靶标亲合性打分函数性能的方法体系(comparative assessment of scoring functions,CASF),为解决该问题提供了一种可行的方案.我们提出了一整套衡量打分函数性能的基本指标,为每种指标设计了相应的定量方法,并确立了将打分过程与构象采样过程分开处理的原则.我们的方法体系中所使用的测试集,源自对PDBbind-CN数据库中蛋白-配体复合物样本的层层筛选,质量较高并且具备结构多样性的特点.与前人的类似工作相比,我们的方法体系具有较强的系统性和先进性,受到了国内外同行的广泛认可和应用.本文介绍了我们建立的CASF方法体系的设计思想、获得的重要研究成果以及学术影响.(本文来源于《中国科学:化学》期刊2015年09期)
魏淑怡,潘韵如,曾天生,陈金榜[6](2015)在《克雷伯氏肺炎杆菌内抗亚碲酸盐蛋白质TerZ延伸环降低对钙离子亲合性(英文)》一文中研究指出亚碲酸盐是碲的一含氧阴离子,其对微生物具高度毒性.在许多的致病菌内已经鉴定出数个抗亚碲酸盐基因(terZABCDEF).之前,作者解出抗亚碲酸盐蛋白质TerD液体核磁共振结构并指出在细菌内TerD可能是一钙离子传感器.TerZ与TerD在序列上有40%相同性,其包括了一额外的9氨基酸片段L36-N44,并且显示出非常弱的钙离子亲合性.有趣的是,少了额外片段的TerZdel拥有与TerD可比较的钙离子亲合性.根据化学位移指数及同源模拟结果,此额外片段为一无二级结构且延伸的loop,可能扰乱钙离子结合位置的构形,同时也阻碍了钙离子接近其结合位置,因此大大降低钙离子亲合性.(本文来源于《波谱学杂志》期刊2015年02期)
孙光映,阿吉艾克拜尔艾萨,刘照胜[7](2015)在《聚乙二醇/聚苯乙烯共致孔剂法增加分子印迹整体柱亲合性的研究》一文中研究指出分子印迹聚合物(MIPs)是一类对目标分子具有特异性识别和选择性吸附的智能材料,目前被广泛地应用于固相提取,色谱分析以及催化剂的制备等方面。长期以来,如何增强印迹效应成为了人们讨论的热点。Matsui[1]等以高分子量的聚苯乙烯(PS)及聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)为共致孔剂,模仿生物细胞中的拥挤效应,合成出的MIPs展现出较强的印迹(本文来源于《中国化学会第十八届全国有机分析及生物分析学术研讨会论文集》期刊2015-04-17)
李春宇,周璇,闫小丹,赵海滨,李集临[8](2014)在《小偃麦与中间偃麦草杂交不亲合性和不育性的探讨》一文中研究指出远缘杂交遇到的关键问题是可交配性和不育性,为深入了解远缘杂交的可交配性和不育性,探讨了小偃麦与中间偃麦草杂交当代的可交配性和F1~F4的不育性表现。小偃麦与中间偃麦草杂交当代的结实率为10%~39%,F1当年不结实,二至五年生结少量种子,结实率有逐年恢复的倾向;F2~F5分离世代不同类型结实率不同,普通小麦类型、小偃麦类型结实率可达70%~100%,中间偃麦草类型40%~50%,种子饱满度逐代改进。(本文来源于《黑龙江农业科学》期刊2014年05期)
徐云,杨明,李向东,陶琼,陈静[9](2014)在《蚜虫对香料作物的寄生亲合性研究》一文中研究指出香料作物在生长过程中能散发出特殊的香气物质,有些致香物质对蚜虫有趋避作用。笔者应用桃蚜、麦二叉蚜、萝卜蚜、豌豆蚜对薄荷、洋甘菊、结球茴香、烟草的寄生亲合性作了比较试验。结果表明,4种蚜虫对薄荷亲合性差,薄荷对蚜虫具有较高的拒避作用;桃蚜、萝卜蚜、麦二叉蚜、豌豆蚜对洋甘菊有较高的亲合性,桃蚜、萝卜蚜对结球茴香有亲合性;桃蚜只对烟草有较高的亲合性。(本文来源于《云南农业科技》期刊2014年01期)
刘杰,王任小[10](2013)在《对基于分类的蛋白-配体亲合性打分函数的研究》一文中研究指出成功的分子对接程序除了需要一个有效的搜索算法来搜索构象空间外,还需要有一个合理的打分函数用于对接结果的打分和排序。在分子对接程序中根据亲合力得出不同的蛋白-配体复合物相对排名是很关键的问题。因此,打分函数是对接程序中最为关键的部分。打分函数经过了二十多年的发展取得了一些进步,(本文来源于《第八届全国化学生物学学术会议论文摘要集》期刊2013-09-15)
亲合性论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
生物大分子与有机小分子配体之间的相互识别在各种生命活动过程中扮演很重要的角色。生物大分子复合物的叁维结构和亲合性信息是描述这些生命过程的底层机理所不可或缺的信息。PDBbind数据库的创建目的是完整收录Protein Data Bank(PDB)数据库中通过实验测定的亲合性数据。由此为生物大分子复合物的结构信息和能量信息提供相互联系,而这些信息在计算模拟研究中非常重要。自2004年首次公开发布以来,PDBbind数据库保持每年更新一次。即将发布的最新2016版中将大约包含16000个复合物的亲合性和叁维结构信息。我们的研究表明,PDBbind中的数据信息与其他的同类大型数据库,比如ChEMBL具有很大的互补性,具有独特的研究价值。PDBbind中所有的数据都可以通过如下网站免费获取和使用:http://www.pdbbind-cn.org http://www.pdbbind.org.cn
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
亲合性论文参考文献
[1].喻阳华,杨丹丽,钟欣平.黔中喀斯特区典型土地利用类型的土壤亲合性元素特征[J].地球与环境.2019
[2].刘志海,李嫣,韩莉,刘杰,赵志雄.系统收集PDB数据库中的亲合性数据:PDBbind数据库的最新进展[C].中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会:化学信息学与化学计量学.2016
[3].王任小.一种基于知识的提高蛋白-配体亲合性预测精度的计算方法[C].中国化学会第30届学术年会摘要集-第二十五分会:化学信息学与化学计量学.2016
[4].于歌.取代基对碳酸酐酶及其抑制剂间亲合性的影响[D].辽宁师范大学.2016
[5].刘志海,李婕,韩莉,李嫣,王任小.构建药物-靶标亲合性打分函数的评价方法体系[J].中国科学:化学.2015
[6].魏淑怡,潘韵如,曾天生,陈金榜.克雷伯氏肺炎杆菌内抗亚碲酸盐蛋白质TerZ延伸环降低对钙离子亲合性(英文)[J].波谱学杂志.2015
[7].孙光映,阿吉艾克拜尔艾萨,刘照胜.聚乙二醇/聚苯乙烯共致孔剂法增加分子印迹整体柱亲合性的研究[C].中国化学会第十八届全国有机分析及生物分析学术研讨会论文集.2015
[8].李春宇,周璇,闫小丹,赵海滨,李集临.小偃麦与中间偃麦草杂交不亲合性和不育性的探讨[J].黑龙江农业科学.2014
[9].徐云,杨明,李向东,陶琼,陈静.蚜虫对香料作物的寄生亲合性研究[J].云南农业科技.2014
[10].刘杰,王任小.对基于分类的蛋白-配体亲合性打分函数的研究[C].第八届全国化学生物学学术会议论文摘要集.2013