导读:本文包含了基因序列分析论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:基因,序列,转录,因子,血凝素,低氧,病毒。
基因序列分析论文文献综述
王丹丹,孙英新[1]（2019）在《石柱参人参皂苷合成酶基因SS的克隆与序列分析》一文中研究指出以石柱参近缘种野生山参的人参皂苷合成酶基因SS为模板,利用NCBI中的primer-BLAST设计特异性引物,应用PCR技术从石柱参叶片基因组DNA克隆了SS基因。序列分析显示,克隆的基因片段为1 285 bp,能够编码25个氨基酸以上的ORF (Open Reading Frame)有10个,其中最长能够编码295个氨基酸。NCBI序列对比显示,该基因与人参的人参皂苷合成酶基因SS的同源性为97. 05%,与西洋参的人参皂苷合成酶基因SS的同源性为96. 63%。这些数据表明,从石柱参克隆的基因为其人参皂苷合成酶基因SS。(本文来源于《辽东学院学报(自然科学版)》期刊2019年04期）
张凯强,常志成,温海深,李吉方,齐鑫[2]（2020）在《花鲈低氧诱导因子基因(hifs)的序列分析及低氧诱导表达》一文中研究指出低氧诱导因子基因(hifs)是由α和β构成的异源二聚体转录因子,在生物低氧应答中发挥着重要作用。本实验对花鲈4个hifs基因进行了序列分析及组织表达检测,并检测了各基因在低氧诱导后的mRNA表达变化。研究表明,通过全基因组比对、进化树分析和共线性分析,共鉴定出花鲈的4个hifs基因,分别为hif1α、hif2α、hif3α、hif1β。组织表达结果显示,hifs基因具有组织特异性表达特征。低氧((1.56±0.24)mg/L)诱导下,hifs各基因的响应时间和响应程度存在一定差异。肝组织中,低氧胁迫3和6 h后,hif1α、hif2α、hif3α和hif1β表达量均出现了显著升高,表明hifα和hif1β基因可能共同起低氧调控作用;而低氧胁迫12 h后,仅hif1α表达量显著高于对照组,表明hif1α基因在肝组织低氧调控12 h内持续起作用。鳃组织中,低氧胁迫3 h后,hif1α、hif2α、hif3α基因表达量出现了显著升高,而低氧胁迫6 h后,hif3α和hif1β基因表达量显著升高,说明在鳃组织前3h的低氧胁迫中仅hifα基因起调控作用,而6 h后hif3α和hif1β基因共同调控低氧胁迫。常氧恢复阶段肝、鳃组织中各基因表达量均与对照组无显著差异。本研究结果表明,4个hifs基因的组织表达具有特异性,同时对低氧的响应时间和程度不同,研究结果弥补了花鲈hifs基因及低氧应答研究的空白。(本文来源于《中国海洋大学学报(自然科学版)》期刊2020年01期）
蒋波,冯震,秦峰,刘浩,杨美成[3]（2019）在《药品质量控制中常见产毒真菌ITS和LSU rRNA基因的序列分析》一文中研究指出目的:评价rRNA基因的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)和大亚基单元(large subunit,LSU)序列对药品质量控制中常见产毒真菌的鉴定作用。方法:以形态分类方法对8个产毒真菌属的菌株进行初步鉴定;然后从试验菌株中提取基因组DNA,对ITS和LSU序列进行PCR扩增和序列测定,通过序列聚类关系分析,进一步评价不同序列对产毒真菌的分子鉴定能力。结果:分别采用ITS、LSU rRNA基因序列分析方法对产毒真菌的鉴定至少可达到"属"水平,采用ITS和LSU rRNA基因的串联序列可以将青霉属和曲霉属中的试验菌株鉴定至"种"水平。结论:ITS和LSU rRNA序列系统发育分析可作为产毒真菌的鉴定方法。(本文来源于《药物分析杂志》期刊2019年11期）
