檀香SaRbohA基因的克隆与吸器诱导因子响应分析

檀香SaRbohA基因的克隆与吸器诱导因子响应分析

论文摘要

植物Rboh基因家族编码产生活性氧(ROS)的NADPH氧化酶。了解半寄生植物檀香(Santalum album Linn.)基因Rboh相关信息和表达特性,可为研究檀香SaRbohA基因通过活性氧信号(ROS)调控吸器发育的响应提供理论依据。该研究以全长转录组测序为基础,通过序列拼接设计合成基因特异引物,从根中克隆获得了1个檀香respiratory burst oxidase homolog(Rboh)基因cDNA全长,命名为SaRbohA。序列分析表明,该基因cDNA全长2 790 bp,编码929个氨基酸,分子量105.37 kD,理论等电点9.13,预测亚细胞定位于细胞膜。结构预测表明,SaRbohA具有6个跨膜结构域,在膜内侧的C端包含典型的NADPH结合结构域和FAD结合结构域, N端含有两个EF手性结构。序列比对分析表明,檀香SaRbohA与苹果MdRboh同源进化关系较近,相似度为63.65%。组织特异性表达分析表明,SaRbohA基因在茎中表达量最低,幼叶和茎尖中表达量较高,而在根中表达量最高。采用2, 6-二甲氧基对苯醌(寄生植物吸器诱导因子)处理,可以强烈诱导檀香SaRbohA基因的响应并伴随大量活性氧信号。研究推测,SaRbohA基因的在ROS信号介导的檀香吸器发育过程中起重要作用,且受化学诱导因子调控表达。

论文目录

  • 1 材料和方法
  •   1.1 材 料
  •   1.2 SaRbohA基因克隆
  •     1.2.1 总RNA提取、cDNA合成与基因克隆cDNA
  •     1.2.2 SaRbohA基因生物信息学分析
  •     1.2.3 SaRbohA基因组织表达特异性分析
  •     1.2.4 H2DCFDA染色
  •     1.2.5 SaRbohA基因对吸器诱导因子的响应分析
  • 2 结果与分析
  •   2.1 SaRbohA基因克隆
  •   2.2 SaRbohA基因的生物信息学分析
  •   2.3 SaRbohA基因组织特异性分析
  •   2.4 ROS信号在根中分布和SaRbohA基因对吸器诱导因子的响应分析
  • 3 讨 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 孟森,马海宾,王胜坤,李振双,赵忠,陆俊锟

    关键词: 寄生植物,檀香,基因克隆,活性氧

    来源: 西北植物学报 2019年12期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,农业科技

    专业: 林业

    单位: 中国林业科学研究院热带林业研究所/国家林业和草原局热带林业研究重点实验室,西北农林科技大学林学院

    基金: 中国林科院基本科研业务费(CAFYBB2017SY020),国家自然科学基金(31670636,31722012,31901304),广东省自然科学基金(2019A1515011595)

    分类号: S792.99

    页码: 2132-2137

    总页数: 6

    文件大小: 2200K

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