导读:本文包含了近交系数论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译,主要关键词:近交,系数,系谱,亲缘,基因组,父本,母本。
近交系数论文文献综述
曹愉夏,韩威,李国辉,邹剑敏,薛倩[1](2019)在《基于RAD-seq简化基因组测序估算狼山鸡分子亲缘系数和近交系数》一文中研究指出为准确度量狼山鸡保种群体的近交统计量,并比较不同算法在近交统计量度量中的可靠性,研究以国家级地方鸡种基因库保存的狼山鸡为研究对象,通过RAD-seq简化基因组测序获得高密度SNP信息,并计算两种分子亲缘系数(kin1和kin2)和四种分子近交系数(F_(ROH)、F_(GRM)、F_(HOM)和F_(UNI))。结果表明:kin1对系谱记录中全同胞、半同胞的检出率较高(93/117);F_(GRM)、F_(HOM)和F_(UNI)叁种分子近交系数两两之间极显着相关(P<0.01),F_(ROH)(F_(ROH)>100、F_(ROH)>1 000和F_(ROH)>3 000)与F_(GRM)、F_(HOM)和F_(UNI)的相关系数较低,仅F_(ROH)>100与F_(HOM)达到极显着正相关(P<0.01)。基于高密度SNPs估算的kin1为较准确的狼山鸡分子亲缘系数,可用于狼山鸡保种群的系谱校正;高密度SNP标记有利于检测到短的ROH,同时提高FROH与F_(GRM)、F_(HOM)和F_(UNI)的正相关性。(本文来源于《中国家禽》期刊2019年10期)
李治培,赵朝步,钟华配,黄锋[2](2019)在《基于Excel的个体近交系数直观估算》一文中研究指出通过计算畜群内的个体近交系数,可以把握现有畜群的遗传效应,对于畜群的选种选配有着重要的指导意义,能有效地防止近交造成的品种退化等现象。通过Excel函数计算畜群系谱信息中共同祖先出现的次数频率,可简单快速地估算个体间的近交系数,实现近交系数的直观估算,不需要使用者掌握计算机编程知识,可供基层畜牧行业的技术人员参考使用,能快速估算系谱个体的近交情况,使得对群体遗传效应的评估工作极易进行。(本文来源于《畜牧与饲料科学》期刊2019年02期)
王孝义,李明丽,胡伟,严达伟,鲁绍雄[3](2017)在《基于SNP的基因组近交系数衡量群体遗传多样性的准确性》一文中研究指出【目的】为揭示基于SNP的基因组近交系数(F_(SNP))衡量群体遗传多样性的准确性。【方法】在假设遗传长度为100 c M的1对常染色体上存在1 000个均匀分布的SNP标记基础上,模拟了1个闭锁群体连续繁育50个世代的情形,以基于系谱的近交系数(F_(ped))为对照,以F_(SNP)、F_(ped)与基因组观察纯合度(HOMobs)的相关系数rSNP、rped为遗传多样性衡量准确性的指标,分析群体规模、公畜比例、计算F_(SNP)的SNP数量(N_(SNP))和SNP等位基因初始频率(p)对F_(SNP)衡量遗传多样性准确性的影响。【结果】与F_(ped)相比,F_(SNP)衡量群体遗传多样性的准确性总体上更高,受群体规模和性别比例的影响小,且不会随世代的递增而下降;用于计算F_(SNP)的SNP数量越多、SNP等位基因初始频率越接近0.5,F_(SNP)衡量群体遗传多样性的准确性越高。【结论】在实际中,当用于计算F_(SNP)的SNP数量占全基因组SNP的20%以上(本试验为N_(SNP)≥200)且覆盖所有染色体时,即可保证r_(SNP)始终高于r_(ped),有效开展群体遗传多样性的适时动态监测;将各SNP等位基因初始频率控制在中等水平,有助于提高遗传多样性监测准确性和保持群体遗传变异。(本文来源于《云南农业大学学报(自然科学)》期刊2017年05期)
涂远璐,邹建香,白云峰,冯国兴[4](2016)在《基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现》一文中研究指出肉羊计算机辅助育种工作需建立在系统、规范化的羊场生产管理模式下,大量累积数据基础上。本文在肉羊生产管理实现信息化的前期工作基础上,进一步开展育种分析,从近交系数和亲缘系数入手,采用亲缘协方差法,设计程序,按照获取简明系谱、对系谱排序、计算亲缘协方差矩阵叁步骤计算。该方法的特点在于无需人工做系谱图,查找共同祖先,绘制通径线,易于计算机编程求解,且与生产管理系统结合可实现全程自动批量运算,简捷、快速,把育种工作者从繁琐的劳动中解放出来,可有效提高育种工作效率。(本文来源于《农业网络信息》期刊2016年12期)
涂远璐,邹建香,白云峰,冯国兴[5](2016)在《基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现》一文中研究指出肉羊计算机辅助育种工作。需建立在系统、规范化的羊场生产管理模式下,大量累积数据基础上。本文在肉羊生产管理实现信息化的前期工作基础上,进一步开展育种分析,从近交系数和亲缘系数入手,采用亲缘协方差法,设计程序,按照获取简明系谱、对系谱排序、计算亲缘协方差矩阵叁步骤计算。该方法的特点在于无需人工做系谱图,查找共同祖先,绘制通径线,易于计算机编程求解,且与生产管理系统结合可实现全程自动批量运算,简捷、快速,把育种工作者从繁琐的劳动中解放出来,可有效提高育种工作效率。(本文来源于《中国畜牧兽医学会信息技术分会2016年学术研讨会文献》期刊2016-10-20)
