不同共作模式的稻田土壤细菌群落结构分析

不同共作模式的稻田土壤细菌群落结构分析

论文摘要

为分析不同共作模式的稻田土壤细菌群落结构,利用高通量测序技术,在水稻结穗期对不同共作模式的稻田土壤细菌进行测序,研究稻田单作(SDKBZ)、河蟹共作稻田(SDHXZ)和龙虾共作稻田(SDLXZ)表层土壤细菌群落多样性、丰富度和群落结构的变化。各样本共检测到细菌类群46门、112纲、210目、370科、664属、1 227种。主要的优势菌门是变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、蓝藻菌门(Cyanobacteria)、Sacharibactaria、疣微菌门(Verrucomicrobia)和厚壁菌门(Firmicutes)。河蟹稻田和龙虾稻田的Chao 1指数均高于单作稻田。PCoA分析结果显示,河蟹稻田和龙虾稻田两种稻田共作模式与稻田单作模式的土壤细菌群落构成差异大。研究初步揭示了河蟹和龙虾与水稻共作复合生态系统具有较丰富的微生物生态组成。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 土壤样品采集和处理
  •   1.2 土壤微生物DNA提取与检测
  •   1.3 PCR扩增及高通量测序
  •   1.4 生物信息处理方法
  • 2 结果与分析
  •   2.1 细菌群落多样性、丰度及结构差异性
  •   2.2 细菌门水平分类
  •   2.3 细菌属水平分类
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 宋宇,王鹏,韦月平

    关键词: 高通量测序,河蟹共作稻田,龙虾共作稻田,群落结构

    来源: 东北农业科学 2019年04期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农业基础科学,农艺学

    单位: 辽东学院

    基金: 2018年中央财政专项创新团队建设(8888-851800501)

    分类号: S154.3

    DOI: 10.16423/j.cnki.1003-8701.2019.04.010

    页码: 46-49

    总页数: 4

    文件大小: 1125K

    下载量: 159

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