MCR-ALS结合分子对接研究隐色孔雀石绿与BSA的作用过程

MCR-ALS结合分子对接研究隐色孔雀石绿与BSA的作用过程

论文摘要

孔雀石绿(LMG)在治理鱼卵中霉菌和杀灭鱼体寄生虫等方面的效果显著,广泛应用于水产运输和养殖。孔雀石绿进入动物机体后,通过生物转化代谢为脂溶性的隐色孔雀石绿(LMG), LMG的毒性超过MG; LMG能快速在组织中蓄积,具有致癌、致畸、致突变等毒副作用。白蛋白可与多种内源和外源化合物结合,是血浆中含量最丰富的载体蛋白,也是药物发挥作用的重要载体和靶标。模拟pH 7.4的生理条件,通过荧光光谱和圆二色谱法(CD)采集两种不同滴加方式的LMG与牛血清白蛋白(BSA)动态作用过程中的多维数据,并应用化学计量学多元曲线分辨-交替最小二乘法(MCR-ALS)对多维波谱数据进行解析和描述,从重叠严重的光谱数据中同时得到作用体系的定量和定性信息。从解析得到的浓度趋势图中,说明体系在LMG∶BSA=2∶1时达到动态平衡,并可确认复合物LMG2-BSA的生成;解析得到的与所测量的BSA荧光和CD图符合,印证由MCR-ALS获得的浓度趋势图的可靠性和正确性;通常由重叠光谱中无法辨别的LMG2-BSA复合物荧光光谱和CD谱图也可由数学解析获得,进一步印证了复合物的存在。原子力显微镜(AFM)测量结果表明BSA与LMG结合后, BSA的形貌发生改变,表面粗糙度(RMS)由(1.24±0.28) nm增至(13.47±0.53) nm;同时由CD实验结果可知LMG与BSA作用达到平衡时,α-螺旋结构的含量从46.5%降低到42.3%,推测是BSA所处微环境和构象发生变化所致。荧光探针实验发现经典siteⅠ标记物华法林加入后, LMG-BSA的猝灭常数由2.65×106L·mol-1降低为1.88×106L·mol-1,但加入siteⅡ标记物布洛芬后, LMG-BSA的猝灭常数变化不明显,由此推断LMG可能结合在蛋白质的亚域ⅡA,即siteⅠ位。分子对接证实BSA的Ⅰ位有足够的空间容纳LMG,且LMG与BSA之间的主要作用是疏水作用力。该研究从分子水平了解LMG与生物大分子的作用机制,并为LMG的毒副作用研究提供重要的信息。

论文目录

  • 引 言
  • 1 实验部分
  •   1.1 试剂和仪器
  •   1.2 步骤
  •   1.3 扩展矩阵数据的构建
  •   1.4 化学计量学方法: 多元曲线分辨-交替最小二乘法 (MCR-ALS)
  •   1.5 分子对接
  • 2 结果与讨论
  •   2.1 MCR-ALS解析
  •   2.2 AFM和CD研究LMG对BSA构象的影响
  •   2.3 探针实验确认LMG在BSA上的结合位点
  •   2.4 分子对接
  • 3 结 论
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 张秋兰,谢立昕,杨林慧,庹浔,倪永年

    关键词: 光谱法,分子对接,隐色孔雀石绿,牛血清白蛋白,作用过程

    来源: 光谱学与光谱分析 2019年03期

    年度: 2019

    分类: 基础科学,工程科技Ⅰ辑,医药卫生科技

    专业: 化学,药学

    单位: 南昌大学食品科学与技术国家重点实验室,南昌大学化学系,南昌大学药学院

    基金: 国家自然科学基金项目(21665017),南昌大学食品科学与技术国家重点实验室基金项目(SKLF-KF-201606和SKLF-ZZA-201612)资助

    分类号: R99;O657.3

    页码: 851-856

    总页数: 6

    文件大小: 1311K

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