王学敏,任守文,方晓敏,李碧侠,赵为民[6](2015)在《猪近交系数计算软件设计与使用》一文中研究指出对一款实用的猪近交系数计算软件设计进行了详细的介绍,旨在为有计划地进行选种与选配提供数据参考,以提高养猪生产效率。(本文来源于《湖北畜牧兽医》期刊2015年12期)
傅强,王师,赵亮,张璐,包振民[7](2015)在《不同近交系数的虾夷扇贝近交衰退研究》一文中研究指出在虾夷扇贝中通过自体受精构建了近交系数为0.5的自交家系,同时构建了近交系数为0.25的F2代近交家系和杂交对照家系,对生活史不同时期的生长和存活等适应性性状进行了近交效应的研究。研究发现不同的近交系数对不同性状的衰退影响不同:幼虫期生长性状的近交负荷为0.158~0.279,而存活率的近交负荷为0.915~1.101,存活率受近交的影响更大。两种性状的近交衰退从幼虫第16天才开始明显显现,并且近交负荷随着时间都有增大的趋势,到成体时分别增长为0.348~0.588和1.485~3.277。本研究表明,在虾夷扇贝中近交系数越高衰退越严重,存活率性状的衰退相比生长性状更严重,并且近交负荷都随着时间显着增大。(本文来源于《中国海洋大学学报(自然科学版)》期刊2015年11期)
巴恒星,章秀婷,宋兴超,鲍加荣,孟庆福[8](2013)在《基于关系型数据库的毛皮动物系谱动态跟踪及近交系数计算》一文中研究指出本文利用数据库和可视化编程技术对毛皮动物系谱数据进行动态跟踪及近交系数精确计算,同时可对整个动物群体进行一定的近交监测和评估。(本文来源于《特产研究》期刊2013年03期)
梁健,闫喜武,霍忠明,刘振,吴云霞[9](2013)在《不同近交系数蛤仔橙色品系的生长和成活研究》一文中研究指出以不同遗传背景的蛤仔(Ruditapes philippinarum)橙色品系为材料,采用建立半同胞家系子一代H1(F=0.125)、全同胞家系子一代F1(F=0.250)、全同胞家系子四代F4(F=0.594)及自然对照组C1(F=0)的方法,进行了不同近交系数蛤仔橙色品系生长和成活的研究。结果表明,在整个养殖周期中F1组的壳长生长最慢,在稚贝期和养成期均显着小于F4和C1组(P<0.05),H1、F4和C1组之间的壳长生长差异不显着(P>0.05)。C1组的成活率在整个养殖周期中为最小,除幼虫期3日龄外,其他各日龄均显着小于其他试验组(P<0.05),而H1、F1和F4组之间的成活率则差异不显着(P>0.05)。试验组F1壳长生长的衰退率为2.92%~18.33%,平均值为(12.05±6.54)%,试验组H1在稚贝期、养成期显现出一定的衰退现象,而试验组F4在整个养殖周期中均未表现出近交衰退现象;各试验组的成活性状在各日龄均未出现近交衰退。该研究为橙色品系的选育奠定一定的理论基础。(本文来源于《南方水产科学》期刊2013年04期)
范强,田长永,王景春[10](2010)在《基于ASP的个体近交系数的程序设计》一文中研究指出采用ASP语言编程,实现从Excel文件中读取数据,开发出可以运行在Internet网络平台的个体近交系数的分析程序。(本文来源于《农业网络信息》期刊2010年06期)
近交系数论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
通过计算畜群内的个体近交系数,可以把握现有畜群的遗传效应,对于畜群的选种选配有着重要的指导意义,能有效地防止近交造成的品种退化等现象。通过Excel函数计算畜群系谱信息中共同祖先出现的次数频率,可简单快速地估算个体间的近交系数,实现近交系数的直观估算,不需要使用者掌握计算机编程知识,可供基层畜牧行业的技术人员参考使用,能快速估算系谱个体的近交情况,使得对群体遗传效应的评估工作极易进行。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
近交系数论文参考文献
[1].曹愉夏,韩威,李国辉,邹剑敏,薛倩.基于RAD-seq简化基因组测序估算狼山鸡分子亲缘系数和近交系数[J].中国家禽.2019
[2].李治培,赵朝步,钟华配,黄锋.基于Excel的个体近交系数直观估算[J].畜牧与饲料科学.2019
[3].王孝义,李明丽,胡伟,严达伟,鲁绍雄.基于SNP的基因组近交系数衡量群体遗传多样性的准确性[J].云南农业大学学报(自然科学).2017
[4].涂远璐,邹建香,白云峰,冯国兴.基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现[J].农业网络信息.2016
[5].涂远璐,邹建香,白云峰,冯国兴.基于Web的肉羊信息管理系统中亲缘系数及近交系数的程序设计与实现[C].中国畜牧兽医学会信息技术分会2016年学术研讨会文献.2016
[6].王学敏,任守文,方晓敏,李碧侠,赵为民.猪近交系数计算软件设计与使用[J].湖北畜牧兽医.2015
[7].傅强,王师,赵亮,张璐,包振民.不同近交系数的虾夷扇贝近交衰退研究[J].中国海洋大学学报(自然科学版).2015
[8].巴恒星,章秀婷,宋兴超,鲍加荣,孟庆福.基于关系型数据库的毛皮动物系谱动态跟踪及近交系数计算[J].特产研究.2013
[9].梁健,闫喜武,霍忠明,刘振,吴云霞.不同近交系数蛤仔橙色品系的生长和成活研究[J].南方水产科学.2013
[10].范强,田长永,王景春.基于ASP的个体近交系数的程序设计[J].农业网络信息.2010