泛癌整合分析miR-200家族靶标肿瘤基因异质性的研究

论文摘要

目的探讨miR-200家族对不同肿瘤预后的影响及其靶标基因调控异质性的机制。方法从癌症基因图谱（the Cancer Genome Atlas,TCGA）下载泛癌研究项目（PanCanAtlas）中21种不同组织病理学恶性实体瘤样本的转录组数据和临床表型,并分析miR-200家族与肿瘤预后的关系。进一步选择生存风险评估结果互相矛盾的5种肿瘤进行miR-200家族靶标基因的WGCNA聚类分析。收集膀胱癌组织标本,采用免疫组织化学法和荧光定量PCR验证肿瘤组织中与miR-200家族表达显著相关的靶标基因的表达,并分析其对患者生存的影响。结果 miR-200家族高表达是膀胱癌和胃腺癌预后的保护因素（HR=0.55～0.68,P=0.0001～0.0340;HR=0.61～0.72,P=0.0055～0.0170）,是肝细胞癌和胸腺瘤预后的不利因素（HR=1.46～1.65,P=0.0061～0.0120;HR=7.44～13.04,P=0.0002～0.0210）;miR-141和miR-429对肾乳头状细胞癌生存的影响相反。基因聚类分析显示,miR-200家族靶标TIMP2基因表达可延长膀胱癌患者生存时间,miR-141负调控肾乳头状细胞癌EPHA2基因而延长患者生存时间。膀胱癌组织的TIMP2蛋白与miR-200家族表达呈负相关,miR-200家族高表达患者预后较好。结论 miR-200家族对不同肿瘤预后的影响存在异质性,可能是miR-200家族靶标分子在不同肿瘤的表达存在差异,导致miR-200家族调控生物学功能的异质性。

论文目录

文章来源

类型: 期刊论文

作者: 唐勇,刘海洲,陈曦,吴健勇,刘萤照,杨林凯,王琪

关键词: 家族,靶标分子,泛癌,异质性

来源: 中国癌症防治杂志 2019年06期

年度: 2019

分类: 医药卫生科技

专业: 肿瘤学

单位: 广西医科大学附属武鸣医院泌尿科,广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部

基金: 国家自然科学基金项目（81860459）,广西自然科学基金项目（2018GXNSFAA138061,2018GXNSFAA138060,2015GXNSFAA139167）

分类号: R734.2

页码: 467-473

总页数: 7

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标签：家族论文;  靶标分子论文;  泛癌论文;  异质性论文;