应用CRISPR技术敲除MDA-MB-231细胞系的NODAL基因的研究

应用CRISPR技术敲除MDA-MB-231细胞系的NODAL基因的研究

论文摘要

NODAL(Nodal growth differentiation factor)是一种细胞因子,为研究其功能,需建立敲除NODAL基因的细胞系。构建了两种作用于不同靶位点的CRISPR/Cas9表达载体和一种打靶载体,并通过电转法导入三阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-231,经嘌呤霉素抗性筛选和挑单细胞克隆,再应用PCR和测序技术鉴定基因型,以及Western Blot检测蛋白表达。将等位基因同源重组鉴定为阳性的8个单细胞克隆再经非同源重组和大片段缺失基因型鉴定,仅一个单细胞克隆的靶位点发生移码突变,4个单细胞克隆的靶位点有大片段缺失发生,4个单细胞克隆的靶位点检测到野生型等位基因。蛋白表达检测结果显示,仅有2个单细胞克隆未检测到NODAL蛋白表达,3个单细胞克隆的NODAL蛋白表达降低,另外3个单细胞克隆的NODAL蛋白表达无明显变化。最终获得了基因型和蛋白表达鉴定为敲除NODAL基因的单细胞克隆,为进一步研究NODAL在乳腺癌细胞中的分子机制奠定了基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 材料
  •     1.1.1 主要试剂
  •     1.1.2 主要实验仪器
  •   1.2 方法
  •     1.2.1 敲除方案及Cas9/sgRNA质粒构建
  •     1.2.2 打靶载体构建
  •     1.2.3 电转及筛选
  •     1.2.4 混合基因型PCR鉴定及单细胞克隆挑选
  •     1.2.5 单细胞克隆基因型鉴定
  •       1.2.5. 1 等位基因同源重组PCR鉴定
  •       1.2.5. 2 等位基因移码突变PCR鉴定
  •       1.2.5. 3 等位基因大片段缺失PCR鉴定
  •     1.2.6 NODAL蛋白水平鉴定
  •     1.2.7 统计分析
  • 2 结果
  •   2.1 Cas9/sgRNA质粒构建及活性鉴定
  •   2.2 打靶载体构建
  •   2.3 基因型鉴定
  •     2.3.1 混合基因型鉴定
  •     2.3.2 等位基因同源重组基因型鉴定
  •     2.3.3 等位基因移码突变基因型鉴定
  •     2.3.4 等位基因大片段缺失基因型鉴定
  •   2.4 蛋白表达鉴定
  • 3 讨论
  • 4 结论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 李念峰,方天星,倪玉芳,曾凡才

    关键词: 乳腺癌,基因敲除,基因

    来源: 生物技术通报 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 生物学

    单位: 西南医科大学基础医学院生物化学与分子生物学实验室

    基金: 四川省科技厅-泸州市-泸州医学院联合基金(LY-100),四川省科技厅基金(2013SZZ001)

    分类号: Q78

    DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2019-0426

    页码: 240-250

    总页数: 11

    文件大小: 5963K

    下载量: 265

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