陈阳[4]（2019）在《BW.03等位基因的鉴定及序列分析——附1例报告》一文中研究指出目的对1例Bw血型的血清学及分子生物学特性进行分析。方法应用聚合酶链反应-序列特异性引物(polymerase chain reaction-sequence specific primer,PCR-SSP)和ABO等位基因第6、7外显子PCR产物直接测序方法进行ABO亚型基因分型。结果先证者红细胞未检测到B抗原,但血清中含有抗-A。PCR-SSP结果显示标本基因型为B/O2。直接测序分析发现c.297A>G、c.526C>G、 c.657C>T、c.703G>A、 c.721C>T、c.796C>A、 c.803G>C和c.930G>A 8个突变,可推断为BW.03/O.02.01基因型。该序列与B.01基因序列比对仅在721位发生C>T的突变导致多肽链R241S替换。结论 B等位基因c.721C>T突变产生BW.03等位基因,导致B抗原表达减弱。(本文来源于《中国输血杂志》期刊2019年11期）
邓章超,赵娟娟,夏琴,韦崇万,黄艳娜[5]（2019）在《陆川猪DGAT2基因克隆、序列分析及表达水平研究》一文中研究指出为了获得广西陆川猪二脂酰甘油酰基转移酶2(DGAT2)基因编码区(CDS)序列,并探讨该基因在陆川猪和杜长大猪肌肉中的表达水平差异,试验以陆川猪背最长肌组织总RNA为模板,克隆获得DGAT2基因CDS序列并利用生物软件进行序列分析,同时采用实时荧光定量PCR技术检测150日龄陆川猪和杜长大猪背最长肌中DGAT2基因的相对表达量。结果表明:陆川猪DGAT2基因CDS序列长度为1 086 bp,与GenBank中的野猪、虎鲸、双峰骆驼、羊驼、佛罗里达海牛、野驴、马和家猫的同源性分别为99. 8%、93. 1%、93. 0%、92. 9%、92. 1%、91. 8%、91. 7%和91. 5%;陆川猪与野猪的遗传距离最近;陆川猪DGAT2蛋白由361个氨基酸组成,其中亮氨酸含量最高,半胱氨酸含量最少,DGAT2蛋白具有较弱的疏水性;在DGAT2蛋白高级结构中,α-螺旋占比39. 34%,无规则卷曲占比43. 21%,延伸链占比17. 45%; 150日龄陆川猪背最长肌中DGAT2基因相对表达量极显着高于同日龄的杜长大猪(P<0. 01)。说明DGAT2基因在猪肌肉脂肪沉积过程中发挥了一定作用,但其作用于肌内脂肪的沉积机制尚不明确,可将DGAT2基因作为开展陆川猪肌内脂肪沉积分子机制研究的主要候选基因之一。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年21期）
刘娜,张浩波,王皓珺,高悦禹,李和平[6]（2019）在《梅花鹿SNX10基因cDNA克隆与序列分析》一文中研究指出为了获得梅花鹿SNX10基因编码区cDNA序列,试验提取了梅花鹿鹿茸尖端组织总RNA,设计上下游引物,利用PCR技术扩增SNX10基因,对扩增的基因进行氨基酸序列分析并构建系统进化树。结果表明:扩增获得的序列为854 bp,其中包括606 bp开放阅读框(ORF),编码201个氨基酸;SNX10蛋白为疏水性蛋白质且存在信号肽和跨膜结构,由α-螺旋、扩展链、无规则卷曲组成,蛋白亚细胞定位预测为细胞质。梅花鹿鹿茸SNX10蛋白氨基酸序列与白尾鹿的同源性极高,为99%。梅花鹿与白尾鹿的亲缘关系最近,与野猪、牛的亲缘关系较近,与人、白鳍豚、裸鼹鼠、黑猩猩、赤狐、刺猬的亲缘关系较远。(本文来源于《黑龙江畜牧兽医》期刊2019年21期）
