2017年福建地区PRRSV分子检测及ORF5基因变异分析

2017年福建地区PRRSV分子检测及ORF5基因变异分析

论文摘要

【目的】研究2017年福建地区中小规模猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株的分子流行情况。【方法】从福建地区中小规模猪场收集83份疑似蓝耳阳性病料,对编码GP5蛋白的ORF5基因进行了RT-PCR检测和遗传进化分析。【结果】采集的83份疑似蓝耳病料中阳性率为73%,测得的序列之间ORF5的核苷酸相似性达80.3%~100.0%,其中所测的各个分支毒株与其所属分支的代表毒株NADC30、GM2和JXA1的核苷酸相似性分别为92.6%~93.9%、89.8%~93.0%和93.4%~99.3%,检测到新分支中新出现的毒株与JXA1的核苷酸相似性为91.0~93.0%。GP5氨基酸比对结果显示不同亚群GP5信号肽区、诱导表位、主要中和表位及高变区等功能区发生了显著变异。【结论】福建地区出现了PRRSV新分支,使福建PRRSV变异种类更加多样化,建议加强PRRSV流行及变异的监测。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 样品收集
  •   1.2 主要试剂
  •   1.3 引物设计与合成
  •   1.4 病毒总RNA的提取
  •   1.5 RT-PCR扩增
  •   1.6 ORF5基因的克隆和测序
  •   1.7 ORF5基因的进化树以及GP5蛋白的氨基酸序列分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 2017年福建地区PRRSV样品检测结果
  •   2.2 PRRSV GP5氨基酸序列分析
  •   2.3 PRRSV ORF5遗传进化分析和基因的相似性
  • 3 讨论与结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 韦应芳,冀池海,孙彦阔,韩晓亮,陈尧,张桂红

    关键词: 猪繁殖与呼吸道综合征,蓝耳病,分子流行病学,基因,遗传变异

    来源: 华南农业大学学报 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 农业科技,基础科学

    专业: 生物学,畜牧与动物医学

    单位: 国家生猪种业工程技术研究中心/广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室/华南农业大学兽医学院,江苏恒丰强生物技术有限公司

    基金: 国家重点研发计划项目(2018YFD0501200),国家生猪现代农业产业技术体系项目(CARS-35),国家自然科学基金(31272564)

    分类号: S852.651

    页码: 14-19

    总页数: 6

    文件大小: 1762K

    下载量: 124

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