太子参SnRK2I基因的克隆及在水分胁迫条件下的响应

太子参SnRK2I基因的克隆及在水分胁迫条件下的响应

论文摘要

目的:获取太子参蔗糖非酵解型蛋白激酶2(SnRK2)基因,分析该基因在水分胁迫条件下的响应情况。方法:基于对SnRK2基因的同源性及太子参转录组数据库的分析,以不同水分胁迫处理的太子参鲜品为材料,利用基因克隆技术克隆得到太子参SnRK2基因序列,采用实时荧光定量PCR技术分析该基因与水分胁迫的相关性。结果:从太子参中克隆得到1条PhSnRK2I基因,cDNA全长为1 261 bp,编码305个氨基酸,分子量为47.27 kDa。该蛋白具有与SnRK2家族相似的ATP结合位点和Ser/Thr激酶活化环。实时荧光定量PCR分析结果表明,PhSnRK2I在土壤相对含水量为86%和44%时表达量较高。结论:成功克隆得到太子参PhSnRK2I基因序列,分析结果表明PhSnRK2I在中度水分胁迫下响应最积极,在太子参水分胁迫信号转导中发挥着重要作用。该研究可为进一步研究太子参PhSnRK2I基因在水分胁迫响应过程中的调控机理研究提供实验基础。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 仪器与试剂
  •   1.2 材料和胁迫处理
  •   1.3 方法
  •     1.3.1 太子参总RNA的提取及反转录合成第一链cDNA:
  •     1.3.2 太子参SnRK2I基因的克隆:
  •     1.3.3 太子参SnRK2I基因的生物信息学分析:
  •     1.3.4 太子参SnRK2I基因的表达分析:
  • 2 结果与分析
  •   2.1 太子参SnRK2I基因的克隆
  •   2.2 太子参phSnRK2I基因的生物信息学分析
  •     2.2.1 PhSnRK2I一级结构预测:
  •     2.2.2 PhSnRK2I二级结构预测:
  •     2.2.3 PhSnRK2I三级结构预测:
  •     2.2.4 PhSnRK2I进化分析:
  •   2.3 PhSnRK2I表达分析
  • 3 讨论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 毕艳,周涛,韦德群,郑伟,徐荣,江维克

    关键词: 太子参,水分胁迫,基因家族,生物信息学分析,表达分析

    来源: 中药材 2019年05期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,农业科技

    专业: 农作物

    单位: 贵州中医药大学

    基金: 国家自然科学基金(81460579),现代农业产业技术体系建设专项(CARS-21),贵州省国内一流建设学科项目(GNYL[2017]008号),贵州教育厅创新群体重大研究项目(黔教合KY字[2018]022)

    分类号: S567.53

    DOI: 10.13863/j.issn1001-4454.2019.05.008

    页码: 985-991

    总页数: 7

    文件大小: 5078K

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