导读:本文包含了转座子插入论文开题报告文献综述、选题提纲参考文献及外文文献翻译，主要关键词:座子,基因,玉米,不饱和,文库,子粒,突变体。
转座子插入论文文献综述
雷浩然,张晔[1]（2019）在《想要“高颜值”玉米，来这里找跳跃基因吧》一文中研究指出不知你有没有注意到，从菜市场买回来的玉米，有的是黄灿灿的，有的却像个大花脸，中间夹杂着紫色、白色的玉米粒？其实，这是玉米的天性使然。玉米基因中有很多非常活跃的转座子，它们就像一支“小画笔”，跳到哪个基因上，就会抹去那里本来的“颜色”。因此导致籽粒(本文来源于《科技日报》期刊2019-12-11）
蒋云峰,王琰,郭祯儒,徐彬杰,朱静[2]（2019）在《Q基因的转座子插入突变导致去驯化过程中普通小麦重获脆穗性》一文中研究指出Q是重要的驯化基因,它控制小麦的脱粒性、穗轴脆性、开花期、穗密度等驯化相关性状。西藏半野生小麦是我国特有的六倍体小麦亚种,其最典型的性状是脆穗。我们前期的研究中已经从西藏半野生小麦中鉴定到3个控制脆穗性状的主效QTL,分别位于2DL、3DS和5AL。本研究通过近等基因系衍生群体对位于5AL的QTL(Qbr.sau-5A)进行精细定位,成功将其定位于0.04 cM的遗传距离范围,对应34 kb的物理区域,最终确认Qbr.sau-5A的效应来源是西藏半野生小麦的Q基因(命名为Q~t)。基因序列分析显示Q的第五外显子有一个161 bp的转座子插入。利用酵母双杂、突变体以及转基因方法证明功能丧失是Q导致西藏半野生小麦脆穗的原因。基于Q基因区域147 kb的捕获测序序列构建聚类树,进一步证明Q~t起源于驯化的Q基因,是普通小麦去驯化的结果。在282份具有脆穗性状的小麦材料中检测Q~t,发现Q~t仅存在于西藏半野生小麦材料中,并受到强烈的选择。综上,本研究解析了一个西藏半野生小麦控制脆穗性状的主效位点Qbr.sau-5A为阐明西藏半野生小麦的起源提供了关键分子证据,为了解作物去驯化提供了新的有价值的案例。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11）
陈伟,陈才,王宵燕,张丽,王伟[3]（2019）在《猪VRTN基因SINE转座子插入多态与生长和繁殖性状的关联分析》一文中研究指出椎骨发育相关基因(vertebrae development associated, VRTN)是动物椎骨发育的重要调控基因,研究表明猪(Sus scrofa domesticus)VRTN基因中存在一个短散在重复序列(short interspersed repeated sequence, SINE)的插入多态,该多态可能与猪的脊椎数关联。本研究通过PCR检测、性状关联分析和生物信息学分析等研究了SINE插入多态在不同品种间的分布及其对猪生长和繁殖性状的影响。结果表明,引入品种SINE+频率高于培育猪种和中国地方猪种,大白猪SINE+/+个体100 kg体重日龄显着高于SINE-/-个体(P<0.05),大白猪SINE+/+个体眼肌面积显着低于SINE-/-个体(P<0.05)。产活仔数等繁殖性状与SINE插入多态无显着关联。经与表达序列标签(expressed sequence tag, EST)等数据库序列比对未发现SINE与VRTN基因形成融合转录本。本研究表明VRTN基因中SINE插入多态可能与猪生长速度和瘦肉率有关联,此结果为该分子标记在猪分子育种中的应用提供了参考。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年03期）
