金鱼草AmDEFH28基因克隆和功能分析

金鱼草AmDEFH28基因克隆和功能分析

论文摘要

金鱼草是一种在研究植物叶序方面十分特殊的植物,其同一植株上有着不同的叶序形态,基部叶序以对生状态为主,中上部叶序主要为螺旋状互生。叶原基起源于植物顶端分生组织(SAM),因其在茎尖上的发生位置不同,从而决定了叶在茎上的排列(叶序)。MADS-box基因家族是一类十分重要的转录调控因子,对植物顶端分生组织(SAM)具有重要的影响。本研究以金鱼草品种“泛美夏粉”为试验材料,通过采用单酶切以及同源重组的方式构建了过量表达载体,并经农杆菌介导法成功将目的基因的过量表达载体转入拟南芥中,获得了多个株系,进行表型观察,并辅以生物信息学分析,从而探究MADS-box基因AmDEFH28的基因功能及对植物叶序的影响。1.试验根据课题组之前对金鱼草叶序转录组的数据分析,通过Blast软件搜索到目的基因AmDEFH28,设计引物,提取金鱼草总RNA后,经过RT-PCR方法克隆得到了目的基因AmDEFH28。并利用生物信息学对目的基因AmDEFH28进行分析,得到了全长759bp的CDS序列;目的基因AmDEFH28与PhFBP29相似度最高,相似度为85.77%;AmDEFH25基因所编码的蛋白质由252个氨基酸组成,分子式为C1271H2072N3840394S8,其不稳定指数为68.49,蛋白质性质较不稳定,亲水性-0.833,为亲水性蛋白质;不存在蛋白信号肽序列,没有剪切位点;共有5个潜在磷酸化位点;预测了目的基因的二级结构与三级结构。2.试验利用荧光定量PCR技术,对目的基因AmDEFH28在金鱼草中的相对表达量进行了分析,AmDEFH28基因在金鱼草生长周期内不同器官中都有表达,幼苗期基因表达量:根>茎>叶,成熟期基因表达量:叶>茎>花>根。3.试验利用pCAMIBA1301载体质粒,通过单酶切以及同源重组的方式构建了AmDEFH28的过量表达载体,将载体转入大肠杆菌中,并经电导法导入GV1301农杆菌中,将AmDEFH28的过量表达载体通过花序浸染法转入拟南芥中,并利用卡那霉素、庆大霉素、利福平与潮霉素B等抗生素逐步进行筛选,最终获得纯合子转基因拟南芥植株。4.试验通过图像以及显微成像技术对转基因拟南芥进行表型观察,利用哥伦比亚型(Columbia-0)野生拟南芥作为对照组,发现转基因拟南芥生长缓慢,植株矮小,叶片增多,叶片形状变化、大小变大,分枝增加、花芽分化和花序轴抽出推迟,叶序出现对生,花器官发育改变的表型。5.试验目的基因从金鱼草叶序转录组中获得,后续表型观察发现其转基因拟南芥出现了对生表型,表明目的基因AmDEFH28对植物产生对生叶序有一定影响。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • Abstract
  • 缩写和符号清单
  • 第一章 文献综述
  •   1.1 金鱼草
  •     1.1.1 金鱼草概况
  •     1.1.2 金鱼草研究进展
  •     1.1.3 金鱼草叶序
  •   1.2 植物叶序
  •     1.2.1 叶序概况
  •     1.2.2 叶序的生长发育以及调控
  •     1.2.3 叶序的研究进展
  •   1.3 叶原基
  •     1.3.1 叶原基概况
  •     1.3.2 叶原基生长发育
  •   1.4 MADS-box基因简介
  •     1.4.1 MADS-box基因概况
  •     1.4.2 MADS-box基因的分类、结构与功能
  •     1.4.3 MADS-box基因的研究进展
  • 第二章 引言
  •   2.1 研究内容
  •   2.2 研究目的与意义
  •   2.3 技术路线
  • 第三章 材料与方法
  •   3.1 试验材料
  •     3.1.1 栽培植株
  •     3.1.2 栽培基质
  •     3.1.3 试验载体与试验菌株
  •     3.1.4 试验试剂与酶