姜琦,郑强,吴启康,国会艳[7]（2019）在《白桦4个WRKY基因的克隆及序列分析》一文中研究指出[目的]对在白桦转录组中发现的4个WRKY转录因子进行分析及基因克隆,并通过生物信息学分析这4个WRKY蛋白。[方法]利用PCR技术扩增4个基因并将其构建到T载体上。同时,利用在线网站分析这4个WRKY基因的理化性质及功能。[结果]发现这4个白桦WRKY基因编码311～335个氨基酸,分子量在34. 39～37. 70 k Da之间,均属于不稳定的亲水性蛋白质,并且为无跨膜结构区的核内蛋白。保守结构域分析发现这4个白桦WRKY基因中均含有一个高度保守的WRKY结构域。通过与拟南芥WRKY蛋白的系统树构建,分析这4个WRKY基因的功能。[结论]成功克隆出4个白桦WRKY基因,为后期深入分析这4个白桦WRKY基因的功能提供了前期研究基础。(本文来源于《生物技术》期刊2019年05期）
吴立炀,王福广,查云峰,叶健,刘劼[8]（2019）在《2017—2018年广东省H9亚型禽流感病毒HA基因序列分析》一文中研究指出为了解广东省H9亚型禽流感病毒HA基因变异情况,对2017—2018年从广东省活禽市场获得的13株H9亚型禽流感病毒HA基因进行序列分析,发现13个毒株均属于h9.4.2.5分支;潜在的糖基化位点均为8个,主要变异表现在218～220 aa处1个位点缺失和313～315 aa处1个位点增加;受体结合位点主要表现为K149N、A150T、V198T、Q234L和Q235M突变,其中234～236 aa位点突变为LMG,与人源受体相同,具有可感染人的分子特征;抗原性相关位点除201 aa位点较为保守外,其余6个位点主要表现为G90E、S145D、D153G、N167G、A168N、T200R位点的突变,此外168 aa由天冬氨酸(D)突变为天冬酰胺(N),并成为主要氨基酸。以上基因突变提示,当前流行毒株的抗原性可能发生了较大变异,现有疫苗株可能对流行毒株不能提供有效的保护,需要研发新的疫苗毒株。(本文来源于《中国动物检疫》期刊2019年11期）
王婧,孙志雯,陈海峰,陈晓兰[9]（2019）在《3株猪流行性腹泻病毒S1基因的克隆及序列分析》一文中研究指出猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)可感染各阶段的猪,使患病动物出现水样腹泻、呕吐,并伴随厌食和精神沉郁等临床症状,对哺乳仔猪危害尤为严重。为了解河南某猪场PEDV流行毒株S1基因的变异情况,以江苏农牧科技职业学院动物药学院实验室保存的感染PEDV临床病料为样本,对其进行S1基因扩增、克隆以及序列分析。对S1基因的进化分析结果显示,该猪场PEDV分离株S1基因推导的氨基酸序列之间的同源性高达99%,BLAST搜索结果显示与AHCZ-2株的相似性最高,将获得序列与经典毒株CV777相比在第57位插入了4个氨基酸NQGV,在第134位插入1个氨基酸D,而在第157、158位缺失2个氨基酸,在中和表位区域共有11处氨基酸突变,与国内其他毒株均位于G2-b进化分支,研究结果为进一步掌握该地PEDV的流行毒株和毒力变异情况提供了理论依据。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年20期）
林希,刘若寒,郝香琪,郑清栩,陶攀[10]（2019）在《广东地区犬瘟热病毒血凝素基因的克隆与序列分析》一文中研究指出【目的】对广州和东莞市宠物犬感染犬瘟热病毒(CDV)的情况进行病原鉴定和分析,为监测CDV的遗传变异情况和防治犬瘟热(CD)提供数据基础。【方法】从表现CD症状的犬只中鉴定了17份CDV阳性样本,采用RT-PCR的方法克隆得到这些野毒株的血凝素(H)基因序列,采用生物信息学方法进行序列比对分析。【结果】17株CDV的H基因核苷酸与氨基酸序列的相似性分别为97.4%～100.0%和97.5%～100.0%,与Onderstepoort、Lederle和Convac等疫苗株相比,其核苷酸与氨基酸序列相似性分别为90.3%～91.5%和89.4%～90.8%。