王亚琴,张宇瑶,贺红,李颛,邓志成[4]（2019）在《广藿香青枯病菌Tn5转座子插入突变体的构建》一文中研究指出该研究以从感染了青枯病的广藿香植株中分离的青枯菌菌株PRS-84为供试菌株,利用电击转化法,对青枯菌进行Tn5转座子插入突变,在含卡那霉素的培养基上筛选抗性克隆。对抗性克隆进行卡那霉素抗性基因的PCR鉴定,并利用反向PCR技术获得转化子Tn5转座子插入位点的侧翼序列并进行序列测定与分析。结果表明,青枯菌感受态细胞经电击转化后,获得了抗性克隆。经PCR扩增,抗性克隆在预计的约700 bp处出现特异性条带。反向PCR扩增获得了转化子Tn5转座子插入位点的侧翼序列,经序列测定及同源性分析,初步推测3个突变体的Tn5转座子插入位点基因分别为typ A基因、rec O基因和gid A基因。该研究建立了广藿香青枯病菌Tn5转座子插入突变体系,获得了青枯菌Tn5转座子插入突变体,为构建广藿香青枯菌突变体库及发现青枯菌致病基因奠定了基础。(本文来源于《中国中药杂志》期刊2019年01期）
魏立帆[5]（2018）在《利用转座子插入突变文库研究杀鱼爱德华氏菌代谢和毒力互作机制》一文中研究指出转座子是存在于染色体上的一段可移动的DNA。基于已经成熟的Mariner家族Himar1转座子pMAR2×T7,我们设计并改造成满足特定需求的转座子pMKGR。pMKGR携带庆大霉素抗性标签和mCherry红色荧光标签,也携带无启动子的EGFP和卡那霉素阅读框,识别TA碱基位点并且插入染色体。以杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)为模式菌,成功构建了包含20,668个插入位点确定的突变株文库。该文库覆盖杀鱼爱德华氏菌全基因组(编码3,599基因)中2,806个基因,覆盖率为78.0%。根据文库的分析数据和中性碱基模型,我们预测杀鱼爱德华氏菌大约有464个必需基因。针对文库不同的筛选目的,在文库的基础上构建了 5个不同的子库,利用5个子库进行了体内外毒力相关基因的筛选。Tn-seq筛选结果显示,杀鱼爱德华氏菌毒力表达与其代谢状态密切相关,尤其是甘露糖代谢和脂肪酸代谢,相关基因的突变导致该菌的体内存活能力显着降低。对于甘露糖代谢,E.piscicida通过ManXYZ催化甘露糖生成甘露糖-6磷酸(Man-6P),经ManA催化进一步生成果糖-6磷酸(Fru-6P),参与糖酵解过程。我们发现,甘露糖代谢产物Man-6P可以通过直接结合DeoR家族转录调控因子ETAE_2071(EvrA),调控叁型分泌系统(T3SS)以及六型分泌系统(T6SS)表达。实验证实,EvrAR141和EvrAR221是和Man-6P相互作用的关键氨基酸。突变这两个氨基酸后,EvrA不能感受并结合甘露糖,进而关闭esrB的表达。在考察脂肪酸和T3/T6SS表达之间关系时,我们发现E.piscicida体内不饱和脂肪酸含量和T3SS显着负相关(R2=0.981)。实验发现,游离长链单不饱和脂肪酸(UFA)可以直接与EsrC相互作用,使EsrC失去结合DNA的能力,最终关闭T3/T6SS的表达。通过对EsrC蛋白结构的模拟分析,发现EsrC和UFA直接作用的关键氨基酸为EsrCR38。在E.piscicida感染宿主和成功定植过程中,UFA扮演了更为重要的角色。UFA不仅动态调控了杀鱼爱德华氏菌T3/T6SS毒力系统的表达,而且促进了宿主细胞内脂滴(Lipid droplet,LD)的大量形成,进一步介导炎症反应,清除病原菌。在宿主细胞中,多余的脂肪酸主要以甘油叁酯和胆固醇酯的形式储存在LD细胞器中。细胞中LD的含量与不饱和脂肪酸含量线性相关。E.pisciciEa感染宿主细胞的过程显着降低了宿主细胞中LD的含量,E.piscicida ΔT3SS感染过程却显着激活了宿主体内SCD1表达,促进了LD形成。E.piscicida T3SS对宿主细胞中UFA/LD合成的抑制不依赖于T3SS针状结构,而依赖于T3SS效应物。UFA显着抑制了EE.piscicida在HeLa细胞中定植,E.piscicida在SCD1-/-细胞中的定植水平显着高于在野生型HeLa细胞中的定植水平。在E.piscicida感染斑马鱼过程中,外加油酸显着提高了斑马鱼的存活率,SCD1-/-斑马鱼显示出对E.piscicida更高的敏感性。UFA/LD既能抑制病原菌毒力表达,又能激活宿主免疫响应,以抵抗和清除外来的病原菌。因此,UFA/LD在抵抗E.piscicida感染宿主方面发挥了重要作用。在自然界中,病原菌利用自身代谢物或者宿主体内代谢物作为信号调控毒力表达是病原菌适应复杂多变体内外环境的一种重要策略。本课题利用转座子插入突变文库为工具,以E.pipscicida为模式菌,研究病原微生物代谢和毒力互作关系。本研究为水产病原防治和水产养殖提供重要的指导。(本文来源于《华东理工大学》期刊2018-10-23）
