论文摘要
目的利用生物信息学分析胰腺癌发生、发展的关键基因,为胰腺癌的早期诊断、预后评估及靶向治疗提供理论依据。方法从GEO数据库中获取GSE15471基因芯片数据集,在线分析工具GEO2R筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行GO、KEGG富集分析和蛋白互作网络分析,利用Cytoscape软件的cyto Hubba插件筛选出关键基因,通过GEPIA数据库对关键基因再次验证。结果从GSE15471基因芯片中共筛选出267个显著差异表达基因,其中上调基因232个,下调基因35个。富集分析显示差异表达基因主要涉及细胞黏附、PI3K-Akt信号通路、蛋白水解、炎性反应、胶原分解代谢、免疫反应等。通过蛋白互作网络筛选出11个关键基因,下调基因ALB、EGF,上调基因MMP2、CXCL8、FN1、COL1A1、SPP1、MMP1、ITGA2、COL3A1、CRP。GEPIA数据库中关键基因表达情况与基因芯片分析结果一致,生存分析显示胰腺癌患者总生存时间与MMP1、ITGA2基因表达高低相关。结论生物信息学筛选出的11个关键基因在胰腺癌的发生、发展中有重要作用,是潜在的胰腺癌特异肿瘤分子学标志物和靶向治疗新位点。
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文章来源
类型: 期刊论文
作者: 黎越,林丹丹,何晓琴,徐细明
关键词: 生物信息学,胰腺癌,关键基因,肿瘤分子标志物,靶向治疗
来源: 医学研究杂志 2019年10期
年度: 2019
分类: 医药卫生科技
专业: 肿瘤学
单位: 武汉大学人民医院肿瘤中心
基金: 国家自然科学基金资助项目(31601131)
分类号: R735.9
页码: 33-37
总页数: 5
文件大小: 1626K
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