基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定与系统进化分析

基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定与系统进化分析

论文摘要

目的:建立伯克霍尔德菌属典型菌株DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因序列鉴定方法,为该菌属污染物的鉴定和分类提供研究思路和方法依据。方法:选择伯克霍尔德菌属内的典型菌株,以gyrB基因为研究靶点,设计引物,特异性扩增gyrB基因片段,测定核酸序列,并进行聚类比对分析。结果:伯克霍尔德菌属内的典型菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定。结论:本文建立了基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定方法,菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定,为该菌属污染物的鉴定与风险排查提供方法依据。

论文目录

  • 1 材料与方法
  •   1.1 试验菌株
  •   1.2 主要仪器与试剂
  •   1.3 伯克霍尔德菌gyrB基因序列片段扩增
  •     1.3.1 PCR扩增引物
  •     1.3.2 PCR扩增体系
  •     1.3.3 PCR反应条件
  •   1.4 核酸测序鉴定
  •   1.5 聚类分析
  • 2 实验结果
  •   2.1 伯克霍尔德菌属菌株遗传背景确认
  •   2.2 伯克霍尔德菌属gyrB基因序列鉴定与系统进化分析
  • 3 讨论
  •   3.1 伯克霍尔德菌属内菌株的鉴定与系统进化地位仍在研究
  •   3.2 基于gryB基因的特征核酸序列适用于伯克霍尔德菌“属”内常见“种”的鉴定
  • 文章来源

    类型: 期刊论文

    作者: 冯震,杨燕,张宁,蒋波,李芳,秦峰,杨美成

    关键词: 伯克霍尔德菌,菌种鉴定,促旋酶亚基基因,特征序列,系统发育分析

    来源: 药物分析杂志 2019年11期

    年度: 2019

    分类: 医药卫生科技,工程科技Ⅰ辑

    专业: 有机化工

    单位: 上海市食品药品检验所国家药品监督管理局药品微生物检测技术重点实验室

    基金: 国家重点研发计划资助项目(编号2018YFC1603900)

    分类号: TQ460.72

    DOI: 10.16155/j.0254-1793.2019.11.03

    页码: 1940-1944

    总页数: 5

    文件大小: 1661K

    下载量: 114

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