苦参查尔酮异构酶的基因克隆与表达分析

苦参查尔酮异构酶的基因克隆与表达分析

论文摘要

目的为明晰苦参查尔酮异构酶(sfCHI)的结构基因信息及其在苦参黄酮类化合物生源路径中的表达调控机理。方法本实验以苦参为研究对象,基于其转录组学数据,克隆sfCHI基因并针对该cDNA序列展开生物信息学分析,采用半定量PCR方法检测安徽产苦参不同组织中sfCHI基因表达情况。结果结果显示苦参sfCHI基因的cDNA序列长度为1 265 bp,含有630 bp的开放式阅读框(ORF),编码209个氨基酸;序列分析表明sfCHI与狭叶羽扇豆查尔酮异构酶基因相似性最高,达89.95%;进化树分析该基因与大豆、野大豆等植物的亲缘关系较近;半定量PCR结果显示sfCHI基因在苦参根中表达量最低,在叶、叶柄与茎中的表达未见明显差异。结论本研究通过对苦参查尔酮异构酶的基因克隆与不同组织间的表达分析,初步明确了该基因的序列信息与理化特征,这对进一步研究苦参黄酮类物质生物合成机制将起到积极的推动作用。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 总RNA提取及cDNA的合成
  •     1.2.2 引物设计及sfCHI序列信息验证
  •     1.2.3 生物信息学分析
  •     1.2.4 苦参sfCHI不同组织间表达的半定量PCR分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 苦参sfCHI的基因克隆
  •   2.2 苦参CHI基因所编码蛋白质预测
  •   2.3 苦参CHI基因同源性及进化分析
  •   2.4 半定量表达分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 易雨琪,韩荣春,俞年军,顾晓,苏蝶,童小慧,许菲,王丽萍

    关键词: 苦参,查尔酮异构酶,基因克隆,半定量

    来源: 云南中医学院学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,农业科技

    专业: 农作物

    单位: 安徽中医药大学安徽省中医药科学院中药资源保护与开发研究所

    基金: 国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项(2017YFC1701602),安徽省高校优秀青年人才支持计划项目(gxyq2017016),安徽省重点研究与开发计划项目(1804b06020356),安徽中医药大学自然重点项目(2017zrzd011,2019zrzd02)

    分类号: S567.53

    DOI: 10.19288/j.cnki.issn.1000-2723.2019.03.004

    页码: 22-27

    总页数: 6

    文件大小: 2330K

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