磷胁迫下羊草的响应及磷响应相关基因表达分析

磷胁迫下羊草的响应及磷响应相关基因表达分析

论文摘要

【目的】磷是植物生长发育所必需的大量营养元素,研究无机磷酸盐(inorganic phosphate,Pi)胁迫下羊草的响应,筛选不同浓度Pi胁迫下的内参基因,并分析Pi响应相关基因的表达,为羊草Pi胁迫响应的分子机制研究提供基础数据。【方法】以羊草幼苗为材料,进行不同浓度Pi处理培养,对羊草的株高和根长进行检测,利用钒钼黄比色法检测羊草植株中Pi的含量。根据羊草转录组数据选取7个候选内参基因,从NCBI核酸序列数据库选取1个候选内参基因,对羊草不同处理材料进行总RNA提取和cDNA合成,利用qRT-PCR对候选内参基因的表达进行检测,并通过geNorm、NormFinder和Bestkeeper软件对其稳定性进行评估。根据筛选获得的较稳定内参基因,对Pi响应基因的qRT-PCR检测数据进行相对定量分析。【结果】表型观测结果显示,无论是低Pi还是高Pi胁迫都使得羊草的生长减缓;株高对低Pi或缺Pi胁迫较为敏感,根长对高Pi胁迫较为敏感;并随着处理浓度的增加羊草中Pi的含量也增加。qRT-PCR溶解曲线分析显示8个候选内参基因均具有单一的溶解峰,基因表达谱分析表明8个候选内参基因的CT值范围是17.16—26.61,其中,LcGAPDH的表达丰度最高为17.16—20.22,Lc18SrRNA的表达丰度最低为23.28—26.61,CT值变异系数最小的为LcARPT(2.09%),最大的为LcTUA(6.8%)。综合geNorm、NormFinder和Bestkeeper稳定性排名,通过计算几何平均数,获得8个候选内参基因综合稳定性排名,其中排名靠前的3个基因分别为Lc18SrRNA、LcCAP和LcEF1α,排名最后的2个基因为LcTUA和LcTUB。分别以Lc18SrRNA、LcCAP和LcEF1α作为内参基因,qRT-PCR相对定量表达分析结果显示,与对照相比,LcPHO1-2的表达受低Pi或者缺Pi诱导;LcPAP2的表达受高Pi诱导;而LcPAP27的表达同时受低Pi和高Pi下调。【结论】低Pi和高Pi胁迫均使羊草生长受阻,羊草地上组织与地下组织对Pi胁迫响应的模式不同。筛选出3个表达较为稳定的内参基因Lc18SrRNA、LcCAP和LcEF1α。LcPHO1-2和LcPAP2分别参与了羊草对低Pi和高Pi的应答响应,LcPAP27同时参与了羊草对低Pi和高Pi的响应进程。

论文目录

  • 0 引言
  • 1 材料与方法
  •   1.1 植物培养和处理
  •   1.2 植物Pi含量检测
  •   1.3 总RNA提取和c DNA合成
  •   1.4 内参基因选择和引物设计评价
  •   1.5 实时荧光定量PCR
  •   1.6 内参基因稳定性分析
  •   1.7 磷响应相关基因表达分析
  • 2 结果
  •   2.1 羊草对不同浓度Pi处理的响应
  •   2.2 候选内参基因的引物特异性和扩增效率分析
  •   2.3 Pi胁迫条件下候选内参基因的表达谱分析
  •   2.4 Pi胁迫条件下候选内参基因的稳定性分析
  •   2.5 Pi处理条件下磷响应相关基因表达分析
  • 3 讨论
  •   3.1 不同浓度Pi处理对羊草生长的影响
  •   3.2 不同浓度Pi处理条件下羊草内参基因稳定性分析
  •   3.3 不同浓度Pi处理下磷响应基因表达分析
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 万东莉,侯向阳,丁勇,任卫波,王凯,李西良,万永青

    关键词: 羊草,磷胁迫,内参基因,磷响应基因

    来源: 中国农业科学 2019年23期

    年度: 2019

    分类: 农业科技

    专业: 农作物

    单位: 中国农业科学院草原研究所/农业部草地生态与修复治理重点实验室,内蒙古农业大学生命科学学院/内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室

    基金: 内蒙古自治区自然科学基金(2019MS03002),中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(1610332016018,1610332018001),内蒙古农业大学高层次人才引进科研启动项目(NDYB2018-61)

    分类号: S543.9

    页码: 4215-4227

    总页数: 13

    文件大小: 2371K

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