南海深海氮循环微生物的原位培养与多样性分析

南海深海氮循环微生物的原位培养与多样性分析

论文摘要

借助自主研发的深海水体原位定植培养系统,在南海3 300 m的深海水体中进行了氮循环微生物的原位培养.通过向富集仓中投加缓释肥(铵盐、硝酸盐和尿素)进行了为期17个月的原位富集.结合高通量测序技术和分离培养的方法,对深海原位富集物及实验室二次富集物进行了微生物多样性分析. 16S rRNA基因高通量测序结果表明,在南海原位富集样品中,细菌以变形菌门丰度最高,富集仓内脱脂棉附着介质和仓内水样中的最优势属分别为希瓦氏菌属(Shewanella)和科韦尔氏菌属(Colwellia);古菌以奇古菌门为主,其中氨氧化古菌(AOA)所占比例很高.通过平板培养分离到17株细菌,主要包括盐单胞菌属(Halomonas)、海杆菌属(Marinobacter)和亚硫酸盐杆菌属(Sulfitobacter)等.通过不同起始氮源(氨氮、硝酸盐、亚硝酸盐)和培养温度(28℃和10℃),对原位富集样品进行实验室二次富集,获得了5个富集菌群.分析发现,它们均具有较好的脱氮效果,可以产生N2O或N2;这些菌群均以盐单胞菌属占绝对优势,其次为海源菌属(Idiomarina)或海杆菌属,其中盐单胞菌和海源菌成功获得分离.单菌功能验证表明,分离获得的盐单胞菌具有好氧反硝化能力,其在原位环境下反硝化活性尚有待确认.

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 深海原位富集与样品采集
  •   1.2 培养基
  •   1.3 原位富集样品总DNA提取
  •   1.4 原位富集样品高通量测序和分析
  •   1.5 原位富集样品可培养菌分离鉴定
  •   1.6 实验室二次富集
  •   1.7 二次富集样品高通量测序和序列分析
  •   1.8 富集物可培养细菌的分离鉴定及反硝化功能验证
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 深海原位富集样品的微生物多样性
  •   2.2 原位富集样品中可培养细菌多样性
  •   2.3 不同氮源的实验室二次富集
  •   2.4 原位富集样品的实验室二次富集细菌多样性
  •   2.5 二次富集样品中可培养细菌分析及反硝化功能验证
  •   2.6 讨论
  •     2.6.1 南海深海氮源原位富集物微生物多样性分析
  •     2.6.2 二次富集物细菌多样性及功能分析
  • 3 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 王蕾,王丽萍,董纯明,李小义,李登峰,邵宗泽

    关键词: 海洋生物学,氮循环,原位富集,微生物多样性,好氧反硝化,深海

    来源: 应用海洋学学报 2019年01期

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学

    单位: 宁波大学海洋学院,自然资源部第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室

    基金: 国家自然科学基金资助项目(41506152),科技部深海生物863计划资助项目(2012AA092102),科技部海洋微生物资源共享服务子平台运行与服务支撑资助项目(NIMR-2018-9)

    分类号: Q938.8

    页码: 1-13

    总页数: 13

    文件大小: 693K

    下载量: 443

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