赵熠[6]（2018）在《Sleeping Beauty转座子介导的小鼠胚胎干细胞插入突变研究》一文中研究指出研究基因功能有很多方法,比如经典正向遗传学技术常用的紫外诱变、化学诱变、逆转录病毒或转座子介导的插入突变等,反向遗传学技术常用的TALEN、ZFN、CRISPR/Cas9等。尽管基因编辑的方法有很多,但小鼠的全基因组突变仍然是一项具有挑战性的任务。Sleeping Beauty(SB)转座子系统,自从1997年发现以来,常与基因捕获的方法协同作用,进行基因功能的研究。本课题采用的就是将SB转座系统与poly(A)-trap载体结合,以用于研究小鼠胚胎干细胞(mES)的插入突变。我们使用的poly(A)-trap载体含有缺乏poly(A)信号的新霉素(Neo)抗性基因的表达盒,其侧翼为SB转座子的两个反向末端重复序列。Poly(A)-trap的完整组件可以插入目标基因的TA二核苷酸,与内源基因正确剪接,同时使用1 μg/ml DOX瞬时诱导SB转座酶表达。能够有效中断mES细胞中被捕获到的基因的转录从而形成多个G418抗性细胞克隆。首先在已有基础上构建了新的poly(A)捕获载体 pT2/Poly(A)-trap-Short、pT2/Poly(A)-trap-ES 及诱导表达 SB11转座酶的转座酶载体pCMV-rtTA · TRE-SB11。这两个捕获载体pT2/Poly(A)-trap-Short和pT2/Poly(A)-trap-ES上包括基因识别组件和基因破坏组件。转座酶载体pCMV-rtTA·TRE-SB11则是通过Tet-on系统诱导表达SB11转座酶,从而提高突变效率。我们通过Tet-on系统所需的DOX对滋养层细胞、小鼠胚胎干细胞的生长增殖等不同层面的影响情况,确定了 DOX合适的使用浓度及使用时间。对得到的突变小鼠胚胎干细胞品系进行了胚胎干细胞特性如全能性、自我更新能力、遗传稳定性、分化潜能等的检测,明确了我们使用的转座子及捕获载体和诱导方式、筛选方法对小鼠胚胎干细胞应具备的特性不会造成显着的破坏,可使它们尽可能得到最大程度的维持。同时还对构建突变小鼠胚胎干细胞品系的方案进行了一定程度的优化,将转座效率从10%左右提高到了 42%左右。最终我们基于SB转座子确定了一套完整的方法体系用于构建突变小鼠胚胎干细胞品系。在数次突变筛选中,我们从二十叁个细胞克隆中鉴定了六个转座事件,其中四个插入内源基因,两个位于内源基因之间。Syngap1+/-细胞自我更新、全能性、遗传稳定性和分化的能力不受DOX处理和G418筛选的影响。这些发现表明,这种SB转座子系统介导的poly(A)捕获可用作大规模诱导小鼠胚胎干细胞基因突变和进一步产生突变小鼠品系的替代工具。(本文来源于《武汉大学》期刊2018-10-01）
吴志娟,方茜,李永强,陈文荣,宗宇[7]（2018）在《越橘反转录转座子插入多态性分子标记开发及品种鉴别》一文中研究指出从蔓越橘(Vaccinium macrocarpon Ait.)品种‘Ben Lear’基因组序列中发掘了398 014 bp的长末端重复序列反转录转座子(LTR-RT),占整个基因组序列的11.17%;鉴别出228条Ty1-Copia家族成员和137条Ty3-Gypsy家族成员。以45个越橘(Vaccinium spp.)品种和1个蔓越橘品种为材料,从53对基于LTR-RT插入位点开发的引物中筛选出17对多态性引物,建立了越橘品种的LTR-RT插入多态性(RBIP)分子标记。