腺苷酸环化酶3缺失对小鼠主要嗅觉表皮组织内DNA甲基化的影响

腺苷酸环化酶3缺失对小鼠主要嗅觉表皮组织内DNA甲基化的影响

论文摘要

腺苷酸环化酶3 (adenylate cyclaseⅢ,AC3)是嗅觉系统中的重要成分,AC3缺失后小鼠的主要嗅觉表皮组织(main olfactory epidermal,MOE)随年龄增长逐渐变薄,MOE内基因表达谱发生改变. DNA甲基化在动物发育、基因表达调控中具有重要作用.为了探讨AC3缺失后小鼠MOE内基因启动子甲基化水平的改变以及对基因表达的影响,本文采用DNA甲基化免疫共沉淀芯片(methylated DNA immunoprecipitation chip,MeDIP-chip)筛选AC3缺失小鼠MOE内启动子区甲基化差异表达基因,利用甲基化特异PCR (methylation-specific PCR,MSP)、实时荧光定量PCR (qRT-PCR)进一步检测部分甲基化差异基因的DNA甲基化水平改变和表达差异.结果表明,AC3缺失小鼠中有1 978个基因启动子的甲基化水平发生了改变,占总探针数的9%,其中727个基因启动子甲基化水平升高,1 251个甲基化水平降低.功能分析表明,这些启动子甲基化发生改变的基因主要涉及的功能分别与嗅觉受体、神经发育、cAMP信号通路、ATP结合、钙离子调控、乙酰化修饰、转录因子等相关. MSP检测表明,嗅觉受体基因Olfr1153、Olfr231、Olfr378、Olfr651、Olfr691启动子区的甲基化水平升高,Cngb1、Pde4a和Olfr1394基因启动子区的甲基化水平降低. qRT-PCR结果显示,基因Cngb1、Hcn4、Olfm1、Olfr1394、Olfr1153、Olfr231、Olfr378、Olfr691的表达水平显著下降,而Pde4a和Olfr651基因的表达水平显著升高.总之,AC3缺失后MOE内嗅觉受体基因、神经发育相关基因、cAMP信号通路等相关基因启动子甲基化水平发生显著改变,影响核苷酸切除修复、DNA复制、错配修复等信号通路的传导,从而综合调控小鼠MOE内的基因表达数量和水平.

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 实验动物
  •   1.2 DNA甲基化芯片检测
  •     1.2.1 基因组DNA的提取及片段化
  •     1.2.2 甲基化芯片杂交
  •     1.2.3 差异甲基化基因的筛选
  •   1.3 DNA甲基化特异性PCR
  •   1.4 荧光定量PCR
  •   1.5 统计学分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 差异甲基化基因启动子的筛选
  •   2.2 差异甲基化启动子基因功能分析
  •   2.3 MSP检测基因启动子区DNA甲基化变化
  •   2.4 qRT-PCR检测部分基因mRNA表达情况
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 周艳芬,王亚文,王晓婷,舒俐,李淑娟,王振山

    关键词: 嗅觉受体基因,甲基化,腺苷酸环化酶,信号通路,主要嗅觉表皮组织

    来源: 生物化学与生物物理进展 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 河北大学生命科学学院,河北大学预防医学与卫生事业管理系,河北大学医学院

    基金: 国家自然科学基金面上资助项目(31871246,31471178),河北省自然科学基金资助项目(C2016201008),河北省巨人计划资助项目(201235),河北大学大学生创新创业训练计划资助项目(2018277)~~

    分类号: Q434

    DOI: 10.16476/j.pibb.2018.0261

    页码: 474-484

    总页数: 11

    文件大小: 2488K

    下载量: 122

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