PK-15细胞源EDC3分子的克隆及生物信息学分析

论文摘要

为了研究猪肾细胞（PK-15）中mRNA脱帽激活因子（EDC3）基因并分析其编码区序列特征,试验采用巢式PCR方法获得PK-15细胞源EDC3基因并进行克隆与测序,利用生物信息学相关在线软件检测PK-15细胞与其他宿主EDC3基因的同源性及构建系统进化树,并对该基因编码蛋白的跨膜结构、信号肽等分子特性进行分析。结果表明:猪EDC3基因全长为1 326 bp,编码440个氨基酸,比预测片段少201 bp;与预测野猪的核苷酸序列同源性达99.0%,氨基酸序列同源性达97.5%;该基因与野猪的亲缘关系最近,处于同一分支,其次是瘤牛、绵羊;EDC3基因编码蛋白的二级结构中无规则卷曲所占比例为59.09%,α-螺旋所占比例为20.68%,该结构蛋白无信号肽与跨膜结构。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 孙勇,李昌红,袁俊,刘娟娟,温贵兰

关键词: 脱帽激活子基因,猪肾细胞,克隆,生物信息学,基因序列,蛋白质

来源: 黑龙江畜牧兽医 2019年09期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学

单位: 贵州大学动物科学学院,贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室

基金: 国家自然科学基金项目(31460668),贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2015]2046号),贵州大学SRT计划项目(贵大SRT字[2016]178号),贵州大学博士基金项目(贵大人基合字[2013]12号),贵州省高层次创新型人才培养项目(黔财教[2017]号)

分类号: Q78

DOI: 10.13881/j.cnki.hljxmsy.2018.06.0316

页码: 7-12+179

总页数: 7

文件大小: 834K

下载量: 175

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