非核糖体肽合成酶基因腺苷酰化结构域序列克隆及分析

论文摘要

微生物许多非核糖体肽类次生代谢产物主要是由非核糖体肽合成酶(NRPS)催化合成。参考Gontang发布的非核糖体肽合成酶(NRPS)通用引物设计扩增NRPS腺苷酰化结构域基因序列的特异引物,从海洋链霉菌L1的基因组DNA中扩增获得一个715 bp的NRPS基因序列。测序结果及比对分析表明该片段属于NRPS腺苷酰化结构域部分序列。对其拟翻译的氨基酸序列组成成分、理化性质进行分析,显示其包含AFD class I超基因家族核心结合区,为NRPS腺苷酰化结构域(A结构域)所在区域。对氨基酸序列的二级结构预测和三级结构模拟,发现与数据库中肠菌素合酶F组分的结构相似。为后续研究A结构域的特异性及完整NRPS基因簇克隆提供了参考。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 薛永常,张成锁,李根

关键词: 非核糖体肽合成酶,腺苷酰化结构域,生物信息

来源: 微生物学杂志 2019年01期

年度: 2019

分类: 基础科学

专业: 生物学

单位: 大连工业大学生物工程学院

基金: 辽宁省自然科学基金项目(20180550858)

分类号: Q78

页码: 20-25

总页数: 6

文件大小: 3409K

下载量: 149

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标签：非核糖体肽合成酶论文;  腺苷酰化结构域论文;  生物信息论文;