使用RBIP标记对46个品种进行了亲缘关系分析和分子身份证构建,其中多态性最高的位点是Vmrg1,最低的位点是Vmrg14。其PCR产物的大小变化范围为200~463 bp,最小长度片段和最大长度片段分别出现在位点Vmrc19和Vmrc3。46个品种基于遗传距离聚为6组,组Ⅰ包括3个北高丛越橘品种,蔓越橘单独聚为组Ⅵ,其他4组中北高丛越橘、南高丛越橘或兔眼越橘混杂在一起。利用17个位点组成的"1"、"0"字符串构建了45份越橘品种和1份蔓越橘品种的唯一分子身份证,为越橘品种的鉴别提供了参考。(本文来源于《园艺学报》期刊2018年04期）
周向珍,朱辉[8]（2018）在《百脉根根瘤菌MAFF303099 Tn5转座子插入突变体库的构建及筛选》一文中研究指出以百脉根根瘤菌MAFF303099为材料,利用转座子Tn5-sacB转座技术得到了约10 000个MAFF303099的转座接合子,构建随机插入突变体库进行保藏;同时建立了一套能从突变体库中快速筛选突变菌株的方法,且鉴定到共同结瘤基因nodB的突变体。结果表明:组成突变体库的接合子基因组中均有Tn5-sacB插入,叁亲本转化效率为3.75×10~(-5);与野生型相比,MAFF303099 nodB的突变体在表型上不能使其宿主百脉根形成根瘤。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2018年02期）
孙成飞,邹曙明,陈杰,蒋霞云[9]（2018）在《Tgf2转座子介导的草鱼、团头鲂和鲫插入诱变研究》一文中研究指出转座子介导的插入诱变(insertional mutagenesis)策略在养殖鱼类功能基因发掘和解释方面有着重要的研究意义。本研究以高效Tgf2转座子为研究基础,构建了pTgf2-β-actin-eGFP、pTgf2-EF1α-eGFP、pTgf2-Myo D-eGFP和pTgf2-Krt8-eGFP这4种带有不同启动子的供体质粒,以及pCS2-gf TP这种gf TP转座酶mRNA的体外表达的辅助质粒。将供体质粒和gf TP转座酶mRNA一起注射到草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、团头鲂(Megalobrama amblycephala)和鲫(Carassius auratus)的1~2细胞期受精卵中,经对子代增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,eGFP)整合率的检测和筛选,初步构建了1个以转座子为工具介导的插入诱变库。实验表明,在早期胚胎中,鲫和团头鲂的荧光率达到90%,在草鱼中则高达95%,随着供体质粒注射的改变,表现出肌肉、表皮及全身不同的绿色荧光发光特征。eGFP基因平均整合率在3种鱼类子代平游期的为50%~53%,在1龄阶段为33.0%~36.1%。在3种鱼类中得到插入诱变突变体,获得草鱼阳性个体162尾,其中有45尾表型明显差异;鲫阳性个体60尾,其中有14尾表型明显差异;团头鲂阳性个体51尾,其中有10尾表型明显差异。结果表明,通过插入Tgf2转座子,可在草鱼、团头鲂和鲫等鲤科鱼类中实现基因组的插入诱变,本研究结果可为目标性状功能基因的挖掘和功能机制研究积累一定的基础。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2018年01期）