进化树分析结果显示,17株CDV野毒株均属于AsiaⅠ型,与疫苗株的分支较远;本研究鉴定的野毒株已进化形成9个潜在的N-糖基化位点。【结论】AsiaⅠ型CDV仍为该地区的流行基因型,基因型较稳定,但与疫苗株相比形成了一定的进化距离和出现了大量的变异。因此,继续监控CDV在犬群中的进化,掌握其遗传变异状况具有重要意义。(本文来源于《华南农业大学学报》期刊2019年06期）
基因序列分析论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
低氧诱导因子基因(hifs)是由α和β构成的异源二聚体转录因子,在生物低氧应答中发挥着重要作用。本实验对花鲈4个hifs基因进行了序列分析及组织表达检测,并检测了各基因在低氧诱导后的mRNA表达变化。研究表明,通过全基因组比对、进化树分析和共线性分析,共鉴定出花鲈的4个hifs基因,分别为hif1α、hif2α、hif3α、hif1β。组织表达结果显示,hifs基因具有组织特异性表达特征。低氧((1.56±0.24)mg/L)诱导下,hifs各基因的响应时间和响应程度存在一定差异。肝组织中,低氧胁迫3和6 h后,hif1α、hif2α、hif3α和hif1β表达量均出现了显著升高,表明hifα和hif1β基因可能共同起低氧调控作用;而低氧胁迫12 h后,仅hif1α表达量显著高于对照组,表明hif1α基因在肝组织低氧调控12 h内持续起作用。鳃组织中,低氧胁迫3 h后,hif1α、hif2α、hif3α基因表达量出现了显著升高,而低氧胁迫6 h后,hif3α和hif1β基因表达量显著升高,说明在鳃组织前3h的低氧胁迫中仅hifα基因起调控作用,而6 h后hif3α和hif1β基因共同调控低氧胁迫。常氧恢复阶段肝、鳃组织中各基因表达量均与对照组无显著差异。本研究结果表明,4个hifs基因的组织表达具有特异性,同时对低氧的响应时间和程度不同,研究结果弥补了花鲈hifs基因及低氧应答研究的空白。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因序列分析论文参考文献
[1].王丹丹,孙英新.石柱参人参皂苷合成酶基因SS的克隆与序列分析[J].辽东学院学报(自然科学版).2019
[2].张凯强,常志成,温海深,李吉方,齐鑫.花鲈低氧诱导因子基因(hifs)的序列分析及低氧诱导表达[J].中国海洋大学学报(自然科学版).2020
[3].蒋波,冯震,秦峰,刘浩,杨美成.药品质量控制中常见产毒真菌ITS和LSUrRNA基因的序列分析[J].药物分析杂志.2019
[4].陈阳.BW.03等位基因的鉴定及序列分析——附1例报告[J].中国输血杂志.2019
[5].邓章超,赵娟娟,夏琴,韦崇万,黄艳娜.陆川猪DGAT2基因克隆、序列分析及表达水平研究[J].黑龙江畜牧兽医.2019
[6].刘娜,张浩波,王皓珺,高悦禹,李和平.梅花鹿SNX10基因cDNA克隆与序列分析[J].黑龙江畜牧兽医.2019
[7].姜琦,郑强,吴启康,国会艳.白桦4个WRKY基因的克隆及序列分析[J].生物技术.2019
[8].吴立炀,王福广,查云峰,叶健,刘劼.2017—2018年广东省H9亚型禽流感病毒HA基因序列分析[J].中国动物检疫.2019
[9].王婧,孙志雯,陈海峰,陈晓兰.3株猪流行性腹泻病毒S1基因的克隆及序列分析[J].江苏农业科学.2019
[10].林希,刘若寒,郝香琪,郑清栩,陶攀.广东地区犬瘟热病毒血凝素基因的克隆与序列分析[J].华南农业大学学报.2019
论文知识图