  •     3.1.5 试验所用仪器设备
  •     3.1.6 试验引物合成以及基因测序
  •   3.2 试验抗生素以及培养基
  •     3.2.1 试验用抗生素
  •     3.2.2 试验用培养基
  •   3.3 金鱼草总RNA提取
  •     3.3.1 总RNA提取
  •     3.3.2 RNA纯度和含量的检测
  •   3.4 反转录
  •   3.5 AmDEFH28基因的克隆
  •     3.5.1 AmDEFH28基因克隆
  •     3.5.2 琼脂糖凝胶电泳
  •     3.5.3 DNA凝胶回收
  •   3.6 AmDEFH28基因的时空表达
  •   3.7 AmDEFH28基因表达载体的构建与转化
  •     3.7.1 提取pCAMBIA1301质粒
  •     3.7.2 单酶切与同源重组
  •     3.7.3 转化大肠杆菌
  •     3.7.4 转化农杆菌
  •   3.8 转基因拟南芥的获得与鉴定
  •     3.8.1 花序浸染法转化拟南芥
  •     3.8.2 拟南芥抗性苗的筛选
  •     3.8.3 拟南芥阳性苗的鉴定
  •   3.9 转基因拟南芥的显微观察
  • 第四章 结果与分析
  •   4.1 目的基因AmDEFH28基因的克隆
  •     4.1.1 目的基因AmDEFH28基因的来源
  •     4.1.2 金鱼草幼芽总RNA的检测
  •     4.1.3 目的基因AmDEFH28基因的克隆
  •   4.2 AmDEFH28基因的生物信息学分析
  •     4.2.1 AmDEFH28基因编码的氨基酸序列的同源性分析
  •     4.2.2 AmDEFH28基因的进化树分析
  •     4.2.3 AmDEFH28基因所编码蛋白质的理化性质分析
  •     4.2.4 AmDEFH28基因所编码蛋白质的保守结构域分析
  •     4.2.5 AmDEFH28基因所编码蛋白质的亚细胞定位预测
  •     4.2.6 AmDEFH28基因所编码蛋白质的蛋白信号肽分析
  •     4.2.7 AmDEFH28基因所编码蛋白质的磷酸化位点分析
  •     4.2.8 AmDEFH28基因所编码蛋白质的二级结构预测
  •     4.2.9 AmDEFH28基因所编码蛋白质的三级结构预测
  •   4.3 AmDEFH28基因在金鱼草中的时空表达
  •   4.4 AmDEFH28基因的过量表达载体的构建及验证
  •   4.5 AmDEFH28基因的过量表达载体转化农杆菌及验证
  •   4.6 AmDEFH28基因的转基因拟南芥的获得与鉴定
  •   4.7 AmDEFH28基因的转基因拟南芥的荧光定量PCR验证
  •   4.8 AmDEFH28基因的转基因拟南芥的表型观察
  •     4.8.1 转基因拟南芥植株的整体长势
  •     4.8.2 转基因拟南芥植株的叶序
  •     4.8.3 转基因拟南芥植株的叶片
  •     4.8.4 转基因拟南芥植株的花与种荚
  • 第五章 讨论与结论
  •   5.1 讨论
  •   5.2 结论
  • 参考文献
  • 附录 试验所用软件程序
  • 作者简介
  • 文章来源

    类型: 硕士论文

    作者: 王瑞生

    导师: 王冬良

    关键词: 金鱼草,植物叶序,基因家族

    来源: 安徽农业大学

    年度: 2019

    分类: 基础科学

    专业: 生物学,生物学

    单位: 安徽农业大学

    分类号: Q943.2

    DOI: 10.26919/d.cnki.gannu.2019.000657

    总页数: 67

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