张建波[10]（2017）在《用转座子分析胞苷脱氨酶中的插入突变耐受位点》一文中研究指出在蛋白质工程中,通过在蛋白质的特定位点进行拆分或插入新的结构域可构造出不同的调控元件,但如何发现蛋白质中特定的改造位点限制着这些调控元件的构建。因此,找到一种合适的方法来筛选目的蛋白中的改造位点就显得尤为重要。在我们的研究中,我们构建了基于转座子的体外转座反应体系,经优化后能够快速、高效地构建转座子随机插入文库,且构建的随机插入文库满足多样性和均一性的要求。在目的蛋白的选择上,我们将激活诱导的胞苷脱氨酶(AID)蛋白作为研究对象,AID蛋白的脱氨作用能够实现碱基C→T的特异性突变,利用AID蛋白及其同家族成员的脱氨特性构建的单碱基基因编辑工具能够实现单碱基的精确编辑,由此了解AID蛋白中的插入突变耐受位点对其后续利用有着重要的意义。为此,我们构建了转座子随机插入到AID蛋白中的文库,通过后续的酶切连接分别将(GGGGS)2片段和(EAAAK)2片段插入到AID蛋白中,最终通过基于利福平抗性的鉴定方法筛选出AID蛋白中的两个耐受插入区域:loop7和C端,并在此基础上结合易错PCR和循环富集筛选的策略筛选出了一系列活性较野生型AID蛋白不同程度提高的、带有插入突变的易错PCR突变体,这为后续改造和利用AID蛋白提供了实验基础。(本文来源于《中国科学技术大学》期刊2017-10-01）
转座子插入论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
Q是重要的驯化基因,它控制小麦的脱粒性、穗轴脆性、开花期、穗密度等驯化相关性状。西藏半野生小麦是我国特有的六倍体小麦亚种,其最典型的性状是脆穗。我们前期的研究中已经从西藏半野生小麦中鉴定到3个控制脆穗性状的主效QTL,分别位于2DL、3DS和5AL。本研究通过近等基因系衍生群体对位于5AL的QTL(Qbr.sau-5A)进行精细定位,成功将其定位于0.04 cM的遗传距离范围,对应34 kb的物理区域,最终确认Qbr.sau-5A的效应来源是西藏半野生小麦的Q基因(命名为Q~t)。基因序列分析显示Q的第五外显子有一个161 bp的转座子插入。利用酵母双杂、突变体以及转基因方法证明功能丧失是Q导致西藏半野生小麦脆穗的原因。基于Q基因区域147 kb的捕获测序序列构建聚类树,进一步证明Q~t起源于驯化的Q基因,是普通小麦去驯化的结果。在282份具有脆穗性状的小麦材料中检测Q~t,发现Q~t仅存在于西藏半野生小麦材料中,并受到强烈的选择。综上,本研究解析了一个西藏半野生小麦控制脆穗性状的主效位点Qbr.sau-5A为阐明西藏半野生小麦的起源提供了关键分子证据,为了解作物去驯化提供了新的有价值的案例。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
转座子插入论文参考文献
[1].雷浩然,张晔.想要“高颜值”玉米，来这里找跳跃基因吧[N].科技日报.2019
[2].蒋云峰,王琰,郭祯儒,徐彬杰,朱静.Q基因的转座子插入突变导致去驯化过程中普通小麦重获脆穗性[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019
[3].陈伟,陈才,王宵燕,张丽,王伟.猪VRTN基因SINE转座子插入多态与生长和繁殖性状的关联分析[J].农业生物技术学报.2019
[4].王亚琴,张宇瑶,贺红,李颛,邓志成.广藿香青枯病菌Tn5转座子插入突变体的构建[J].中国中药杂志.2019
[5].魏立帆.利用转座子插入突变文库研究杀鱼爱德华氏菌代谢和毒力互作机制[D].华东理工大学.2018
[6].赵熠.SleepingBeauty转座子介导的小鼠胚胎干细胞插入突变研究[D].武汉大学.2018
[7].吴志娟,方茜,李永强,陈文荣,宗宇.越橘反转录转座子插入多态性分子标记开发及品种鉴别[J].园艺学报.2018
[8].周向珍,朱辉.百脉根根瘤菌MAFF303099Tn5转座子插入突变体库的构建及筛选[J].华中农业大学学报.2018
[9].孙成飞,邹曙明,陈杰,蒋霞云.Tgf2转座子介导的草鱼、团头鲂和鲫插入诱变研究[J].农业生物技术学报.2018
[10].张建波.用转座子分析胞苷脱氨酶中的插入突变耐受位点[D].中国科学技术大学.2017
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