荧光热漂移实验体外检测核小体的解聚

荧光热漂移实验体外检测核小体的解聚

论文摘要

核小体是真核生物染色质的基本组成单元。核小体的解聚可以动态调控诸如DNA复制、转录、重组等以DNA为模板的生物学过程。特定荧光探针分子与蛋白质疏水残基结合后可被激发荧光信号。荧光热漂移(fluorescence thermal shift,FTS)是一种利用该原理检测温度上升时蛋白质变性过程的方法。本文以Widom 601序列为DNA模板,盐透析法体外装配核小体;分别在实时荧光定量PCR仪的VIC和TAMRA通道激发下,利用FTS检测了核小体在Tris-NaCl(TN)缓冲液和HEPES缓冲液中的解聚状态。研究结果发现,DNA对照序列在TN缓冲液中产生的背景噪声较大,VIC通道激发下组蛋白八聚体产生的荧光信号相对较强。FTS检测核小体的结果显示,随着温度的上升核小体的解聚过程分为2个阶段,~71℃和~84℃是核小体解聚速度最快的温度范围,而75℃~80℃是降解速度较慢的阶段。基于FTS基本原理,本研究发展了一种新颖的可用于检测核小体结构稳定性的方法,为核小体与染色质结构相关问题的研究奠定了一定的技术基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 菌种与质粒
  •   1.2 试剂
  •   1.3 仪器
  •   ,1.4 核小体的准备
  •   1.5 FTS分析
  • 2 结果
  •   2.1 DNA片段与组蛋白的准备
  •   2.2 体外组装核小体
  •   2.3 FTS检测核小体解聚
  •     2.3.1 FTS检测DNA序列对照
  •     2.3.2 FTS检测组蛋白八聚体对照样品
  •     2.3.3 FTS实验体外检测核小体的解聚状态
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 郭明欣,张凤慧,邵学勤,赵秀娟,蔡禄,赵宏宇

    关键词: 核小体解聚,荧光热漂移,蛋白质疏水结构域,染色质结构

    来源: 中国生物化学与分子生物学报 2019年09期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学

    单位: 内蒙古科技大学生命科学与技术学院

    基金: 国家自然科学基金项目(No.31760247,No.61671256),内蒙古自然科学基金项目(No.2017MS0303)~~

    分类号: Q343.2

    DOI: 10.13865/j.cnki.cjbmb.2019.09.13

    页码: 1021-1028

    总页数: 8

    文件大小: 426K

    下载量: 95

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