论文摘要
复杂生物系统蛋白质组的深度覆盖鉴定得益于近年来快速发展的高效色谱分离和串联质谱分析技术。二维高效液相色谱(2-D HPLC)是实现复杂肽混合物正交分离的有效手段,但其缺点是运行时间长,通常要求肽上样量在毫克级别,且收集时的组分体积大,后续合并流程复杂,而有望替代其的StageTip技术,则由于有限的色谱分离梯度,难以达到充分的正交分离。该文探索了超高效液相色谱(UPLC)和八端口转子阀联用,作为高效、便捷肽段预分离和收集系统的可行性。研究结果显示,将UPLC的高pH反相色谱分馏与在线LC-MS/MS相结合,可以实现高pH和低pH条件下基于肽段不同色谱保留行为的正交互补分离,在蛋白质鉴定方面表现出优越的性能。应用该方法对人肝癌细胞系HepG2进行3次技术重复试验,重复试验间具有非常高的定量重现性(决定系数R2>0.95)。与传统StageTip方法相比,肽段鉴定数提高了23.52%。该分级方法灵活、稳定,能够针对较少的样品开展蛋白质组深度覆盖分析。
论文目录
文章来源
类型: 期刊论文
作者: 燕蒙,赵洋,张养军,应万涛,钱小红
关键词: 二维液相色谱,超高效液相色谱,八端口转子阀,蛋白质组学,分馏
来源: 色谱 2019年05期
年度: 2019
分类: 工程科技Ⅰ辑
专业: 化学
单位: 广东药科大学药学院,军事科学院军事医学研究院生命组学研究所蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心国家蛋白质科学中心-北京
基金: 国家重点研发计划(2017YFC0906600,2016YFA0501300),国家自然基金重点项目(81530021),军事医学创新工程专项(16CXZ027)~~
分类号: O657.63;O629.73
页码: 477-483
总页数: 7
文件大小: 1157K
下载量: 63
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