马铃薯PGA1基因的克隆及序列分析

马铃薯PGA1基因的克隆及序列分析

论文摘要

糖苷生物碱是马铃薯块茎中普遍存在的一种有苦味的毒性甾类生物碱,其毒性可使人、动物变畸形或死亡,PGA1基因是催化糖苷生物碱合成的关键酶基因。通过同源克隆的方法,采用RT-PCR技术对马铃薯大西洋品种的PGA1基因进行克隆,获得了PGA1基因的c DNA序列;并对马铃薯PGA1基因进行生物信息学分析。结果表明,PGA1基因的CDS全长为1 497 bp,编码498个氨基酸,所编码蛋白的分子质量为57.087 ku,理论等电点为9.29,为不稳定蛋白;该蛋白的二级结构包括α螺旋(52.41%)、β转角(6.02%)、延伸链(12.85%)和无规则卷曲(28.71%),其中,α螺旋和无规则卷曲为主要元件,与预测的蛋白质三级结构一致。研究结果可为进一步深入了解PGA1基因的功能和调控机制,利用基因工程技术调控马铃薯中糖苷生物碱含量提供理论依据。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 材料及主要试剂
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 马铃薯总RNA的提取及c DNA的合成
  •     1.2.2 马铃薯PGA1基因的克隆
  •     1.2.3 马铃薯PGA1基因序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 马铃薯PGA1基因的克隆及序列特征分析
  •   2.2 蛋白质疏水性分析及蛋白质结构预测
  •   2.3 蛋白质跨膜区域、信号肽及亚细胞定位分析
  • 3 结论与讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 闫建俊,白云凤,左静静,裴成成,左敏

    关键词: 马铃薯,基因,基因克隆,序列分析

    来源: 山西农业科学 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,农作物

    单位: 山西省农业科学院作物科学研究所

    基金: 山西省青年科技研究基金项目(201701D221210),山西省农业科学院特色农业技术攻关项目(YGG17127),山西省农业科学院作物科学研究所青年基金项目(ZZQ1702)

    分类号: S532;Q943.2

    页码: 2073-2077

    总页数: 5

    文件大小: 3653K

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