蓝莓角鲨烯环氧化酶基因的克隆与表达分析

蓝莓角鲨烯环氧化酶基因的克隆与表达分析

论文摘要

角鲨烯环氧化酶(SQE)催化角鲨烯合成三萜类骨架β-香树酯前体2,3氧化鲨烯,是熊果酸合成途径中的重要限速酶。本研究采用RT-PCR技术从‘喜来’蓝莓根中克隆得到VcSQE基因,全长序列1 744 bp,序列分析结果表明,其含有1 620 bp开放阅读框,编码539个氨基酸;氨基酸同源序列分析表明,蓝莓与其它物种SQE蛋白氨基酸序列相似性很高,与山茶科的茶相似性最高,达90.6%,与猕猴桃相似性为89.7%;不同植物SQE蛋白序列分析发现,该类植物SQE含有3个保守结构域,均在VcSQE中存在;荧光定量试验表明,VcSQE基因在叶中表达量最高,根中表达量最低。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验材料
  •   1.2 总RNA的提取和cDNA的合成
  •   1.3 VcSQE基因的克隆
  •   1.4 生物信息学分析
  •   1.5 VcSQE基因组织表达特性
  • 2 结果与分析
  •   2.1 VcSQE基因的克隆
  •   2.2 VcSQE基因序列分析
  •   2.3 VcSQE的同源序列分析
  •   2.4 VcSQE的系统进化分析和蛋白保守结构域分析
  •   2.5 VcSQE基因在不同组织中的相对表达量分析
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 陈新,徐丽,张力思,宗晓娟,魏海蓉,王甲威,谭钺,朱东姿,洪坡,刘庆忠

    关键词: 蓝莓,角鲨烯环氧化酶基因,生物信息学分析,荧光定量

    来源: 山东农业科学 2019年10期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学

    单位: 山东省果树研究所/山东省果树生物技术重点实验室

    基金: 国家自然科学基金项目(31500248),山东省农业科学院青年基金项目(2015YQN35),山东省现代农业产业技术体系果品产业创新团队专项基金项目(SDAIT-06-04)

    分类号: Q55;Q78

    DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2019.10.001

    页码: 1-7

    总页数: 7

    文件大小: 5883K

    下载量: 79

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