3株鸭乙型肝炎病毒全基因组克隆与序列分析

论文摘要

对河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地鸭血清样本用PCR进行鸭乙型肝炎病毒（DHBV）检测,并从三地经检测为DHBV阳性的样本中各挑选1份进行DHBV全基因的扩增、克隆、测序及序列分析。结果显示,河南南阳、安徽亳州、湖北潜江三地的鸭乙型肝炎自然感染率分别为17.6%、13.6%、16.1%,差异不显著（P>0.05）。河南南阳、安徽亳州、湖北潜江3株DHBV基因组全长分别为3 024、3 027、3 024 bp,均含有编码P、S和C蛋白的3个开放阅读框。通过各开放阅读框氨基酸同源性比较,发现编码P蛋白的区域差异较大。全基因序列分析显示,3株DHBV核苷酸同源性为95.1%～97.4%,与选取的25株参考株同源性为90.3%～96.2%。遗传进化分析及P蛋白关键位点分析结果表明,3株均为类中国基因型,湖北潜江的DHBV毒株P蛋白3位-345位关键氨基酸残基位点与中国毒株基因型相同,在367位-771位关键氨基酸残基位点与西方毒株基因型相同,推测其产生了重组。结果表明,成功克隆了华中地区的3株鸭DHBV全基因序列,为DHBV的分子流行病学调查提供参考。

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文章来源

类型: 期刊论文

作者: 王静,许鑫,李宛玉,王雪雨,吴倩倩,姚伦广,阚云超,冀君

关键词: 鸭乙型肝炎病毒,全基因,序列分析,克隆,同源性

来源: 动物医学进展 2019年08期

年度: 2019

分类: 农业科技,基础科学

专业: 生物学,畜牧与动物医学

单位: 南阳师范学院/南阳市兽医生物工程技术研究中心/南阳师范学院昆虫生物反应器河南省工程实验室

基金: 河南省高等学校重点科研项目(18A230012),南阳师范学院青年项目(16134),南阳师范学院研究生创新基金项目(2017CX099)

分类号: S852.65

DOI: 10.16437/j.cnki.1007-5038.2019.08.001

页码: 11-17

总页数: 7

文件大小: 1046K

下载量: 105

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