论文摘要
目的通过生物信息学分析,找到多个研究之间共同的颅内动脉瘤相关的致病分子。方法通过GEO数据库,下载颅内动脉瘤相关的表达谱数据库,统计每个GEO数据集中差异表达分子,将参数设置为p<0.05,且表达差异倍数LogFC>2或<-2。比较各组之间阳性分子。利用DAVID数据库,对共同的分子进行基因本体论（GO）分析和KEGG通路富集分析,以及利用STRING数据库进行蛋白间交互作用（PPI）的分析。最后利用Cytoscape软件中的MCODE插件,找出庞大交互网络中的关键通路。结果共找到17个GEO数据集,经过筛选,5个GEO数据集纳入本研究（GSE6551,GSE26969,GSE46337,GSE15629和GSE54083）。分析计算后发现,这5个GEO数据集之间没有共同的差异表达分子,各组差异表达分子进行GO分析和KEGG分析业同样显示,各组之间可能不存在共同的颅内动脉瘤相关致病通路。二在对2个中国人群的GEO数据集（GSE26969和GSE46337）进行分析后发现,共有102个差异表达分子,关键通路分析发现,这102个差异表达分子可能涉及的共同关键通路为MHC相关的分子通路和血管平滑肌细胞收缩相关通路。结论 1.各研究之间结果存在异质性,推测可能是种族差异性导致的。2.中国人群颅内动脉瘤的致病分子可能于MHC分子通路和血管平滑肌细胞收缩相关通路有关。
论文目录
文章来源
类型: 国内会议
作者: 叶雷,夏雪,齐皓,程宏伟
关键词: 颅内动脉瘤,生物信息学,差异表达基因,基因本体论,通路富集,蛋白间交互作用,人类组织相容性抗原,血管平滑肌细胞收缩
来源: 第十四届中国医师协会神经外科医师年会 2019-05-10
年度: 2019
分类: 基础科学,医药卫生科技
专业: 生物学,神经病学
单位: 安徽医科大学第一附属医院神经外科
分类号: R743;Q811.4
DOI: 10.26914/c.cnkihy.2019.074205
页码: 1065
总页数: 1
文件大小: 52k
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标签：颅内动脉瘤论文; 生物信息学论文; 差异表达基因论文; 基因本体论论文; 通路富集论文; 蛋白间交互作用论文; 人类组织相容性抗原论文; 血管平滑肌细胞收缩论文;