三维基因组测序技术发展

三维基因组测序技术发展

论文摘要

近20年来,研究者们通过大规模DNA测序,在基因组、转录组和表观基因组方面获得了大量的信息,这些信息为人类基因组中的功能元件和相互作用机制等研究提供了许多详细的视图。但明确2 m长的DNA如何组装在10μm左右的细胞核中仍是一个挑战性的工作。人们着眼于多角度探究染色质在狭窄空间里的精准调控表达,因此,三维基因组研究也越来越受到关注,与此相关的技术也在不断发展中。主要介绍以核邻位连接为基础的染色质构象捕获技术(3C)及其衍生技术,如4C、5C、Hi-C及其衍生技术、Ch IA-PET、原位Hi-C,以及DLO Hi-C等,并简单介绍应用这些技术已取得的重要成果以及未来的发展方向。

论文目录

  • 1 三维基因组
  • 2 三维基因组研究技术
  •   2.1 染色质构象捕获技术及其衍生技术
  •     2.1.1 染色质构象捕获技术 (chromatin conformation capture technology, 3C)
  •     2.1.2 环状染色质构象捕获技术 (circular chromatin conformation capture technology, 4C)
  •     2.1.3 染色质构象捕获碳拷贝技术 (chromatin conforma-tion capture carbon copy technology, 5C)
  •   2.2 高通量染色质构象捕获技术 (high-throughput chromatin conformation capture, Hi-C)
  •     2.2.1 Hi-C
  •     2.2.2 原位Hi-C
  •     2.2.3 HiChIP
  •     2.2.4 BL-Hi-C (Bridge Linker-Hi-C)
  •     2.2.5 OCEAN-C (open chromatin enrichment and network Hi-C)
  •     2.2.6 DLO Hi-C
  •   2.3 配对末端标签测序分析染色质相互作用 (chromatin
  •   2.4 Capture-C
  •   2.5 DamID
  • 3 三维基因组研究的应用
  • 4 总结
  • 5 展望
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 杨琬婷,杨磊,王世强

    关键词: 三维基因组

    来源: 生命科学 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 内蒙古大学生命科学学院,北京大学生命科学学院膜生物学国家重点实验室

    分类号: Q78

    DOI: 10.13376/j.cbls/2019001

    页码: 1-8

    总页数: 8

    文件大小: 1104K

    下载量: 907

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