结核分枝杆菌Rv3248c生物信息学分析及同源建模

结核分枝杆菌Rv3248c生物信息学分析及同源建模

论文摘要

运用生物信息学方法对结核分枝杆菌Rv3248c进行结构功能分析及同源建模。通过NCBI、BLAST、ProtParam和Interproscan等生物信息学方法对Rv3248c进行同源性、理化性质、保守序列、跨膜、信号肽二级结构和三级结构预测分析。结果显示Rv3248c的氨基酸序列与腺苷高半胱氨酸水解酶高度一致,该蛋白包含495个氨基酸,没有跨膜及信号肽结构,其二级结构α螺旋占43%,无规则卷曲占41.8%,β折叠占15.2%,利用同源建模法构建该蛋白的三级结构,并对该模型进行质量评估。研究结果有望对结核病的诊断和治疗提供参考。为进一步研究该蛋白质的结构与功能打下基础。

论文目录

  • 1 引言
  • 2 实验方法
  •   2.1 同源性分析
  •   2.2 理化性质分析
  •   2.3 保守序列分析
  •   2.4 跨膜分析
  •   2.5 信号肽分析
  •   2.6 三级结构预测
  • 3 实验结果
  •   3.1 同源性分析结果
  •   3.2 理化性质分析结果
  •   3.3 保守序列分析结果
  •   3.4 跨膜分析结果
  •   3.5 信号肽分析结果
  •   3.6 二级结构预测结果
  •   3.7 三级结构预测结果
  • 4 结束语
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 周放,项杰,占卫红,王培东,何俊才,余晓丽,张可

    关键词: 结核分枝杆菌,生物信息学,同源建模

    来源: 武汉轻工大学学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 工程科技Ⅰ辑,基础科学,医药卫生科技

    专业: 生物学,基础医学

    单位: 武汉轻工大学生物与制药工程学院,武汉市医疗救治中心检验科

    分类号: R378.911;Q811.4

    页码: 27-31

    总页数: 5

    文件大小: 1072K

    下载量: 193

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